Wikoleculares - Contribuições do(a) usuário(a) [pt-br]

Gilberto de Mello Guerra Junior

2007-08-10T21:59:52Z

Sonic Orochi: conserto e concerto... que dilema! (pelo visto, o critério de saber português para entrar no CM continua o mesmo...)

Suas raízes estão na [http://www.sbgf.org.br/geofisica/geofisica.html Geofísica], ministrado no Instituto de Astronomia, Geofísica e Ciências Atmosféricas - [http://www.iag.usp.br IAG]. Geoque? Esqueça isso!
Técnico em [http://www.cefetsp.br/cursos/Informatica_sede.html Informática] pelo [http://www.cefetsp.br/home.html CEFET/ETFSP], brincou um pouco na [http://www.obm.org.br/ OBM] e também nas aulas de preparação do [http://www.colegioetapa.com.br/ ETAPA], onde teve a oportunidade de estudar no [http://www.mit.edu/ MIT] - até ser convencido por um [http://www.prandiano.com.br/html/fr_impren.htm professor] nacionalista do [http://www.ita.br ITA] a estudar na [http://www.usp.br USP].

Nos últimos anos se aventurou nalgumas atividades:

- diretor de marketing da [http://www.iag.usp.br/ej IAG Jr.];

- professor particular de Física e Matemática particulares para EM e Fundamental;

- professor particular de Cálculo para universitários (apesar de ter''' reprovado 3 vezes''' essa disciplina e entrar no CM sem a aprovação na mesma);

- professor de Biofísica para professor universitário (E que aventura!!);

- Monitor de [http://sistemas.usp.br/jupiterweb/obterDisciplina?sgldis=MAC0115&nomdis= MAC0115 - Introdução à Computação para Ciências Exatas e Tecnologia];

- dentre outras peripécias, como participar do [http://www.balonismonoar.com.br/OpenBrasil/index.asp 1ºOpen Brasil de Balonismo]!

Tentou entrar no CM em 2005 na T15, mas não obteve êxito - O que é muito bom, conhecendo o histórico e reputação da T15. Mas a verdade é que o seu futuro o havia preparado para a Profética Turma 17, fazendo com que saia da USP no semestre de número 17.

Veio de escola pública estadual, onde ficou por 3 anos aprendendo, em Física, cinemática e, em Inglês, verbo To Be, sem precisar citar a qualidade das outras disciplinas. Daí sua dificuldade nas ciências. Apesar disso pretende superar a falta de conhecimento presente em seus estudos. Daí também nasceu o desejo de entrar no CM, onde espera - como todos - ser aprovado. Deseja, futuramente, trabalhar no acesso à ciência e seu aprendizado no Ensino Médio.

'''O que já fez no CM?'''

'''*''' Consertou o trinco da porta da Sala 1, de modo que não ficamos mais presos nela como numa das aulas de Química;

'''*''' Teve a coragem (achei "coragem" mais honroso que "cara-de-pau" ou "ousadia") de conversar com o [http://www.iq.usp.br/wwwdocentes/bayardo/ Bayardo B. Torres] pedindo exemplares de seu livro [http://allchemy.iq.usp.br/estruturando/novidade/livro-txt/livro41.html "Bioquímica Básica"] para a [[Biblioteca]] do CM.

'''*''' Fica mandando links e figuras interessantes - ou não - na [https://listas.cecm.usp.br/mailman/listinfo/t17 Lista da T17]

Veja [http://www.orkut.com/Profile.aspx?uid=14851592438474302064 Perfil no Orkut];

MSN: gilberto.guerra@usp.br

[[Categoria: T17]]
[[Categoria: Alunos do CM]]

Discussão:Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro

2007-01-23T21:33:56Z

Sonic Orochi:

olha o q eu achei no orkut
[http://www.orkut.com/CommMsgs.aspx?cmm=14943788&tid=2506159863000285426&start=1]

O link nem funcionou mas a comu é interessante... ahuahau flww

Turma 15

2006-12-19T19:54:31Z

Sonic Orochi: /* Histórico */

A '''Turma 15''' ou '''T15''' é a 15ª turma do [[Curso de Ciências Moleculares]] ([[CCM]]), tem uma predominância de originários das exatas e de homens e uma porção significativa de orientais, e é uma das poucas turmas onde um aluno entrou no meio do semestre (o Ronaldo da [[Turma_14|T14]], devido a problemas médicos).

== Histórico ==

A turma 15 começou no 2º semestre de 2005 num [[processo seletivo]] que resultou em 22 aprovados dos quais 20 se matricularam. Dois desistiram logo após o início das aulas, o Caio do [[Direito]] e o André do [[IME]], resultando num saldo líquido de 18 [[moleculento|moleculentos]].

A T15 era originalmente formada por:

* [[Alexandre Lin]] ("[[Boo]]", vindo da T14 e antes da [[farmácia]])
* [[Bruno Rocha Barreira]] ("[[Sombra]]", da [[Poli]])
* [[Carlos Alberto de M. Marin]] ([[IME]])
* [[Daizo Harada]] ([[IB|Biologia]])
* [[Daniel Rodrigo I. Miyashiro]] ([[Poli]])
* [[Felipe (Direito)|Felipe A. Nunes Ferraz]] (diretamente do [[Direito|largo São Francisco]])
* [[Fernando Henry Meirelles]] ("[[Cabelo]]", [[IME]])
* [[Fernando W. S. Rossine]] ("[[Pizza]]", [[Instituto de Biociências|Biologia]])
* [[Gustavo Akio T. Sacomoto]] ([[Instituto de Física|Física]])
* [[Layra Malacrida Artilian]] ([[Instituto de Química|Química]])
* [[Leo (T15)|Leo Heikiti Maeda Arruda]] ([[IME]])
* [[Luis Fernando Ragognette]] ([[IME]])
* [[Luiza Assis Pereira]] ([[Instituto de Química|Química]])
* [[Matheus C. de Oliveira]] ([[Instituto de Física|Física]])
* [[Rafael (T15)|Rafael Prado Proença]] (Informática Biomédica de Ribeirão Preto!)
* [[Renan Yuzo Shimabucuro]] ([[Instituto de Biociências|Biologia]])
* [[Fena|Renato S. Pereira Coelho]] ("[[Fena]]", Engenharia de [[Campi da USP|São Carlos]])
* [[Saulo Henrique P. de Oliveira]] ([[IME]])

como é evidente, a turma apresentava tendência nítida para exatas (12 de exatas(incluindo química) contra 4 de biológicas(incluindo farmácia), 1 de humanas e 1 de informática biomédica) e mais nítida ainda a tendência para o cromossomo Y [referência?].

A turma foi, aos poucos, perdendo alguns de seus membros: o [[Cabelo]], a [[Layra]] e o [[Felipe (Direito)|Felipe]]. Seres que descobriram que a coisa não valia tanto a pena assim. Mas os outros têm maior poder de auto-engano e persistiram bravamente. No primeiro semestre de 2006 a turma ganhou mais um integrante: o Ronaldo da [[T14]], que retornou à ativa após ter se afastado por problemas de saúde. No meio de 2006 mais perdas: o retorno do [[Daizo]] à [[Biologia]] e da saída do [[Renan]] para prestar [[Administração]].

O segundo semestre de 2006 foi marcado pelo desânimo e conseqüente baixa presença dos alunos nas aulas, pela total falta de entendimento nas aulas do professor [[Koiti]], e pelas últimas semanas, chamadas de [[Semanas do Apocalipse]], nas quais havia provas praticamente todos os dias. A última semana do apocalipse finalmente terminou, mas não sem baixas: o [[Boo]] foi para o Alasca, e o [[Daniel]] e o [[Sombra]] foram, depois do [[Massacre do Bambu]], de volta para a [[POLI]].

Ah, e desde 2005 ela é também conhecida como a melhor turma do mundo!

== Integrantes ==

Atualmente a T15 é composta por 10 moleculentos:

* [[Carlos Alberto de M. Marin]]
* [[Fernando W. S. Rossine]] ("[[Pizza]]")
* [[Gustavo Akio T. Sacomoto]] ("[[Japonês]]")
* [[Leo (T15)|Leo Heikiti Maeda Arruda]]
* [[Luis Fernando Ragognette]]
* [[Matheus Cafalchio]]
* [[Rafael (T15)|Rafael Prado Proença]]
* [[Fena|Renato S. Pereira Coelho]] ("[[Fena]]")
* [[Ronaldo da Silva Alves Batista]]
* [[Saulo Henrique P. de Oliveira]]

== Professores do Ciclo Básico (até o momento) ==

* 1º semestre:
**[[Biologia I]] : professor [[Etelvino José Henriques Bechara]].
**[[Física I]] : professora [[Alinka Lépine-Szily]].
**[[Matemática I]] : professor [[Manuel Valentim de Pera Garcia]].
**[[Química I]] : professor [[Roberto Manuel Torresi]].
**[[Computação I]] : professor [[Alair Pereira do Lago]].

* 2º semestre:
**[[Biologia II]] : professor [[Emer Suavinho Ferro]], professora [[Shirley Schreier]], professora [[Regina Pekelmann Markus]].
**[[Física II]] : professora [[Alinka Lépine-Szily]].
**[[Matemática II]] : professor [[Manuel Valentim de Pera Garcia]].
**[[Química II]] : professor [[Paulo Sérgio Santos]].
**[[Computação II]] : professor [[Alair Pereira do Lago]].

* 3º semestre:
**[[Biologia III]] : professor [[Carlos Eduardo Winter]].
**[[Laboratório de Biologia Molecular]] : professora [[Lucile Maria Floeter-Winter]].
**[[Física III]] : professor [[Henrique Fleming]].
**[[Matemática III]] : professor [[Fábio Armando Tal]].
**[[Química III]] : professor [[Koiti Araki]].
**[[Computação III]] : professor [[Saulo Rabello Maciel de Barros]].

== Fama ==

Apesar dos boatos de isso ser uma coisa normal que acontece todo ano, é fato que a T15 teve, desde a primeira reunião com os professores, diversas reclamações e foi chamada diversas vezes de '''''a pior turma que já passou pelo CM'''''.

== Habilidades artísticas da T15 ==

Embora não reconhecida, a [[T15]] têm grandes artistas, veja uma pequena amostra do seu talento:
{|
|-
| [[Image:Victis Latrum.jpg|none|thumb|A primeira grande obra de arte by Luiza e Pizza (T15)]]
| [[Image:A_Celula_2006.jpg|none|thumb|"A célula" by T15]]
|}
E além de fazer pinturas, há também grandes poetas como o [[Fena]].

''"Filomena,''

''A nova garota de Ipanema,''

''Com sua beleza extrema,''

''Tão Pequena e tão amena!"''

'' por Fena''

== Blog ==

''Para obter mais detalhes, veja [[Blog da T15]]''

Desde o dia 13 de setembro de 2005 a turma mantém um blog [http://t15ccm.blogspot.com/], cujos anúncios, sonham os participantes, um dia servirão para pagar um churrasco ou coisa do tipo (é preciso acumular US$100,00 para receber a grana).

== Citações ==
* [[Boo]]
**''"LUIIIS!"''
**''"Vocês são uns bichas... não gostam de experimentar coisas novas..."''
* [[Sombra]]
**''"Isso é uma safadêza..."''
* [[Carlos]]
**''"'''30'''?...quanto é...'''30'''?...é '''30''' mesmo?"''
* [[Daizo]]
**''"Cloroplaasto!?"''
**''"Ah nãããão!"''
* [[Daniel]]
**''"Páracomisso!"''
**''"Saidaqui!"''
* [[Pizza]]
**''"Ah não Lucile! Você sabe que vem de '''fora'''!"'' (após Lucile ter dito que a felicidade vem de '''dentro''')
* [[Gustavo]]
* [[Leo (T15)|Leo]]
* [[Luis]]
* [[Luiza]]
* [[Matheus]]
* [[Rafael]]
**''"Eu naum sou caipira!! Eu naum sou de ribeiraum! Sou de Aparecida!"''
**''"Se as minhas piadas não fossem o ínfimo de todas as piadas, eu diria que esta piada é pior que a minha."''
* [[Renan]]
**''"Num xei..."'' (jeitinho meigo)
**''"Pula pirata!"''
* [[Fena]]
* [[Ronaldo]]
* [[Saulo]]
**''"Lógico que casca de banana não escorrega!"'' (momentos depois, Saulo mudou de idéia)
**''"Úúúú!! [[X-Crusp]]!!"''

== Fotos ==

[[Imagem:Turma_15.jpg|none|frame|A T15 em 2005: Parte de cima, da esquerda para a direita: Luiza, Felipe, profa. Alinka, Pizza, Leo, Carlos. Na parte de baixo: Luis, Gustavo, Saulo, Cabelo.]]

[[Imagem:T15 Prova a fantasia.jpg|none|thumb|600px|Prova à fantasia do Mané: Pizza, Gustavo, Rafael, Felipe, Luiza e Saulo (agachado).]]

[[Image:T15_Bio_II.JPG|none|thumb|600px|T15 Após fazer "[[A célula]]"; Em pé: Daizo, Carlos, Sombra, Luis, Daniel, Saulo, Pizza, Fena. Sentados: Leo, Matheus, Gustavo, Rafael, Renan, Boo e Luiza]]

== Ver também ==

* [[Blog da T15]]

== Links ==

* [http://www.t15ccm.blogspot.com/ Blog da T15]

[[Categoria:T15]]
[[Categoria:Turmas do CM]]

Turma 15

2006-12-19T19:50:51Z

Sonic Orochi: /* Integrantes */

A '''Turma 15''' ou '''T15''' é a 15ª turma do [[Curso de Ciências Moleculares]] ([[CCM]]), tem uma predominância de originários das exatas e de homens e uma porção significativa de orientais, e é uma das poucas turmas onde um aluno entrou no meio do semestre (o Ronaldo da [[Turma_14|T14]], devido a problemas médicos).

== Histórico ==

A turma 15 começou no 2º semestre de 2005 num [[processo seletivo]] que resultou em 22 aprovados dos quais 20 se matricularam. Dois desistiram logo após o início das aulas, o Caio do [[Direito]] e o André do [[IME]], resultando num saldo líquido de 18 [[moleculento|moleculentos]].

A T15 era originalmente formada por:

* [[Alexandre Lin]] ("[[Boo]]", vindo da T14 e antes da [[farmácia]])
* [[Bruno Rocha Barreira]] ("[[Sombra]]", da [[Poli]])
* [[Carlos Alberto de M. Marin]] ([[IME]])
* [[Daizo Harada]] ([[IB|Biologia]])
* [[Daniel Rodrigo I. Miyashiro]] ([[Poli]])
* [[Felipe (Direito)|Felipe A. Nunes Ferraz]] (diretamente do [[Direito|largo São Francisco]])
* [[Fernando Henry Meirelles]] ("[[Cabelo]]", [[IME]])
* [[Fernando W. S. Rossine]] ("[[Pizza]]", [[Instituto de Biociências|Biologia]])
* [[Gustavo Akio T. Sacomoto]] ([[Instituto de Física|Física]])
* [[Layra Malacrida Artilian]] ([[Instituto de Química|Química]])
* [[Leo (T15)|Leo Heikiti Maeda Arruda]] ([[IME]])
* [[Luis Fernando Ragognette]] ([[IME]])
* [[Luiza Assis Pereira]] ([[Instituto de Química|Química]])
* [[Matheus C. de Oliveira]] ([[Instituto de Física|Física]])
* [[Rafael (T15)|Rafael Prado Proença]] (Informática Biomédica de Ribeirão Preto!)
* [[Renan Yuzo Shimabucuro]] ([[Instituto de Biociências|Biologia]])
* [[Fena|Renato S. Pereira Coelho]] ("[[Fena]]", Engenharia de [[Campi da USP|São Carlos]])
* [[Saulo Henrique P. de Oliveira]] ([[IME]])

como é evidente, a turma apresentava tendência nítida para exatas (12 de exatas(incluindo química) contra 4 de biológicas(incluindo farmácia), 1 de humanas e 1 de informática biomédica) e mais nítida ainda a tendência para o cromossomo Y [referência?].

A turma foi, aos poucos, perdendo alguns de seus membros: o [[Cabelo]], a [[Layra]] e o [[Felipe (Direito)|Felipe]]. Seres que descobriram que a coisa não valia tanto a pena assim. Mas os outros têm maior poder de auto-engano e persistiram bravamente. No primeiro semestre de 2006 a turma ganhou mais um integrante: o Ronaldo da [[T14]], que retornou à ativa após ter se afastado por problemas de saúde. No meio de 2006 mais perdas: o retorno do [[Daizo]] à [[Biologia]] e da saída do [[Renan]] para prestar [[Administração]].

O segundo semestre de 2006 foi marcada pelo desânimo e consequente baixa presença dos alunos nas aulas, pela total falta de entendimento nas aulas do professor [[Koiti]], e pelas últimas semanas, chamadas de semanas do apocalipse, nas quais havia provas praticamente todos os dias. A última semana do apocalipse ainda não terminou, e já houve baixas: o [[Boo]] já preferiu ir para o Alasca e muitos estão cotados para a [[ceifadora]].

Ah, e desde 2005 ela é também conhecida como a melhor turma do mundo!

== Integrantes ==

Atualmente a T15 é composta por 10 moleculentos:

* [[Carlos Alberto de M. Marin]]
* [[Fernando W. S. Rossine]] ("[[Pizza]]")
* [[Gustavo Akio T. Sacomoto]] ("[[Japonês]]")
* [[Leo (T15)|Leo Heikiti Maeda Arruda]]
* [[Luis Fernando Ragognette]]
* [[Matheus Cafalchio]]
* [[Rafael (T15)|Rafael Prado Proença]]
* [[Fena|Renato S. Pereira Coelho]] ("[[Fena]]")
* [[Ronaldo da Silva Alves Batista]]
* [[Saulo Henrique P. de Oliveira]]

== Professores do Ciclo Básico (até o momento) ==

* 1º semestre:
**[[Biologia I]] : professor [[Etelvino José Henriques Bechara]].
**[[Física I]] : professora [[Alinka Lépine-Szily]].
**[[Matemática I]] : professor [[Manuel Valentim de Pera Garcia]].
**[[Química I]] : professor [[Roberto Manuel Torresi]].
**[[Computação I]] : professor [[Alair Pereira do Lago]].

* 2º semestre:
**[[Biologia II]] : professor [[Emer Suavinho Ferro]], professora [[Shirley Schreier]], professora [[Regina Pekelmann Markus]].
**[[Física II]] : professora [[Alinka Lépine-Szily]].
**[[Matemática II]] : professor [[Manuel Valentim de Pera Garcia]].
**[[Química II]] : professor [[Paulo Sérgio Santos]].
**[[Computação II]] : professor [[Alair Pereira do Lago]].

* 3º semestre:
**[[Biologia III]] : professor [[Carlos Eduardo Winter]].
**[[Laboratório de Biologia Molecular]] : professora [[Lucile Maria Floeter-Winter]].
**[[Física III]] : professor [[Henrique Fleming]].
**[[Matemática III]] : professor [[Fábio Armando Tal]].
**[[Química III]] : professor [[Koiti Araki]].
**[[Computação III]] : professor [[Saulo Rabello Maciel de Barros]].

== Fama ==

Apesar dos boatos de isso ser uma coisa normal que acontece todo ano, é fato que a T15 teve, desde a primeira reunião com os professores, diversas reclamações e foi chamada diversas vezes de '''''a pior turma que já passou pelo CM'''''.

== Habilidades artísticas da T15 ==

Embora não reconhecida, a [[T15]] têm grandes artistas, veja uma pequena amostra do seu talento:
{|
|-
| [[Image:Victis Latrum.jpg|none|thumb|A primeira grande obra de arte by Luiza e Pizza (T15)]]
| [[Image:A_Celula_2006.jpg|none|thumb|"A célula" by T15]]
|}
E além de fazer pinturas, há também grandes poetas como o [[Fena]].

''"Filomena,''

''A nova garota de Ipanema,''

''Com sua beleza extrema,''

''Tão Pequena e tão amena!"''

'' por Fena''

== Blog ==

''Para obter mais detalhes, veja [[Blog da T15]]''

Desde o dia 13 de setembro de 2005 a turma mantém um blog [http://t15ccm.blogspot.com/], cujos anúncios, sonham os participantes, um dia servirão para pagar um churrasco ou coisa do tipo (é preciso acumular US$100,00 para receber a grana).

== Citações ==
* [[Boo]]
**''"LUIIIS!"''
**''"Vocês são uns bichas... não gostam de experimentar coisas novas..."''
* [[Sombra]]
**''"Isso é uma safadêza..."''
* [[Carlos]]
**''"'''30'''?...quanto é...'''30'''?...é '''30''' mesmo?"''
* [[Daizo]]
**''"Cloroplaasto!?"''
**''"Ah nãããão!"''
* [[Daniel]]
**''"Páracomisso!"''
**''"Saidaqui!"''
* [[Pizza]]
**''"Ah não Lucile! Você sabe que vem de '''fora'''!"'' (após Lucile ter dito que a felicidade vem de '''dentro''')
* [[Gustavo]]
* [[Leo (T15)|Leo]]
* [[Luis]]
* [[Luiza]]
* [[Matheus]]
* [[Rafael]]
**''"Eu naum sou caipira!! Eu naum sou de ribeiraum! Sou de Aparecida!"''
**''"Se as minhas piadas não fossem o ínfimo de todas as piadas, eu diria que esta piada é pior que a minha."''
* [[Renan]]
**''"Num xei..."'' (jeitinho meigo)
**''"Pula pirata!"''
* [[Fena]]
* [[Ronaldo]]
* [[Saulo]]
**''"Lógico que casca de banana não escorrega!"'' (momentos depois, Saulo mudou de idéia)
**''"Úúúú!! [[X-Crusp]]!!"''

== Fotos ==

[[Imagem:Turma_15.jpg|none|frame|A T15 em 2005: Parte de cima, da esquerda para a direita: Luiza, Felipe, profa. Alinka, Pizza, Leo, Carlos. Na parte de baixo: Luis, Gustavo, Saulo, Cabelo.]]

[[Imagem:T15 Prova a fantasia.jpg|none|thumb|600px|Prova à fantasia do Mané: Pizza, Gustavo, Rafael, Felipe, Luiza e Saulo (agachado).]]

[[Image:T15_Bio_II.JPG|none|thumb|600px|T15 Após fazer "[[A célula]]"; Em pé: Daizo, Carlos, Sombra, Luis, Daniel, Saulo, Pizza, Fena. Sentados: Leo, Matheus, Gustavo, Rafael, Renan, Boo e Luiza]]

== Ver também ==

* [[Blog da T15]]

== Links ==

* [http://www.t15ccm.blogspot.com/ Blog da T15]

[[Categoria:T15]]
[[Categoria:Turmas do CM]]

Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro

2006-12-19T19:49:48Z

Sonic Orochi:

{{Usuário|Sonic Orochi}}

'''Daniel''' é ex-integrante da [[T15]]. [[Politécnico]], considera a [[Poli]] um lugar muito melhor do que achava antes (pelo menos até o começo das aulas) e tem um talento impressionante pra jogos de videogame e PC.

E pretende voltar ao [[CM]]... só para os [[DotA]], [[CS]] e [[Beagle]], claro!

[[Image:Errosdeportugues.gif|Basically this]]

== Typos? Acho que não... ==

Eis alguns dos "erros tão ''inacreditáveis''" vistos no [[CM]] (por ordem de quão '''grotesco''' é o erro):

*'''''dês do''''';
*discuções;
*devesse-se;
*trasgênico;
*vejetariano;
*transmição;
*possa d'água;
*estraviar;
*cazo;
*inverterado;
*profundesas;
*(continua...)

A lista, '''com certeza''', é maior, mas não me recordo de '''todos''' os erros...

== Site Pessoal ==

[http://www.cecm.usp.br/~issamu/site/HTML/ CCM Comics!] - não mais em fases de testes, mas em fase de "preguiça-de-atualizar"...

[[Categoria: T15]]
[[Categoria: Alunos do CM]]
[[Categoria: Homônimos do CM]]

Bambu

2006-12-12T01:50:10Z

Sonic Orochi:

''Mas... e o bambu?''

Eventos atuais

2006-12-12T01:49:51Z

Sonic Orochi:

[[T15]] e [[T16]] desesperadas com notas, provas e subs. Ah, e com os [[Bambu|bambus]], claro!

----

Preocupação geral com a reunião da [[Comissão]] (e possíveis [[Bambu|bambus]]).

----

Organização dos 1os [[Jogos Atléticos Ceu Mineo]].

[[Categoria: Wikoleculares]]

Xjump

2006-12-10T20:00:52Z

Sonic Orochi: /* Curiosidades */

xjump. Pronuncia-se "ékis djãmpi". "x" vem do fato de que o bonequinho que você controla se parece, realmente, com uma letra X. "jump" porque, sim, ele pula.

== O que é ==
[[Image:xjump.png|thumb|Screenshot do jogo "xjump"]]

Imagine-se em uma torre de paredes de blocos azuis com um número de andares em blocos vermelhos infinito. Vista uma calça verde colada (vide [[Saulo]]) e um suéter vermelho (também colado). Agora corte seu cabelo estilo trote pós-vestibular-bem-sucedido.

De repente, a torre começa a desmoronar (ou o chão a subir? Ou os andares a afundar? Tudo depende da sua imaginação...) Qual a primeira coisa que lhe parece viável e plausível a se fazer? Você olha o nome do jogo e diz: '''PULAR'''! E não é só '''"pular"''', é '''"pular"''' de maneira doentia: vale girar o corpo, rodopiar, cair de cabeça para baixo, bater na parede... e tudo isso em um ritmo cada vez mais rápido e frenético.

Então começa sua jornada... rumo ao topo!

== Comandos ==

Não são nada complexos. Se você tiver problema em alcançar 50 andares, [[suicide is your only option]].

*Seta para Esquerda: move o boneco para a esquerda.
*Seta para Direita: move o boneco para a (tantantan!) direita.
*Seta para Cima: move o boneco para cima? Não... simplesmente faz ele '''PULAR'''.
**Muitos jogadores do top score deixam esta tecla pressionada e conseguem scores espetaculares como 1862.
*Seta para Baixo: mata, aleatoriamente, um motoboy em São Paulo.
*Shift+Q: sai do jogo

[[Image:xjump_jnb3.png|thumb|left|Tema baseado em '''[[jump'n'bump]]''']]

== Temas ==
O ''xjump'' foi revolucionado após a descoberta de que é possível implementar temas personalizados pelo usuário. Para isso, é necessário criar um arquivo '''xpm''' adequado e rodar
xjump -graphic arquivo.xpm
Por exemplo, à esquerda pode-se ver um dos temas mais populares, o '''jnb3''', baseado no [[jumpnbump|Jump & bump]]. Os arquivos podem ser encontrados em ''/home/vitor/xj'' e em ''/home/cmarin/xjump'', com temas variando desde '''Ice Climbers''' até '''Sonic''' e '''Mario'''!

Arquivos '''xpm''' podem ser editados usando o [[gimp]], apesar de não ser uma tarefa muito simples.

== Estratégia ==

À primeira vista, o jogo parece não ter '''atrito''', isso se deve à composição quasi-cristalina dos andares. Isso lhes confere uma superfície mais "lisa" do que o teflon.

Acostumando-se com esse pequeno deslize (com o perdão do drogadilho - vide [[Rafael]]) físico, você terá de pular para o próximo andar.

Iniciantes ([[newbies]]) vão andar, parar, pular, tentar controlar o pulo, e cair.

Experts ([[pros]]) se utilizam de técnicas que consistem, basicamente, em correr um pouco e pular, alcançando assim cerca de 2 a 4 andares de altura. Deve-se masterizar esta técnica para não cair na agonia do [[suicide is your only option]].

== Rating ==

Gráficos: 2/10

Jogabilidade: 3/10

Replay Ability: 11/10

Diversão: 10/10 - independe se você tem coordenação motora ou não (ver o caso do [[Fena]] que tem a pontuação de 510).

== Curiosidades ==

*Felipe da [[T15]] disse que viria para o CM, mesmo após deixar o curso, exclusivamente para jogar xjump. Não se sabe se realmente vai cumprir o que disse.

*Daniel, também da [[T15]], foi o pioneiro de sua turma a descobrir este jogo. Conseguindo scores cada vez maiores, incentivou os outros a jogar e, com isso, melhorou a média da pontuação do top 20. O menor score atual é de 294. O antigo era de cerca de 50.

== Hall da Fama ==

Os grandes Mestres do xjump [[ceeceêmico]]. Atualizado em 19:52, 17 Novembro 2006 (BRT)

# 1865 [[Saulo Henrique Pires de Oliveira]] ([[T15]])
# 1862 [[Gustavo T F]] ([[T10]])
# 1322 [[Vitor Eiji Justus Sakaguti]] ([[T14]])
# 1231 [[Mineo Shiguematsu]] ([[T0]])
# 1080 [[Vitor Ferreira Onuchic]] ([[T16]])
# 1034 [[Rafael Fuess Nishimura]] ([[T16]])
# 980 [[Yul Otani]] ([[T14]])
# 698 [[Lucas]] ([[T12]])
# 558 [[Renato Mendes Coutinho]] ([[T14]])
# 510 [[Renato Schattan Pereira Coelho]] ([[T15]])
# 495 [[Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro]] ([[T15]])
# 478 [[Rafael Prado Proenca]] ([[T15]])
# 429 [[Felipe Augusto Nunes Ferraz]] ([[T15]])
# 372 [[fernando henry meirelles]] ([[T15]])
# 356 [[Rodrigo Roque Dias]] ([[T12]])
# 348 [[William Seiti Mizuta]] ([[T16]])
# 347 [[Thiago Augusto Miranda Delatorre]] ([[T12]])
# 345 [[Willian Massami Kurita]] ([[T16]])
# 324 [[Lucas Antunes Maciel Mussnich]] ([[T16]])
# 294 [[Guilherme Dias Simões]] ([[T16]])

== Clones e afins ==

O xjump, assim como todo clássico, tem seus clones, como o SDL jump, que permite jogar em até 4 pessoas no mesmo computador! Um outro clone é o xjumpx.

== Ver também ==

* [[Diversões do CM]]
* [[Frozen Bubble]]
* [[SDL Jump]]
[[Categoria: Diversões do CM]]

Xjump

2006-12-10T19:59:58Z

Sonic Orochi: /* Hall da Fama */

xjump. Pronuncia-se "ékis djãmpi". "x" vem do fato de que o bonequinho que você controla se parece, realmente, com uma letra X. "jump" porque, sim, ele pula.

== O que é ==
[[Image:xjump.png|thumb|Screenshot do jogo "xjump"]]

Imagine-se em uma torre de paredes de blocos azuis com um número de andares em blocos vermelhos infinito. Vista uma calça verde colada (vide [[Saulo]]) e um suéter vermelho (também colado). Agora corte seu cabelo estilo trote pós-vestibular-bem-sucedido.

De repente, a torre começa a desmoronar (ou o chão a subir? Ou os andares a afundar? Tudo depende da sua imaginação...) Qual a primeira coisa que lhe parece viável e plausível a se fazer? Você olha o nome do jogo e diz: '''PULAR'''! E não é só '''"pular"''', é '''"pular"''' de maneira doentia: vale girar o corpo, rodopiar, cair de cabeça para baixo, bater na parede... e tudo isso em um ritmo cada vez mais rápido e frenético.

Então começa sua jornada... rumo ao topo!

== Comandos ==

Não são nada complexos. Se você tiver problema em alcançar 50 andares, [[suicide is your only option]].

*Seta para Esquerda: move o boneco para a esquerda.
*Seta para Direita: move o boneco para a (tantantan!) direita.
*Seta para Cima: move o boneco para cima? Não... simplesmente faz ele '''PULAR'''.
**Muitos jogadores do top score deixam esta tecla pressionada e conseguem scores espetaculares como 1862.
*Seta para Baixo: mata, aleatoriamente, um motoboy em São Paulo.
*Shift+Q: sai do jogo

[[Image:xjump_jnb3.png|thumb|left|Tema baseado em '''[[jump'n'bump]]''']]

== Temas ==
O ''xjump'' foi revolucionado após a descoberta de que é possível implementar temas personalizados pelo usuário. Para isso, é necessário criar um arquivo '''xpm''' adequado e rodar
xjump -graphic arquivo.xpm
Por exemplo, à esquerda pode-se ver um dos temas mais populares, o '''jnb3''', baseado no [[jumpnbump|Jump & bump]]. Os arquivos podem ser encontrados em ''/home/vitor/xj'' e em ''/home/cmarin/xjump'', com temas variando desde '''Ice Climbers''' até '''Sonic''' e '''Mario'''!

Arquivos '''xpm''' podem ser editados usando o [[gimp]], apesar de não ser uma tarefa muito simples.

== Estratégia ==

À primeira vista, o jogo parece não ter '''atrito''', isso se deve à composição quasi-cristalina dos andares. Isso lhes confere uma superfície mais "lisa" do que o teflon.

Acostumando-se com esse pequeno deslize (com o perdão do drogadilho - vide [[Rafael]]) físico, você terá de pular para o próximo andar.

Iniciantes ([[newbies]]) vão andar, parar, pular, tentar controlar o pulo, e cair.

Experts ([[pros]]) se utilizam de técnicas que consistem, basicamente, em correr um pouco e pular, alcançando assim cerca de 2 a 4 andares de altura. Deve-se masterizar esta técnica para não cair na agonia do [[suicide is your only option]].

== Rating ==

Gráficos: 2/10

Jogabilidade: 3/10

Replay Ability: 11/10

Diversão: 10/10 - independe se você tem coordenação motora ou não (ver o caso do [[Fena]] que tem a pontuação de 510).

== Curiosidades ==

*Felipe da [[T15]] disse que viria para o CM, mesmo após deixar o curso, exclusivamente para jogar xjump. Não se sabe se realmente vai cumprir o que disse.

*Daniel, também da [[T15]], foi o pioneiro de sua turma a descobrir este jogo. Conseguindo scores cada vez maiores, incentivou os outros a jogar e, com isso, melhorou a média da pontuação do top 20. O menor score atual é de 206. O antigo era de cerca de 50.

== Hall da Fama ==

Os grandes Mestres do xjump [[ceeceêmico]]. Atualizado em 19:52, 17 Novembro 2006 (BRT)

# 1865 [[Saulo Henrique Pires de Oliveira]] ([[T15]])
# 1862 [[Gustavo T F]] ([[T10]])
# 1322 [[Vitor Eiji Justus Sakaguti]] ([[T14]])
# 1231 [[Mineo Shiguematsu]] ([[T0]])
# 1080 [[Vitor Ferreira Onuchic]] ([[T16]])
# 1034 [[Rafael Fuess Nishimura]] ([[T16]])
# 980 [[Yul Otani]] ([[T14]])
# 698 [[Lucas]] ([[T12]])
# 558 [[Renato Mendes Coutinho]] ([[T14]])
# 510 [[Renato Schattan Pereira Coelho]] ([[T15]])
# 495 [[Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro]] ([[T15]])
# 478 [[Rafael Prado Proenca]] ([[T15]])
# 429 [[Felipe Augusto Nunes Ferraz]] ([[T15]])
# 372 [[fernando henry meirelles]] ([[T15]])
# 356 [[Rodrigo Roque Dias]] ([[T12]])
# 348 [[William Seiti Mizuta]] ([[T16]])
# 347 [[Thiago Augusto Miranda Delatorre]] ([[T12]])
# 345 [[Willian Massami Kurita]] ([[T16]])
# 324 [[Lucas Antunes Maciel Mussnich]] ([[T16]])
# 294 [[Guilherme Dias Simões]] ([[T16]])

== Clones e afins ==

O xjump, assim como todo clássico, tem seus clones, como o SDL jump, que permite jogar em até 4 pessoas no mesmo computador! Um outro clone é o xjumpx.

== Ver também ==

* [[Diversões do CM]]
* [[Frozen Bubble]]
* [[SDL Jump]]
[[Categoria: Diversões do CM]]

Peter William Atkins

2006-12-07T05:34:36Z

Sonic Orochi:

'''Peter William Atkins''' é o autor de muitos e muitos livros de [[química]], usados em diversos cursos, embora com aceitação variada.

Já visitou o [[CCM]] e, segundo o [[Fleming]], ficou bastante impressionado com o curso (principalmente depois de saber que o livro usado em [[Curso de Química do CM|Química]] era o dele).

== Livros ==

Estes são encontrados na [[Biblioteca do CM]]:

* [[Princípios de Química]] e Chemical Principles: The Quest for Insight
* [[Físico-química (Atkins)|Físico-química]]
* [[Química Inorgânica (Atkins)|Química Inorgânica]]
* [[Química Orgânica (Atkins)|Química Orgânica]]

== Ver também ==

* [[Química]]

[[Categoria: Autores de livros]]
[[Categoria: Livros do CM]]

Discussão:Catálogo de professores

2006-11-30T22:22:09Z

Sonic Orochi:

Achei legal a proposta, mas achei também que os comentários da maioria dos professores estão num tom bastante ofensivo e reducionista. Apesar de o Wiki ser um espaço para críticas e desabafos, acho que isso pode ter uma repercussão ruim e que os tais professores possam não gostar. Observe que o Wiki é facilmente acessível pelo Google, em muitos casos ocorrendo na primeira página. Acho que seria bom dar uma "moderada" no tom.
Além disso o artigo está demasiadamente comprido, seria melhor que fosse dividido, talvez por institutos ou departamentos. Poder-se-ia criar também um modelo para os comentários.
[[Usuário:Rend|Leo (T15)]] 21:47, 29 Novembro 2006 (BRST)
* Eu sei que isso pode soar heresia mas existe uma maneira de tornar algumas áreas do wiki visíveis apenas usuários cadastrados? Note que isso não impediria que qualquer pessoa lesse mas reduziria a visibilidade do artigo restrito, obrigando o leitor a se cadastrar e dificultando a vida do Google. [[Usuário:Lfsr|Lfsr]] 12:27, 30 Novembro 2006 (BRST)

----

A propósito, de onde veio essa lista? Como se reuniu informação sobre tantos professores???
[[Usuário:Rend|Leo (T15)]] 21:57, 29 Novembro 2006 (BRST)

* A versão inicial veio de comentários na lista de emails da [[T12]] a pedido do próprio [[Atkins]]. [[Usuário:Lfsr|Lfsr]] 12:27, 30 Novembro 2006 (BRST)

----

Bem, acho que os comentários são importantes. Contudo, acho também que esta lista é um bem importante para os alunos do Ciclo Avançado (tanto que fui eu que sugeri ao Bruno que a colocasse no Wiki). De modo que eu proporia algumas regrinhas:

* pensando em comentário feito pelo [[Vitor Eiji Justus Sakaguti|Vítor]], como a avaliação é subjetiva e passível de diferir entre as pessoas, acho que poderíamos abrir espaço para diversos comentários, colocando-os como tópicos, um após o outro, caso mais de uma pessoa tenha comentários a fazer sobre determinado professor;

* como bem disse o [[Leo Heikiti Maeda Arruda|Leo]], o artigo está muito grande. Poderíamos quebrá-lo da seguinte forma: criar novos artigos para cada um dos Institutos; esta página aqui conteria então os apontadores para os outros artigos.

Quanto ao tom depreciativo de alguns dos artigos, não pensei no que fazer. Espero que outros achem uma solução.

----

Acho que o tom depreciativo pode ser amenizado... mas não muito, pois há casos em que não tem como expressar a opinião de outra maneira... Colocar exemplos do porquê não gostam de determinado professor também é uma boa... --[[Usuário:Sonic Orochi|Sonic Orochi]] 20:22, 30 Novembro 2006 (BRST)

Catálogo de professores

2006-11-30T17:26:11Z

Sonic Orochi: /* IAG */

O objetivo deste artigo é mostrar as diversas opiniões sobre os docentes da USP, servindo como um banco de dados, para que, assim, os alunos possam vir a escolher de forma mais criteriosa (sempre que possível) seus futuros professores. Todas as opiniões aqui presentes são, a princípio, anônimas.

== [[FCF]] ==

'''Ranvaud'''

Igual à Silvia Berlanga, apesar de a aula ser mais confusa.

'''Regina Lúcia Moraes Moreau'''

Muito boa.

'''Silvia Berlanga'''

Semi recomendada. Ótima pessoa, aulas meio confusas, mas disponibiliza todo o material e dá uma bibliografia muito boa.

== [[FM]] ==

'''Claudio Cohen'''

Recomendado.

'''Reinaldo Ayer'''

Recomendado.

== [[IAG]] ==

'''Amaury A. de Almeida'''

Aula boa, prova tranqüila.

'''Eduardo Janot Pacheco'''

Conteúdo: aquém. Avaliação: fácil, porém o critério de correção é ruim. Pede seminário. Didática: razoável. Comentário: ele dá uma aula de menos de uma hora e sempre se atrasa. Falta muito. O conteúdo não tem muito a ver com a ementa e ele corre com a matéria, mas a avaliação é fácil e ele sempre pára para tirar dúvidas. Lousa: não tem, aula com slides.

'''Enos Picazzio'''

Conteúdo: o da ementa e mais algumas coisas sobre o que ele faz. Avaliação: nada a ver com a lista e puramente conceitual, difícil saber se foi bem ou não. Mão pesada pra corrigir. Poucas provas também. Didática: ele vai falar tudo com muito cuidado, muita calma, bem devagarinho, bem baixinho, fino, suave e tranqüilo. Nana neném que a cuca vem pegar... O Cristiano está falando sério, você vai dormir na aula dele. Lousa: não tem, aula em slides. Comentário: muito gente boa, mas a aula dele vai dar sono e ele vai cobrar na prova.

'''Jane Gregório Hetem'''

Conteúdo: Ela escreveu a grade curricular e o conteúdo da maioria das matérias da astronomia, então ela cumpre mesmo. Avaliação: tipo complete, ligue os pontos, você vai se sentir no jardim da infância. Os enunciados são imprecisos, o que leva a dúvida e erros. Comentário: muito gente fina, mas não deixe ela pegar no seu pé, senão ela mostra o lado cínico dela. Maior média do Cristiano, bem fácil. Lousa: organizada e ela gosta de escrever.

'''Jorge E. Horvath'''

O professor é bem humorado, mas a aula não é muito boa porque ele pressupõe muitos conhecimentos prévios dos alunos, o que geralmente não é verdade. Além disso, suas listas de exercícios são altamente trabalhosas.

'''Nelson Vani Leister'''

As aulas dele são muito ruins e como se não bastasse as provas são sem noção. Evite-o.

'''Roberto Boczko'''

*Aula extremamente boa. É possivelmente o melhor professor do IAG.

*Excelente professor. Dá aulas com datashow, e fornece as apresentações no começo do semestre. Muito simpático e gentil sempre que você tiver alguma dúvida. Um exemplo para todos os professores da USP. Vale a pena fazer qualquer matéria com ele.

== [[IB]] ==

'''Regina Pekelmann Markus'''

Humor muito instável e exigente na aula. Não recomendável.

== [[ICB]] ==

'''Clarice Gorenstein'''

Muito boa.

'''Irene Yan'''

Muito recomendada. Muito didática, muito boa pessoa, disponibiliza tudo no site, e é engraçada pacas.

'''Patricia Gama'''

Desrecomendada. Sabe muito, mas não tem uma didática das melhores.

== [[IF]] ==

'''Alinka Lépine-Szily'''

Super boa pessoa, mas é um pouco confusa na aula. Provas coerentes com as aulas.

'''Barata'''

Não recomendável, não é tão rigoroso quanto se diz, perde muito tempo com nomenclatura e bobagens na aula, provas difíceis e listas trabalhosas.

'''D. Gitman'''

Altamente não recomendável, não serão tecidos comentários sobre alguém que ministra aulas de relatividade geral, mas não sabe o que é uma variedade.

'''Emerson Passos'''

Altamente recomendável, apesar de sua letra horrível e sua lousa bagunçada, é um excelente professor, razoavelmente rigoroso e suas provas não são difíceis.

'''Ewa Wanda Cybulska'''

Dizem que ela é a mesma Eva de Adão e Eva. Um pouquinho brava, mas justa na correção dos relatórios.

'''Fernando Navarra'''

Altamente recomendável: além de ser muito engraçado sua aula mistura teoria com aplicações de uma forma a agradar todos os gostos.

'''Giancarlo Esposito de Souza Brito'''

Aula boa, prova coerente com a aula, correção justa.

'''Gustavo Burdman'''

Excelente professor. Atencioso, generoso nas correções. Não se importa em fica 20 minutos a mais resolvendo um problema na sala de aula. Além do que é um pesquisador muito ativo. Vale a pena fazer todas as matérias que você puder com ele, e se te interessar, fazer uma IC.

'''Humberto França'''

Não fede nem cheira.

'''Kazunori Watari'''

*Altamente não recomendável, fuja desse ser odioso, além de coxo, não sabe nem física muito menos matemática e suas provas são difíceis além de contar com a sua super correção sem o mínimo sentido.

*Conteúdo: hein? Como assim? Se a ementa fosse uma linha, ele já a ultrapassou e está tão longe que a linha parece um ponto. Avaliação: extremamente sem noção. Mas logo depois vem a sua nota, dai você vai ver que ele pode piorar muito. Mas não se preocupe, as provas são pra casa, pega na sexta e entrega na segunda. O Cristiano nunca viu ninguém reprovar, porém já viu muitos desistirem. Didática: dependendo da aula e se está manjando muito, você aproveita um pouco o que ele diz. Comentário: pense naquele sensei de karate. Imagine agora que em vez de você fazer 1000 movimentos repetidos você tem que resolver 1000 integrais não triviais. Se você só puxar essa matéria terá chance de fechar com nota boa e sair sabendo a matéria. Lousa: bem organizada.

*Horrível. Cospe um monte de matéria, e se você tiver dúvida, ele te zoa perante a sala toda. Suas correções são hiper-rigorosas e suas provas hiper-trabalhosas, mas depois você misteriosamente passa.

'''Manoel Roberto Robilotta'''

*Conteúdo: igual ao da ementa. Mas você nunca vai comparar a aula dele com a de outro professor ou com o livro. Avaliação: vide Suzana. Didática: excelente, mas a aula dele cansa porque você tem que estar atento a tudo. Comentário: um professor excelente que manja muito e sabe passar conhecimento para os alunos. Gosta da parte da filosofia da física. Se o Piza é o número 1 ninguém rouba a segunda posição do Robilotta. Faça a matéria com, não interessa qual. Lousa: muito boa.

*Aula muito boa, o Robilotta realmente entende de física. A prova é de nível médio, estudando direitinho é possível ir bem.

'''Manoel Tiago Freitas da Cruz'''

Aula boa.

'''Marcheti'''

Não cheira nem fede.

'''Marcelo Gimenez'''

Conteúdo: o da ementa e olhe lá. Avaliação: cinco EPs e um eletivo. Péssimo, mas é constante na correção, pegue o jeito de fazer o relatório e sempre faça assim que você vai sempre tirar nota bem alta. Didática: razoável. Comentário: parece que ele está perdido no meio da experiência. Você demora até entender o que tem que fazer e como fazer as medidas.

'''Marina Nielsen'''

*Conteúdo: o da ementa. Avaliação: média simples de três provas. Faça a lista! Do contrário você reprova. Didática: muito boa. Comentário: não é rigorosa, bem divertida. Geralmente a única escapatória dos chefões. Lousa: boa.

*Excelente professora. Suas provas são cópias das listas (só com os números mudados) e ensina muito bem. Vale a pena fazer matéria com ela. Mas ela não dá boi, 4,9=4,9 e 5,0=5,0, além do que sua REC é difícil também. Se fizer matéria com ela, passe preferencialmente direto sem depender de sub nem rec.

'''Mário de Oliveira'''

Não cheira nem fede.

'''Mauro Cattani'''

O senhor de todos os professores coxos. Suas aula que deveria durar 3 horas, dura 1h20min. Não dá provas, somente trabalhos que ele manda copiar do livro. As listas são da mesma maneira. Mas no fim você passa com uma nota alta e fica feliz e contente. Mas mecânica dos fluídos mesmo você não sabe nada. Aconselha-se a fazer matéria com ele se só
precisar dessa matéria para se formar e não estar nem aí pra ela.

'''Nelson Carlin'''

*Conteúdo: o da ementa, nada mais. Avaliação: cinco EPs e um eletivo. Mão pesada e sem critérios na correção. Didática: quase não explica nada, você terá que se virar com tudo. Comentário: fuja, ele é muito apático, não vai ajudar em nada. Ele é o professor de física experimental III e IV, pegue a Silvia, ou o Fabinho ou o Marcelo, fuja dos outros.
Lousa: não há, ele não dá aula.

*Típico professor de Lab. Explica meia boca, nunca dá tempo de terminar de coletar os dados a tempo. Aconselha-se evitar, mas é impossível porque é a equipe dele que ministra a disciplina, além do que em lab 3 e 4 você não escolhe o docente.

'''Nestor Felipe Caticha'''

*Recomendável, não é muito didático, suas aulas são um show de curiosidades físicas, é quase bem rigoroso (pelo menos no curso de Fismat I que o Weber fez, no qual ele demonstrou quase tudo que os professores deveriam demonstrar, mas não demonstram). Quando dá cálculo numérico não passa provas, mas dá EPs extremamente trabalhosos.

*Conteúdo: como assim, a física é uma ciência multifacetada cheia de coisas curiosas. É um mundo a ser explorado, por exemplo as formigas do Himalaia...Já deu pra entender né? Avaliação: média simples, se for cálculo numérico, média simples de quatro EPs. Se não for ele quem corrige então é tranqüilo, porém se ele corrigir e não o monitor, prepare-se para que o próximo EP seja 10, você vai precisar dessa nota. Você terá trabalho, muito trabalho com ele. Didática: boa, sempre responde o que você pergunta, porém escreve muito mal, algumas partes você simplesmente não entende o que ele quer dizer e não pela complexidade do assunto, mas porque está mal redigido. Comentário: esse cara sabe muito e não está a fim de ferrar o aluno, porém ele quer que você aprenda muito em pouco tempo. As aulas dele não tem nada a ver com a matéria, o que não quer dizer que sejam chatas.

'''Oscar Éboli'''

Altamente recomendável, super didático (tem a lousa mais bonita e compreensível que o Weber já viu), razoavelmente rigoroso, provas não muito difíceis.

'''Otaviano Helene'''

*Conteúdo: um pouco aquém da ementa. Avaliação: muito fácil, bem tranqüila. Mas não se esqueça da calculadora e também não vá errar conta. Faça toda a lista que a prova é fácil. Didática: boa. Comentário: se a Rosangela Itri é mãe ele certamente é pai. Muito bonzinho com os alunos, ele jamais vai rir ou menosprezar o que você perguntar. Sabe muito, porém a aula é muito levezinha. Baba. Recomendada. Lousa: muito bagunçada.

*Ótimo professor. Suas aulas são boas e suas provas muito compatíveis com suas listas que em geral são fáceis. Nesse curso ele passou o Eisberg na lousa. Vale a pena fazer matéria com ele.

'''Pascholati'''

Professor bom também. Costuma viajar um pouco e ensinar cultura geral. Sempre que você precisar e ele estiver disponível, terá o maior prazer em te receber em sua sala e esclarecer sua dúvida. A correção dos relatórios inclui erros de português. Vale a pena fazer uma matéria com ele.

'''Piza'''

*Conteúdo: a ementa é o rodapé da aula. Vai muito além, ainda mais se na sua sala houver pessoas interessadas no que ele está falando e certamente terá. Avaliação: se ele der a matéria em conjunto com outros professores certamente ele não fará a avaliação, então não deixe escapar a chance de ouro. Se ele for confeccionar as provas, bom estudar muito. Muito rigoroso na correção. Didática: o melhor professor que o Cristiano já viu, ele pensa várias vezes em fazer matéria repetida só pra ter aula com o Piza novamente. Comentários: o Piza já esta meio sem noção pela idade, fala o que quer, corrige a prova de maneira muito rigorosa, porém não existe professor que o Cristiano admire mais que ele. Ele não só tem personalidade como sabe muito sobre muita coisa, rivaliza com o Pascholatti em cultura, é provavelmente a pessoa mais inteligente com quem o Cristiano conversou. Imbatível em conhecimento sobre física. Lousa: quase sempre organizada.

*Bom professor, ensina de tudo. Costuma às vezes se empolgar e ensinar cálculo avançado.Vale a pena fazer uma matéria com ele.

'''Regina Kawamura'''

Não fede nem cheira.

'''Rivelles'''

Orientador do Weber. Recomendável, aula canônica, mas extremamente clara, bem rigoroso matematicamente.

'''Rosângela Itri'''

*Conteúdo: correto com a ementa. Avaliação: coerente com a lista e com a aula. Didática: OK. Comentário: mãezona. Trata muito bem o aluno e escuta com atenção. Prepara as aulas e sempre traz alguma novidade. A única professora que já deu bombom pra sala toda e lanchinho no final do semestre. Recomendada mesmo. Lousa: bem organizada.

*Boa professora. Ensina bem e suas provas e provinhas são de acordo com listas. Se estudar direitinho dá pra passar com notão.

'''Suzana Salem Vasconcelos'''

*Conteúdo: o da ementa. Avaliação: não é difícil e é compatível com a lista. Didática: bem mais ou menos, mas ela ajuda e responde as perguntas, seja qual for. Comentário: ela é bem fácil de se odiar. Fica histérica no meio da aula com grande facilidade. Não se preocupe, dificilmente você vai reprovar, boa sorte. Lousa: bem desorganizada.

*Horrível também. Sempre desanimada. Suas aulas são chatas e costuma parar em toda grevezinha, porém suas provas, em geral, são fáceis. Não vale a pena fazer matéria com ela.

'''Tânia Tomé'''

*Não cheira nem fede.

*Conteúdo: segue a ementa. Avaliação: média simples e sub escancarada. Não vai te ferrar. Didática: bem ruinzinha. Comentário: imagine um múmia dando aula...Cuidado com a avaliação dela. Ela não divide bem as notas na prova, logo um exercício fácil de fazer vale o mesmo que aquele exercício que você levou uns 40 minutos pra realizar. Lousa: razoável.

*Professora razoável. Suas provas são compatíveis com as listas e suas aulas não são lá tudo isso. Dá pra passar tranqüilo. Aconselha-se fazer matéria com ela.

'''Zwinglio Guimarães de O. Filho'''

*Aula muito boa, ele é bastante empolgado com a matéria, além de ser super gente fina. É exigente, mas com ele se aprende laboratório de verdade.

*Conteúdo: o da ementa e um pouco mais. Avaliação: relatório e prova. São fáceis, porém ele vai pegar no pé na hora de corrigir. Didática: boa. Comentário: Parafraseando o amigo do Cristiano, IME: "a área de especialização do Zwinglio é lab didático!". O Cristiano nunca viu um professor tão empolgado com laboratório. Ele sempre vai ajudar e sempre vai te dar mais trabalho, como se lab fosse a coisa mais legal do mundo.

== [[IME]] ==

'''Albert Meads Fisher'''

Gente fina. Tem um pouco de sotaque, mas é perfeitamente compreensível e a aula é boa.

'''Alexander Nikolaevich Grishkov'''

Tem bastante sotaque russo, mas a aula é razoável.

'''Alfredo Jorge Aragona'''

Provavelmente a aula mais rigorosa que o Roque já viu na vida. O problema é que ele fala muito baixo e enrolado. Em todo caso, tá tudo (muito bem) redigido na lousa. Prova normal, correção idem.

'''André de Oliveira Gomes'''

Copy+paste no comentário sobre o Vitor (mas o Roque gosta bem mais doVitor).

'''Antonio Carlos Asperti'''

Aula boa, prova coerente com a matéria, correção justa.

'''Antonio Luiz Pereira'''

Gente fina, aula bacana, mas meio atrapalhado (do tipo que é melhor copiar a lápis, porque você vai ter que apagar várias vezes o que já escreveu). Prova e correção justas.

'''Artur Tomita'''

O pior. Não se entende o que ele fala, não se entende o que ele escreve, não se entende porra nenhuma. Fuja com gosto.

'''Augusto Reynol'''

Conteúdo: muito abaixo da ementa. Avaliação: a mão do cara pesa feito chumbo na correção, as questões são razoavelmente fáceis. Poucas provas (apenas duas), o que quer dizer que se você vai mal na primeira você vai ficar com nota baixa certamente. E nem se atreva a fazer a sub. Didática: muito boa e ele vai tirar suas dúvidas. Comentário: professor muito bom, ele não é tão rigoroso na lousa quanto na prova e o livro que ele adota é o Stewart, ou seja, sem rigor nenhum. Lousa: razoável

'''Carlos Hitoshi Morimoto'''

Gente fina, a aula é boa e divertida.

'''Daniel Panazzolo'''

A aula é boa, o professor é gente fina, a prova é coerente com a matéria e a correção é justa.

'''Daniel Tausk'''

Muito bom. Aula às vezes meio enrolada, mas é só perguntar e ele responde com clareza (mostra contra-exemplos na hora, esse tipo de coisa). O cara sabe praticamente tudo o que você pode um dia vir a querer saber sobre Matemática. Prova justa e correção generosa.

'''Ernesto Birgin'''

*Conteúdo: abaixo da ementa, porém o básico ele dá bem. Avaliação: não é difícil gabaritar, porém se errar ele vai tirar muito ponto. Bem filha da puta na hora de corrigir. No final ele sempre arredonda pra cima. Didática: muito boa. Comentários: ele é bem filha da puta, mas a aula dele é bem legal de assistir. Não necessite dele para nada. Dá pra passar fácil com nota boa, aproveite. Lousa: muito organizada na hora de fazer os programas.

*Excelente professor. Ensina muito bem e propõe muitos exemplos em classe (o que ajudou muito). Seus EPs não são fáceis, mas dá pra fazer todos e tirar notas boas. Costuma ser um pouco rigoroso nas correções.

'''Eduardo Colli'''

Aula boa, prova coerente com a matéria e correção justa.

'''Francisco Miraglia'''

O cara sabe tudo, ponto (sem "praticamentes" nem nada do tipo). Tipo um Fleming do IME (na humilde opinião do Roque, mais foda que o Fleming). Como disse uma vez o Abdo: "eu não sei precisar o quanto eu aprendo na aula do Miraglia, mas que é muito legal de assistir, isso é". Não muito didático, é verdade, mas ainda assim recomendado. [Quanto a provas e tal, não se sabe, porque a matéria que o Roque fez com ele era só de seminários.]

'''Héctor Alfredo Merklen Goldschmidt'''

*Conteúdo: ahhahahhahahhaha. Avaliação: mão leve na hora de corrigir, porém as perguntas não são fáceis. Média simples nas provas e sub fechada. Didática: hahahahahhahhah, o Cristiano riria mais se não fosse trágico. Lousa: ?? Comentário: se você não quiser aprender nada faça com esse cara. Ele não está nem ai pra ninguém.

*Péssimo professor. Especialista em dar aulas em 1 hora e meia e acabar um curso 20 dias antes do calendário. Além do que faz listas cheias de erros. Comum haver menos de 5 alunos em sua classe.

'''Humberto Daniel Carrion Villaroel (Sinistro)'''

Aula boa, prova difícil e correção hiper rigorosa. Está sempre de óculos escuros e gosta de aterrorizar os alunos. É dele a frase “para passar na minha disciplina só há duas maneiras: estudando muito ou estudando ainda mais”.

'''Jorge Tadashi'''

Gente boa, mas péssimo. Quer ensinar o que não sabe. (A menos que você vá fazer, sei lá, Álgebra Linear com ele, o que o Roque acha que não é o caso de ninguém aqui.).

'''Leilá Maria Vasconcellos Figueiredo'''

Aula boa.

'''Leônidas de Oliveira Brandão'''

Evitá-lo o quanto puder.

'''Lúcia Satie Ikemoto Murakami'''

Gente finíssima, aula muito boa e provas decentes. Recomendada.

'''Marco Dimas Gubitoso (Gubi)'''

Super gente fina. A aula é boa e engraçada. Prova coerente com a matéria e correção justa.

'''Marta Salerno Monteiro'''

*Conteúdo: dá toda a ementa certinho, sem exigir demais. Avaliação: está acima da aula, porém fazendo as listas dá pra tirar uma nota legal. Rigorosa na correção. Didática: excelente. Comentários: professora rigorosa na correção, mas muito gente fina. Recomendada. Lousa: organizada.

*Boa Professora, embora meio rigorosa na correção das provas. Suas aulas são bem preparadas e ela responde qualquer dúvida muito bem. Vale a pena fazer matéria com ela.

'''Mary Lílian'''

*Conteúdo: dá certinho toda a ementa, sem problemas, e com rigor. Avaliação: coerente com a matéria e a lista, porém erra muito e não tente argumentar com ela a não ser que você esteja brigando por um dez numa prova em que você tirou 9,8. Didática: muito boa, porém fala mais que os cotovelos de assuntos alheios a aula. Comentários: não precisa fugir, dá pra passar sem problemas e sua aula é boa. Professora ok. Lousa: organizada.

*Excelente professora, porém costuma ser meio arrogante com quem não vai as aulas e vem encher o saco dela em sua sala. Uma dica: vá a todas as aulas e não fique conversando (ela costuma dar esporros enormes em quem faz isso). Ah... nunca pergunte sobre greves para ela se não quiser ouvir umas poucas e boas. Ah, costuma corrigir provas muito rápido, o que às vezes faz ela errar nas correções. Fique esperto.

'''Paulo Cordaro'''

O mais fodão. Se ele der alguma matéria que te interessa vagamente, sinta-se na obrigação moral de fazê-la. Didática espantosa, lousa impecável, e ele manja pra caralho. Provas meio suadas, mas razoáveis.

'''Paulo Piccione'''

Aula muito boa.

'''Pedro Aladar Tonelli'''

Aula péssima, prova coerente com a matéria e correção justa.

'''Piotr Koszmider'''

Aula muito boa, provas sem noção. Na dúvida, assista como ouvinte.

'''Plínio Amarante Quirino Simões'''

*Conteúdo: matemática para matemáticos, o Cristiano acha que ele nunca leu a ementa do curso, mas o grosso da matéria ele dá. Avaliação: tão sem noção quanto a lista. Ela está escrita a mão, aliás bem mal escrita. Se você conseguir escrever alguma coisa que faça sentido ele considera, mas veja bem, se você conseguir... Didática: péssima, mas ele responde a qualquer dúvida e está a disposição pra ajudar. Comentário: o cara mais confuso que o Cristiano já viu, como ele pode ser professor? Extremamente rigoroso tanto na lousa quanto nas listas, que serão mais dolorosas que um chute no saco. Se passar com 5,0 considere que você aprendeu a matéria. Não é difícil de passar, mas a média é ponderada em 1, 2 e 3, ou seja, só passa depois da última prova. Lousa: um lixo.

*Como professor ele é ruim, já que é muito (e põe muito mesmo) confuso. Mas ele sempre está disponível para tirar dúvidas. Quem realmente estudar e fizer e entregar suas listas (geralmente uma por semana) passa sem problemas. O problema é que tem que estudar muito. Não costuma ser muito rigoroso na correção, porém erra muito nela.

'''Roberto Marcondes César Junior'''

Aula boa.

'''Routo Terada'''

Aula de nível médio. Mandava EPs de níveis de dificuldade variados, correção justa.

'''Slava'''

Altamente recomendável, muito rigoroso, provas difíceis. Curso para suar a camisa e aprender muito.

'''Vera Lucia Carrara'''

Aula boa, prova coerente com a matéria, correção generosa.

'''Vitor de Oliveira Ferreira'''

Muito bom. Aula excelente, mas as provas dão trabalho.

== [[IQ]] ==

'''Ana Maria Ferreira'''

Não fede nem cheira.

'''Antônia Tavares do Amaral'''

Filha da puta e uma merda.

'''Antonio Carlos Borin'''

Gente fina. Aula boa e provas tranqüilas.

'''Claudio di Vitta'''

Um merda e um filho da puta.

'''Dalva Faria'''

Péssima professora. Grossa e pensa que dá aula bem. Deu a matéria da P1 duas semanas depois e muitas vezes foi arrogante e estúpida, além do que faltava em muitas aulas. Evite a todo custo.

'''Dalva Lúcia'''

Ótema.

'''Daisy Rezende'''

Merda.

'''Denise Petri'''

*Ótema.

*Conteúdo: deu tudo certo, sem faltar e sem sobrar. Porém não tem nenhum rigor. Avaliação: não é difícil, porém se você gosta de ver a sua prova pode esquecer, ela vai fazer de tudo para não entregar. Didática: ela fala e você acompanha o que ela diz. Comentário: ela foi a professora de química do Cristiano, por isso não há muita coisa sobre ela, ele nunca foi tirar dúvida. Passa fácil. Recomendada. Lousa: lousa de professor de cursinho relaxado, só com as palavras chaves na lousa.

'''Etelvino José Henriques Bechara'''

Gente fina. Aula boa e provas coerentes com matéria, correção justa.

'''Fábio Rocha'''

Ótemo.

'''Farah'''

Gente fina, mas merda.

'''Fernando Ornellas'''

Ótemo.

'''Flávio Vichi'''

Não fede nem cheira.

'''Frank Quina'''

Não é porque é orientador do Químico, mas ele é foda mesmo.

'''Hans Viertler'''

Não fede nem cheira.

'''Henrique Toma'''

Merda.

'''Hermi Felinto de Brito'''

Não fede nem cheira.

'''Ivano Gutz'''

Recomendado.

'''Jivaldo Mattos'''

Não fede nem cheira.

'''João Comasseto'''

Filho da puta.

'''José Manuel Riveros Nigra'''

Ótemo.

'''Koiti Araki'''

Merda.

'''Liane Rossi'''

Não fede nem cheira.

'''Liliana Marzorati'''

Recomendada.

'''Luís Fernando'''

Filho da puta.

'''Márcia Temperini'''

Não fede nem cheira.

'''Maria Encarnación Vasquez Suárez-Iha'''

O Químico sente até calafrios.

'''Maria Regina Alcântara'''

Merda.

'''Maria Teresa Miranda'''

Merda.

'''Marina Tavares'''

Não fede nem cheira.

'''Mauro Bertotti'''

Ótemo.

'''Mauro Carlos Costa Ribeiro'''

Ótemo.

'''Neyde Iha'''

Não fede nem cheira.

'''Nina Coichev'''

Não fede nem cheira.

'''Omar El Seoud'''

Recomendado se a disciplina tiver menos de 10 pessoas - se não, IRRECOMENDADO - ele fala muito baixo -além de ter sotaque egípcio.

'''Paola Corio'''

Não fede nem cheira.

'''Paulo Sérgio Santos'''

Gente fina, mas merda.

'''Paulo Teng'''

Filho da puta que se acha bom demais.

'''Pérola Vasconcellos'''

Filha da puta e burra.

'''Peter Tiedemann'''

Ótemo.

'''Pio Colepicolo'''

Coitado.

'''Reinaldo Bazito'''

Outro orientador do Químico. Recomendado.

'''Renato Freire'''

Recomendado.

'''Roberto Tokoro'''

Merda e filho da puta.

'''Roberto Torresi'''

Gente fina, mas merda.

'''Sérgio Verjovski de Almeida'''

Pessoa má. Gosta de massacrar os alunos.

'''Shirley Schreier'''

Dá as aulas na forma de seminários dos alunos. Na maioria das vezes, você só aprende o que você mesmo fez. Às vezes é um pouco incoerente na avaliação.

'''Sílvia Serrano'''

Ótema.

'''Susana Torresi'''

Não fede nem cheira.

'''Tibor Rabóczkay'''

Coitado.

'''Vera Pardini'''

Odeia o pessoal do CM.

'''Viktoria Klara Lakatos'''

Não fede nem cheira.

'''Wanda de Oliveira'''

Não fede nem cheira.

'''Willi Baader'''

Ótemo.

'''Yoshio Kawano'''

Não fede nem cheira.

[[Categoria: Professores da USP]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T02:06:26Z

Sonic Orochi: /* Lista 5 (aula 20) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''. (Eu acho que a evidencia experimental que ele quer neste caso é a a experiencia com o gene ''reporter'', o gene usado neste caso é o cat.)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3) (Essa pergunta eatá meio mal formulada, mas eu acho que a resposta esperada é usando genes ''reporter'' (lacZ, neste caso, eu acho...) ligados a fragmentos do promotor de hunchback e medindo a expressão desses genes)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
: São controlados pela ação de ''gt'', ''Kr'', ''kni'', ''tll'' e ''hkb''. (Isso não está mto certo, acho que a resposta correta é que o limiar é controlado pela afinidade entre os ligantes e a amplitude pelo numero de copia do sitio de ligacao.)

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Vide 4. (?)

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
: Vários. Fazendo experimentos ''in vivo''.

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''en'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
: O controle de expressão desses genes é mais "fino". (by Ronaldo)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
: As concentrações diferentes desses 3 genes em fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:48:23Z

Sonic Orochi: /* Lista 5 (aula 20) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''. (Eu acho que a evidencia experimental que ele quer neste caso é a a experiencia com o gene ''reporter'', o gene usado neste caso é o cat.)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3) (Essa pergunta eatá meio mal formulada, mas eu acho que a resposta esperada é usando genes ''reporter'' (lacZ, neste caso, eu acho...) ligados a fragmentos do promotor de hunchback e medindo a expressão desses genes)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
: São controlados pela ação de ''gt'', ''Kr'', ''kni'', ''tll'' e ''hkb''. (Isso não está mto certo, acho que a resposta correta é que o limiar é controlado pela afinidade entre os ligantes e a amplitude pelo numero de copia do sitio de ligacao.)

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Vide 4. (?)

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
: Vários. Fazendo experimentos ''in vivo''.

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''en'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:27:52Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
: São controlados pela ação de ''gt'', ''Kr'', ''kni'', ''tll'' e ''hkb''. (Isso não está mto certo, acho que a resposta correta é que o limiar é controlado pela afinidade entre os ligantes e a amplitude pelo numero de copia do sitio de ligacao.)

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Vide 4. (?)

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
: Vários. Fazendo experimentos ''in vivo''.

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:11:02Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
: São controlados pela ação de ''gt'', ''Kr'', ''kni'', ''tll'' e ''hkb''.

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Vide 4. (?)

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:10:45Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
: São controlados pela ação de ''gt'', ''Kr'', ''kni'', ''tll'' e ''hkb''.

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Vide 4.

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:05:25Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de "footprinting". (vide ch.3, p.55, figura 3.3)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis

2006-11-29T00:03:58Z

Sonic Orochi:

{| border="1"
|+ '''Maternal Anteroposterior Axis'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''dicephalic'' (dic) || Maternal || Abnormal position of nurse cells relative to oocyte || || Contributes to anteroposterior polarity of nurse cell oocyte complex
|-
| ''gurken'' (grk) || Oocyte || Eggs ventralized with dorsal appendages reduced or missing || Similar to vertebrate transforming growth factor alpha (TGF-α), ligand for torpedo || Establishes first posterior and then dorsal identity of ovarian follicle cells
|-
| ''spindle'' (spn) (several loci) || Maternal germ line || Disturbed anteroposterior polarity of oocyte || || Determination of prospective oocyte among cystocytes
|-
| ''torpedo'' (trp) || Ovarian follicle cells || Similar to ''grk'' || Receptor tyrosine kinase, receptor for ''grk'' || Same as ''grk''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Anterior Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''bicoid'' (bcd) || mRNA transcribed in nurse cells and transported to anterior of oocyte. Translated during cleavage. Protein forms anteroposterior gradient. || Head and thorax replaced with mirror image of telson || Transcriptional regulator (homeodomain and paired repeat) || Activates ''hb'' transcription; acts as a morphogen on embryonic genes; expressed anteriorly
|-
| ''exuperantia'' (exu) || Testis and ovary || Reducion of head; defective gastrulation || RNA-binding protein || Needed to transport ''bcd'' mRNA from nurse cells to oocyte
|-
| ''hunchback'' (hb) || See '''Zygotic Anteroposterior Gap Class'''
|-
| ''staufen'' (stau) || Maternal germ line, emryonic central nervous system || Most abdominal segments missing, no pole cells, also head defects || Double-stranded RNA-binding protein || Required for ''bicoid'' mRNA localization and polar granule assembly
|-
| ''swallow'' (swa) || Maternal germ line || Reduction of head; cellularization defects || Rna-binding protein || Required for localization of ''bcd'' mRNA
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Posterior Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''cappuccino'' (capu) || Maternal || Abdominal segments A2-A7 missing; no pole cells || Putative transmembrane receptor || Required for polar granule assembly
|-
| ''nanos'' || Transcription in oocyte and nurse cells. Partial localization to polar granules. Only this localized mRNA is translated. || Absence of abdomen; pole cells normal || RNA-binding protein, translational repressor || Inhibits translation of maternal ''hb'' mRNA and hastens its destruction, hence allows activation of ''kni'' in posterior.
|-
| ''oskar'' (osk) || Maternal germ line || Similar to ''capu'' || || Required for polar granule assembly, localizes ''nos'' mRNA
|-
| '' pumilio'' (pum) || Transcription maternal. Protein probably localized to posterior || Most of abdomen missing; pole cells normal || RNA-binding protein || Recruits ''nos'' protein to ''hb'' mRNA
|-
| ''spire'' (spir) || Maternal || Similar to ''capu'' || Actin-binding protein || Required for polar granule assembly
|-
| ''staufen'' (stau) || See maternal anterior system
|-
| ''tudor'' (tud) || Male and female germ line || Similar to ''capu'' || || Required for pole cell formation
|-
| ''vasa'' (vas) || Transcription in nurse cells and oocyte; mRNA uniform in early embryo. Protein localized in posterior of oocyte, egg, and in pole cells. || Similar to ''capu'' || RNA helicase || Required for pole cell formation
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Terminal Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''NTF-1'' || || || Transcriptional inhibitor || Inhibits transcription of ''hkb'' and ''tll''
|-
| ''torso'' (tor) || Transcription in nurse cells. Transport to oocyte, where protein distributed uniformly in plasma membrane. || Absence of labrum, reduction of head skeleton, absence of A8 and telson; gain of function; suppression of segmentation in thorax and abdomen || Tyrosine kinase receptor, likely receptor for active ''trunk'' protein || Activates ''tll'' ''hkb'' by inhibiting ''NTF-1''
|-
| ''torsolike'' (tsl) || Protein secreted by anterior and posterior ovarian follicle cells probably associates with vitelline envelope near egg poles || Similar to ''tor'' (loss of funct'''i'''on only) || Modifying protein || Generates active form of ''trunk'' near egg poles
|-
| ''Trunk'' (trk) || Maternal mRNA translated in early embryo, protein released into preivitelline space || Similar to ''tor'' || Secreted protein || Probably ligand of ''tor'', after processing by ''tsl''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Anteroposterior Gap Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''empty spiracles'' || Transcription during blastoderm 78-67% EL; later, in cells forming tracheal pits and spiracles || Defects in antennal segment, tracheal system || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies procephalic segments
|-
| ''giant'' (gt) || Initial transcription at preblastoderm stage 82-60% and 33-0% EL; changes later || Defects in or absence of labrum, labium, and abdominal segments || Transcriptional regulator (Leucine zipper) || Activates ''Scr''; represses ''Kr''
|-
| ''huckebein'' (hkb) || Anterior and posterior ends of blastoderm || Defects in terminal body structures and gut || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Specifies terminal structures in concert with ''tll''
|-
| ''hunchback'' (hb) || Maternal mRNA initially uniform; protein forms anteroposterior gradient. Embryonic transcription 100-50% EL and 20-10% EL. Posterior domain long-lasting. || Embryonic: deletion of labium, thorax, aA7/pA8 (PS 13). No pure maternal effect, but if mother and sperm are ''hb''-, then deletion of all mouthparts and thoracic segments and A1-A3, with mirror duplication of abdomen. || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Represses ''kni''; represses ''Kr'' at high level and activates at low level; regulates ''eve''; regulates ''h'', ''run'', ''ftz''; activates ''Antp'' (with ''ftz''); represses ''Ubx''
|-
| ''knirps'' (kni) || Transcription starts at preblastoderm stage forming zone 45-30% EL. Ventral patch and narrow ring form in atnerior by cellular blastoderm stage. || Replacement of A1-A7 by single A-type segment || Transcriptional regulator (zinc finguer) || Represses ''Kr''; regulates ''h'', ''run'', ''eve'', ''ftz''; represses ''Abd-B'' and ''Antp''
|-
| ''Krüppel'' (Kr) || Transcription starts at preblastoderm stage in central zone, eventually expanding to 60-30% EL. Later also posterior patch and patch in head. || Purely embryonic. Head normal, deletion of thorax and A1-A5. Duplicated inverted A6. || Trancriptional regulator (zinc finguer) || Activates ''kni''; represses ''gt''; regulates ''eve''; regulates ''h'', ''run'', ''ftz''; represses ''Scr''; activates ''Antp''; represses ''Abd-B''
|-
| ''orthodenticle'' (otd) || Narrow band (75-92% EL) in anterior blastoderm || Defects in eyes and anterior head parts || Transcriptional regulator (homeodomain, paired domain) || Activated by ''bcd'' and ''tor'', ''otd'' - along with ''ems'' - specifies procephalic segments
|-
| ''tailless'' (tll) || Transcription in termini of preblastoderm embryo || Head skeleton reduced but labrum present. Hindgut, Malpighian tubules absent. || Transcriptional regulator (steroid receptor family) || Activates ''hb''; represses ''Kr''; represses ''kni''; activates ''h''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Pair-Rule Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''even-skipped'' (eve) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes corresponding to parasegments 1, 3, 5, etc., by cellularization stage. Fades during gastrulation. || Abolishes segmentation, giving lawn of denticles. Weak alleles delete odd parasegments. || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''ftz'', ''odd'', ''run''; activates itself; activates ''en''; represses ''wg''; activates ''Dfd''
|-
| ''fushi tarazu'' (ftz) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes corresponding to parasegments 2, 4, 6, etc., by cellularization. Fades during germ band extension. || Deletes even parasegments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates itself; activates ''en''; activates ''Antp''; activates ''Ubx''; represses ''wg''
|-
| ''hairy'' (h) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes + dorsal head patch by time of cellularization. Fades during gastrulation. || Range from deletion of odd parasegments to formation of lawn of denticles. Also loss of labral tooth. Other alleles give extra hairs in adult. || Transcriptional regulator (helix-loop-helix domain) || Represses ''run'', ''ftz''; activates ''eve''
|-
| ''paired'' (prd) || Transcription starts at preblastoderm stage; 8 stripes with dorsal head patch by cellularization. During germ band extension stripes 2-7 split and then fade. || Deletions about 1 segment wide starting in middle of denticle band affecting mainly odd abdominal segments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates ''wg'', ''en''
|-
| ''runt'' (run) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes. After cellularization, patter becomes single-segment stripes, which persist through germ band extension. || Deletions more than 1 segment wide centered on T2, A1, A3, A5, A7, with mirror duplication of what is left || Transcriptional regulator (novel) || Represses ''h'', ''eve''; activates ''ftz''
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Segment Polarity Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''engrailed'' (en) || Transcription starts at blastoderm stage and produces 14 narrow stripes by extended germ band stage, marking the anterior of each parasegment. Expression in posterior compartments of larval imaginal discs || Ventral cuticle a continuous lawn of denticles. Less severe alleles delete even-numbered parasegments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Maintains ''hh'' and indirectly ''wg'' activity; selector gene defining posterior compartment
|-
| ''frizzled'' (fz) || Various imaginal discs || Variable orientation of wing hairs, irregular ommatidia in eye || Seven-pass transmembrane receptor || Receptor for ''wg''
|-
| ''frizzled-2'' (fz-2) || Apparently redundant with ''fz''
|-
| ''hedgehog'' (hh) || Posterior compartments of larval segments and imaginal discs || Posterior compartment replaced with mirror image of anterior compartment || Secreted sinaling molecule (TGF-β super family) || Maintains ''wg'' and indirectly ''en''. defines source of segmental morphogen
|-
| ''patched'' (ptc) || In anterior compartments || Defects in segmentation and eye development || Multipass transmembrane protein || Parto of the receptor complex for ''hh''
|-
| ''smoothened'' (smo) || In anterior compartments || Defects in various tissues including epidermis, wing, and eye || G protein-associated transmembrane receptor || Part of the receptor complex for ''hh''; causes segregation of posterior from anterior compartmente cells
|-
| ''wingless'' (wg) || Transcription starts at blastoderm stage and produces 14 narrow stripes by extended germ band stage, marking the posterior of each parasegment. || Ventral cuticle a continuous lawn of denticles, indicating deletion of 3/4 of each segmental unit || Secreted signaling molecule (''Wnt'' family) || Maintains ''en''
|}

{| border="1"
|+ '''Homeotic Genes and Related Genes'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''abdominal A'' (abd-A) || Trancribed in PS 7-13 of extended germ band || Transforms PS 7-9 to PS 6 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Ubx''; activates ''wg'', ''dpp''; specifies a.p. body pattern
|-
| ''Abdominal B'' (Abd-B) || Transcribed in PS 10-14 of extended germ band || Transforms PS 10-14 to PS 9 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Ubx''; specifies a.p. body pattern
|-
| ''Antennapedia'' (Antp) || Transcription starts in blastoderm; mainly PS 4, also in posterior parasegments. Thoracic imaginal discs. || Transforms PS4, 5 to PS 3 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''Deformed'' (Dfd) || Transcription in preblastoderm stage in PS 1; later also PS 0. Eye-antennal disc. || Deletion of mandibular and maxillary segments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates itself; specifies a.p. body pattern
|-
| ''labial'' (lab) || Transcription in extended germ band anterior to cephalic furrow and in posterior midgut || Deletes labial derivatives || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''Polycomb-group'' (Pc-G) || || Multiple homeotic transformations || || Maintains inhibition of inactive homeotic genes
|-
| ''Sex combs reduced'' (Scr) || Transcription in PS 2 in blastoderm; later PS 3 epidermis and mesoderm, and abdominal ganglia || Transforms PS3 to PS 4 and PS2 to PS1 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''trithorax-group'' (trx-G) || || Multiple homeotic transformations || || Maintains inhibition of active homeotic genes
|-
| ''Ultrabithorax'' (Ubx) || Transcrition starts in cellular blastoderm, mainly in PS 6, but at lower levels in PS5-13; more in even-numbered parasegments. Neuromeres; metathoracic discs. || Transforms PS 5, 6 to PS 4 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Scr''; represses ''Antp''; activates itself; activates ''wg'', ''dpp''; selector gene
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Dorsoventral System'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| '' cactus'' (cac) || Maternal; action in embryo || Ventralizing || Genetic regulator || Inhibits entry of ''dl'' protein to nuclei
|-
| ''dorsal'' (dl) || Transcription in nurse cells; uniform mRNA in oocyte and egg; ventral-dorsal gradient of protein in preblastoderm nuclei || Embryos become tubes of dorsal epidermis. Some haploinsufficient alleles. || Genetic regulator || Activates ''twi'', ''sna''; represses ''zen'', ''dpp''; morphogen for dorsoventral pattern
|-
| ''easter'' (ea) || Maternal, released from embryo into preivitelline space || Similar to ''dl''. Also weak ventralizing gain-of-function alleles. || Serine proteases || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''gastrulation defective'' (gd) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || Serine protease || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''gurken'' (grk) || Maternal; needed in oocyte || Ventralizing; affects eggshell and embryo || Growth factor-like || Ligand for top protein; dorsalizing signal from oocyte
|-
| ''nudel'' (ndl) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Protease activity || Contributes to ventral polarizing activity
|-
| ''pelle'' (pll) || Maternal, acts in embryo || Similar to ''dl'' || Protein kinase || Signal transduction from ''Tl'' to ''cac''
|-
| ''pipe'' (pip) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Glycosaminoglycan-modifying enzyme || Localized contribution to ventral polarizing activity
|-
| ''snake'' (snk) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || Serine protease || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''spätzle'' (spz) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || || Ligand for ''Tl'' protein
|-
| ''Toll'' (Tl) || Maternal; uniform distribution of protein in egg plasma membrane || Similar to ''dl''. Gain-of-function alleles ventralize, producing denticle belts all around. || Receptor tyrosine kinase || Activated ventrally by ''spz''; releases ''dl'' from ''cac'', permits ''dl'' to enter nucleus
|-
| ''torpedo'' (top) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''grk'' || Growth factor receptor || Receptor for ''grk'', inhibits ''pip'', thus orienting ventral polarizing activity.
|-
| ''tube'' (tube) || Maternal; acts in embryo || Similar to ''dl'' || Adapter protein || Signal transduction from ''Tl'' to ''cac''
|-
| ''windbeutel'' (wbl) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Enzyme associated with endoplasmic reticulum || Contributes to ventral polarizing activity.
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Dorsoventral Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''decapentaplegic'' (dpp) || Transcription in preblastoderm on dorsal side, curling around to ventral at poles. (see also '''Compartment-Related Genes''') || Loss of amnioserosa and reduction of dorsal epidermis. Viable alleles produce multiple defects in imaginal disc derivatives. || Signaling molecule (TGF-β homologue) || Forms morphogen gradient with maximum dorsally. Promotes amnioserosa and epidermis; inhibits neurogenesis
|-
| ''short gastrulation'' (sog) || Protein synthesized blastoderm cells in ventral || Dorsalizes embryo || Plasma membrane protein || '''antagonizes''' ''dpp''; specifies d.v. pattern
|-
| ''snail'' (sna) || Transcription in mid-ventral strip of prospective mesoderm || Loss of mesoderm || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Inhibits expression of other d.v. patterning genes in prospective mesoderm.
|-
| ''tolloid'' (tld) || Released from blastoderm cells into extracellular space || Ventralizes embryo || Metalloprotease || Cleaves extracellular domain of ''sog'', especially in presence of ''dpp''; specifies d.v. pattern
|-
| ''twist'' (twi) || Transcription in mid-ventral strip of prospective mesoderm and mesectoderm || Loss of mesoderm || Transcriptional regulator (basic helix-loop-helix domain) || Specifies dorsoventral pattern
|-
| ''zerknüllt'' (zen) || Transcription in preblastoderm stage on dorsal side || Loss of amnioserosa and optic lobe || Transcriptional regulator (homeodomain) || Promotes amnioserosa formation
|}

{| border="1"
|+ '''Compartment-Related and Other Genes'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''Achaete'' (Ac) || Proneural cells, prospective sensory bristles || Lack of sensory bristles and neurons || Transcriptional regulator (bHLH domain) || Many functions, incl. patterning around d.v. compartment boundary in wing
|-
| ''apterous'' (ap) || Dorsal compartments of wing and haltere discs || Wings and halteres missing || Transcriptional regulator (homeodomain) || Required for wing (haltere) outgrowth; selector gene
|-
| ''cubitus interruptus'' (ci) || Anterior compartment of each segment || Disturbed segmentation || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Activates ''wg'' and ''dpp'' in response to ''hh'' signaling
|-
| ''decapentaplegic'' (dpp) || In strip of cells anterior to a.p. compartment boundary (see also '''Zygotic Dorsoventral Class''') || Abnormal wing patterns || Secreted protein (TGF-β superfamily) || Morphogen for anteroposterior pattern of wing and haltere
|-
| ''Distalless'' (Dll) || Expressed around leg dorsoventral compartment boundary || Loss of legs and antennae || Transcriptional regulator (homeodomain) || Required for outgrowth of legs and antennae
|-
| ''fringe'' (fng) || Dorsal wing and haltere compartments || Loss of wings and halteres || Secreted protein || Juxtaposition of cells with and without ''fringe'' activates ''wg+''
|-
| ''hedgehog'' (hh) || see '''Zygotic Segment Polarity Class'''
|-
| ''optomotor-blind'' (omb) || Prospective CNS and epidermal regions || || Transcriptional regulator || Target of ''dpp'' in patterning of wing and abdominal segments
|-
| ''scute'' (sc) || Similar to ''Achaete''
|-
| ''spalt'' (sal) || In endoderm and parts of wing imaginal disc || || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Target of ''dpp'' in wing patterning
|-
| ''vestigial'' (vg) || In prospective appendages of wing and haltere imaginal discs || Loss of wings and halteres || Putative transcriptional regulator || Specification of wing and haltere as opposed to thorax
|}

== Ver também ==
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-29T00:02:33Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de estudos com mutantes que tiveram as regiões próximas do promotor de ''hb'' "recortadas", podendo-se, assim, estudar e verificar quais regiões seriam realmente fundamentais para a transcrição de ''hb''. (vide ch.3, p.53, figura 3.1)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T23:55:04Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
: Através de estudos com mutantes que tiveram as regiões próximas do promotor de ''hb'' "recortadas", podendo-se, assim, estudar e verificar quais regiões seriam realmente fundamentais para a transcrição de ''hb''. (vide ch.3, p.53, figura 3.1)

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T23:40:22Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
*Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T23:39:46Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
: *Vantagens:
**Facilidade para se ver a expressão de genes;
**Mesmo genes que são expressos na fase embrionária podem ser vistos após algum tempo, pois, por exemplo, a β-Galactosidase, por ter uma meia-vida relativamente longa, pode ser visualizada mesmo após o "desligamento" do gene que foi alvo do repórter.
*Desvantagens:
**O padrão de expressão pode ser influenciado por seqüencias próximas ao local de inserção do repórter.

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T23:33:12Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
: Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T23:13:50Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS
*Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim. Mutantes ''bicoid-'' não apresentam nenhum gradiente de ''hb''. Colocando-se uma ou mais doses de ''bicoid'' no embrião, ''hb'' é expresso de acordo com quantas doses foram utilizadas, indicando essa relação entre ''bcd'' e ''hb''.

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T22:32:24Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Um site ainda não lido ...
http://www.rc.unesp.br/ib/biologicas/expre.html

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.
: Holometábolos: (metamorfose completa)
Possuem 2 fases ativas distintas no ciclo de vida: larva e adulto
larvas: Alimentam-se e armazenam reservas que serão utilizadas na fase pupal
Adultos: Se reproduzem

: Hemimetábolos:(metamorfose incompleta)
As fases são diferentes somente no tamanho e no fato da juvenil (ninfa) não se reproduzir.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:Hormônio Juvenil e ecdisona (esteróide)

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
: O ''hormônio cerebral'' controla a síntese e liberação de ''Ecdisona''.
: O ''Ecdisona'' atua diretamente sobre os tecidos do corpo, causando diferenciações.
: Enquanto o ''hormônio juvenil'' está presente no animal ele só cresce e não torna-se adulto, quando os níveis de ''hj'' diminuem o animal passa de ninfa para adulto ou de larva para pupa. (existem inseticidas baseados em hormônios juvenis para impedir a reprodução ).
: O ''hormônio de Eclosão'' é responsável pela passagem de pupa para adulto.

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
: Pufes são regiões onde genes se duplicaram repetidamente, formando saliências de DNA.

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
: O Genoma de Drosophila é formado por aproximadamente 132 milhões de pb e 13.767 genes. Com 4 cromossomos. O sexo é determinado pelo cromossomo X , diferente dos seres humanos que é pelo cromossomo Y. (alguem pode explicar melhor a parte do SEXO? - Opa!)

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
: Com os cromossômos politênicos é possível ver quando um gene está sendo mais expresso.

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:Aberrações:
*Podem ser numéricas ou estruturais.
**Numéricas: Como o nome diz, é quando se tem maior ou menor número de cromossomos.
**Estruturais: Durante a prófase as quebras dos cromossomos são freqüentes e podem não se juntarem ou se ligarem de maneira errada.
*Mutações Puntuais:São mutações que envolvem apenas um par de nucleotídeo.(deleção, insersão ou substituição)

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:LETAIS
*Mutações que são letais mas em certas condições (normalmente com uma temperatura mais baixa) os animais sobrevivem, assim é possível fazer o estudo do mutante.

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T18:33:07Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidência de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T18:32:18Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) | Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presentes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidencia de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T18:31:21Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
: Produzindo-se uma fêmea mutante ''bicoid-'' homozigota, observa-se que todos os seus ovos produzem embriões inviáveis, mesmo os fertilizados com esperma ''bicoid+''. Fica evidente que todo o protudo genético necessário para o desenvolvimento é depositado no ovo pela mãe.

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
: No caso do ''esc'', tanto o pai quanto a mãe podem depositar ''esc'' no ovo para que este se desenvolva normalmente. Já com ''Notch'', isso não é verdade. É necessário que a mãe e o pai depositem os produtos no ovo. Ambas são relacionadas à mutações de "efeito materno". (vide MoaF: ch.1 p.5~6)

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
: Porque são necessários 100%. (by Rafael) / Porque os 20% restantes incluem genes cujos produtos devem estar presesntes em um pequeno subconjunto de células. (by Japonês)

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
: Para a determinação dos eixos principais do embrião. (by Japonês)

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
: São precursoras das células germinativas. (?) ''oskar'' e ''vasa''.

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
: No pólo posterior do ovo. (?) RNA, "plasma polar". (?) (ch.1, p.9)

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
: Os núcleos se movem para a superfície do embrião, assumem uma forma elíptica e começa a formação das membranas (que não separam as células), a separação se completa com o fim da formação da blástula. (by Japonês) Não, mesmo após a gastrulação, há evidencia de que algumas células estão conectadas via "yolk" umas com as outras.

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
: Através do mapeamento da expressão gênica.

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
: Há fatores anteriores e posteriores, cuja interação determina a região central do embrião. (by Japonês)

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
: Mostraram que o citoplasma posterior não é um simples determinante, ele tem efeito quantitativo. (by Japonês)

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
: A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
: Elas têm efeito quantitativo. (by Japonês)

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
: Ele é deslocado em direção ao pólo posterior. Sim, pois ambos representam um efeito quantitativo do ''bicoid''. (by Japonês)

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
: Ligado à proteínas ancoradas na membrana. Identificando a região do RNA que se liga à proteína. (by Japonês)

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA. | ''swallow'': totalmente difuso ; ''exuperantia'': intermediário ; ''staufen'': parcialmente concentrado. (by Japonês)

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
: Tempo de meia-vida reduzido. (by Japonês)

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
: ''nanos''. Fazendo experimentos de resgate em ovos ''nanos-'', inserindo nele citoplasma de "nurse cells" com as outras mutações. (by Japonês)

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
: mRNA e a proteína só são produzidos no pólo anterior. (by Japonês)

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
: A evolução age somente localmente, conseqüentemente, soluções globais mais econômicas não são possíveis. O gene ''nanos'' é necessário somente para impedir a síntese de mRNA de origem materna. (by Japonês)

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''
: Células foliculares ativam receptores (''Toll'') na região ventral que vai dar origem ao gradiente de ''dorsal''. (by Japonês)

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''
:

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T15:31:58Z

Sonic Orochi:

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

Devido ao tamanho grande do artigo, ele foi dividido em duas partes, a primeira com noções de biologia geral do desenvolvimento e de vertebrados (de "Benefícios do Sexo e Meiose" até "Diversificação celular e memória celular") e a segunda sobre o desenvolvimento da Drosófila (de "Biologia da Drosófila" até "Alocação celular e genes seletores de Drosófila").

Esta é a segunda parte.

[[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* Lawrence, [[The Making of a Fly]].

== Biologia da Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===

=== Referências ===
<nowiki>*</nowiki> http://www.qualibio.ufba.br/026.html

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
: Vide figura 12.1. [[Image:cycle.jpg|thumb|Figura 12.1 - wtf?]]
: ''"No processo da metamorfose completa (terceiro padrão) ocorre a presença de instars larvais, um instar larval modificado ou pupa e a fase adulta. O crescimento é restrito ao período após cada muda larval. As larvas são estágios alimentadores especializados e apresentam os precurssores das estruturas adultas na forma de botões imaginal ou "disco imaginal" (ninhos de células separadas dos tecidos funcionais da larva) enquanto a pupa é um estágio durante o qual são suspensas a locomoção e a alimentação devido a grande reorganização da estrutura do corpo. Já os adultos são especializados para a dispersão, obtenção de recursos e a reprodução."'' (vide *)

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
: A "vantagem" é que no primeiro estágio do desenvolvimento holometábolo, o indivíduo ocupa um nicho diferente do referente ao adulto, ampliando a área de adaptação e diminuindo a competição por alimento, habitat e etc.

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
: Delete um gene, verifique qual a modificação no mutante e é descreva qual seria a suposta ação daquele gene de acordo com o fenótipo do mutante. Rinse and repeat.

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

== Genética e embriogênese de Drosófila ==

=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
: A formação do padrão dos animais é definida pelos sistemas a.p., d.v. e terminal. (?)

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
:

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
: Ocorrência de "extra sex combs" (duh) e, uma larva ''esc''- tem todos os seus parasegmentos substituídos pelo parasegmento 13. (vide MoaF: ch.1 p.5)

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
: Segmentos são subdivididos em segmentos da cabeça (3 - C1~C3), do tórax (3 - T1~T3) e abdominais (8 - A1~A8). Os 14 parasegmentos são os que formam os segmentos. (...)

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
:

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
:

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
:

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
:

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
:

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
:

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
:

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ==
=== Resumo ===
=== Bibliografia ===
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
:

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
:

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
:A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
:

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
:

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
:

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA.

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
:

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
:

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
:

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
:

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte]]
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Xjump

2006-11-28T14:10:05Z

Sonic Orochi: /* Hall da Fama */

xjump. Pronuncia-se "ékis djãmpi". "x" vem do fato de que o bonequinho que você controla se parece, realmente, com uma letra X. "jump" porque, sim, ele pula.

== O que é ==
[[Image:xjump.png|thumb|Screenshot do jogo "xjump"]]

Imagine-se em uma torre de paredes de blocos azuis com um número de andares em blocos vermelhos infinito. Vista uma calça verde colada (vide [[Saulo]]) e um suéter vermelho (também colado). Agora corte seu cabelo estilo trote pós-vestibular-bem-sucedido.

De repente, a torre começa a desmoronar (ou o chão a subir? Ou os andares a afundar? Tudo depende da sua imaginação...) Qual a primeira coisa que lhe parece viável e plausível a se fazer? Você olha o nome do jogo e diz: '''PULAR'''! E não é só '''"pular"''', é '''"pular"''' de maneira doentia: vale girar o corpo, rodopiar, cair de cabeça para baixo, bater na parede... e tudo isso em um ritmo cada vez mais rápido e frenético.

Então começa sua jornada... rumo ao topo!

== Comandos ==

Não são nada complexos. Se você tiver problema em alcançar 50 andares, [[suicide is your only option]].

*Seta para Esquerda: move o boneco para a esquerda.
*Seta para Direita: move o boneco para a (tantantan!) direita.
*Seta para Cima: move o boneco para cima? Não... simplesmente faz ele '''PULAR'''.
**Muitos jogadores do top score deixam esta tecla pressionada e conseguem scores espetaculares como 1862.
*Seta para Baixo: mata, aleatoriamente, um motoboy em São Paulo.
*Shift+Q: sai do jogo

É possível redefinir as teclas usando a opção ''-keymap arquivo'', mas até agora o formato do ''arquivo'' permanece desconhecido.

[[Image:xjump_jnb3.png|thumb|left|Tema baseado em '''[[jump'n'bump]]''']]

== Temas ==
O ''xjump'' foi revolucionado após a descoberta de que é possível implementar temas personalizados pelo usuário. Para isso, é necessário criar um arquivo '''xpm''' adequado e rodar
xjump -graphic arquivo.xpm
Por exemplo, à esquerda pode-se ver um dos temas mais populares, o '''jnb3''', baseado no [[jumpnbump|Jump & bump]]. Os arquivos podem ser encontrados em ''/home/vitor/xj'' e em ''/home/cmarin/xjump'', com temas variando desde '''Ice Climbers''' até '''Sonic''' e '''Mario'''!

Arquivos '''xpm''' podem ser editados usando o [[gimp]], apesar de não ser uma tarefa muito simples.

== Estratégia ==

À primeira vista, o jogo parece não ter '''atrito''', isso se deve à composição quasi-cristalina dos andares. Isso lhes confere uma superfície mais "lisa" do que o teflon.

Acostumando-se com esse pequeno deslize (com o perdão do drogadilho - vide [[Rafael]]) físico, você terá de pular para o próximo andar.

Iniciantes ([[newbies]]) vão andar, parar, pular, tentar controlar o pulo, e cair.

Experts ([[pros]]) se utilizam de técnicas que consistem, basicamente, em correr um pouco e pular, alcançando assim cerca de 2 a 4 andares de altura. Deve-se masterizar esta técnica para não cair na agonia do [[suicide is your only option]].

== Rating ==

Gráficos: 2/10

Jogabilidade: 3/10

Replay Ability: 11/10

Diversão: 10/10 - independe se você tem coordenação motora ou não (ver o caso do [[Fena]] que tem a pontuação de 510).

== Curiosidades ==

*Felipe da [[T15]] disse que viria para o CM, mesmo após deixar o curso, exclusivamente para jogar xjump. Não se sabe se realmente vai cumprir o que disse.

*Daniel, também da [[T15]], foi o pioneiro de sua turma a descobrir este jogo. Conseguindo scores cada vez maiores, incentivou os outros a jogar e, com isso, melhorou a média da pontuação do top 20. O menor score atual é de 206. O antigo era de cerca de 50.

== Hall da Fama ==

Os grandes Mestres do xjump [[ceeceêmico]]. Atualizado em 19:52, 17 Novembro 2006 (BRT)

# 1865 [[Saulo Henrique Pires de Oliveira]] ([[T15]])
# 1862 [[Gustavo T F]] ([[T10]])
# 1322 [[Vitor Eiji Justus Sakaguti]] ([[T14]])
# 1080 [[Vitor Ferreira Onuchic]] ([[T16]])
# 1034 [[Rafael Fuess Nishimura]] ([[T16]])
# 980 [[Yul Otani]] ([[T14]])
# 698 [[Lucas]] ([[T12]])
# 558 [[Renato Mendes Coutinho]] ([[T14]])
# 510 [[Renato Schattan Pereira Coelho]] ([[T15]])
# 452 [[Rafael Prado Proenca]] ([[T15]])
# 429 [[Felipe Augusto Nunes Ferraz]] ([[T15]])
# 372 [[fernando henry meirelles]] ([[T15]])
# 356 [[Rodrigo Roque Dias]] ([[T12]])
# 348 [[William Seiti Mizuta]] ([[T16]])
# 347 [[Thiago Augusto Miranda Delatorre]] ([[T12]])
# 326 [[Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro]] ([[T15]])
# 298 [[Lucas Antunes Maciel Mussnich]] ([[T16]])
# 294 [[Guilherme Dias Simões]] ([[T16]])
# 291 [[Alex Kunze Susemihl]] ([[T14]])
# 286 [[Carlos Alberto de Moraes Marin]] ([[T15]])

== Clones e afins ==

O xjump, assim como todo clássico, tem seus clones, como o SDL jump, que permite jogar em até 4 pessoas no mesmo computador! Um outro clone é o xjumpx.

== Ver também ==

* [[Diversões do CM]]
* [[Frozen Bubble]]

[[Categoria: Diversões do CM]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T13:53:53Z

Sonic Orochi:

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T13:29:37Z

Sonic Orochi:

Arquivo:Cycle.jpg

2006-11-28T13:13:12Z

Sonic Orochi: ???

???

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Segunda Parte

2006-11-28T13:06:45Z

Sonic Orochi:

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte

2006-11-28T02:49:03Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* [[The Cell]]
* [[Gilbert]]
* O outro livro

== Primeira Parte ==
=== Benefícios do Sexo e Meiose ===

==== Resumo ====
* A reprodução sexuada possiblita a recombinação de genes e cromossomos, o que permite o fluxo de caracteres vantajosos na população favorecendo sua sobrevivência.
* A meiose consiste em:
*# Duplicação de cada cromossomo (formação das cromátides-irmãs).
*# Pareamento dos cromossomos maternos e paternos duplicados.
*# Crossing-over.
*# Separação aleatória de cada um dos cromossomos maternos e paternos entre as duas células.
*# Divisão I.
*# Separação das cromátides-irmãs.
*# Divisão II.
* Na meiose, o pareamento dos cromossomos duplicados homólogos se dá com a formação de uma estrutura protéica, o complexo sinaptonêmico, que de alguma forma serve para espaçar os eventos de recombinação ao longo dos cromossomos.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula02.ppt PowerPoint Benefícios do Sexo e Meiose]
* [[The Cell]], cap.20 - Células Germinativas e Fecundação.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula02.pdf].

'''01. Esquematizar o ciclo de vida de um animal que se reproduz sexuadamente e comparar com aquele de um animal que se reproduz assexuadamente.'''

[[Imagem:Reprodução.gif]]

'''02. Discutir o que distingue um organismo com reprodução sexuada de um com reprodução assexuada em relação a possibilidade de adaptação ao meio.'''
: A reprodução sexuada tem sido favorecida pela evolução porque em ambientes variáveis, a recombinação gênica aumenta a probabilidade de se produzir ao menos algum descendente capaz de sobreviver. Além disso, ela permite a eliminação de mutações prejudiciais e a combinação de mutações vantajosas raras.
: Já os organismos de reprodução assexuada não contam com essa vantagem, pois seus descendentes são idênticos aos seus genitores: têm as mesmas caraterísticas e expressões gênicas.

'''03. Uma vez que a biomassa de bactérias no mundo é muito maior que a de animais multicelulares, elas são os organismos dominantes atualmente. No entanto elas se reproduzem assexuadamente. Como voce explica o sucesso evolutivo desses seres vivos?'''
: O fato de que esses organismos têm uma rápida e numerosa reprodução ajudou no seu sucesso evolutivo: caso fosse necessário mudar algo em seus genes, frente à alguma adversidade do meio, a chance de ocorrer uma mutação benéfica é maior devido à essa rápida forma de reprodução. Dessa forma, esses indivíduos se adaptavam bem a praticamente todo tipo de ambiente.

'''04. A afirmação: "organismos assexuados permaneceram simples e primitivos" é correta?'''
: Não sei, mas está escrito no The Cell... (está? Será que ninguém pode dar uma "palhinha"? :D)

'''05. Citar as evidências para a teoria cromossômica da herança e discutir sua relação com o mecanismo de meiose.'''
: Talvez a evidência mais perceptível seja a do fato que os descendentes possuíam (herdavam) características de um dos pais ou uma combinação de ambos. A meiose se relaciona com esses acontecimentos devido à sua atuação no processo de formação dos gametas, de tal forma que o descendente recebe metade dos genes do pai e metade, da mãe.

'''06. Se você tivesse que provar que a meiose não é uma mitose sem fase S, qual abordagem experimental voce usaria?'''
:

'''07. O produto da Meiose I são células com a mesma quantidade de DNA de uma célula diplóide, mas a metade do número de cromossomos. Justifique esta afirmação.'''
: A divisão I da meiose gera 2 células, cada uma com a versão paterna ou materna de cada cromossomo, recombinadas e duplicadas (cromátides-irmãs). A separação das duas cópias se dá na divisão II. Portanto, embora tenha a quantidade de DNA de uma célula diplóide devido à duplicação, as cópias tem a mesma origem e estão na forma de cromátides-irmãs, o que dá efetivamente um cromossomo de cada tipo.

'''08. Relacionar "crossing-over" cromossômico, recombinação genética e quiasmas. Cite evidências experimentais.'''
:

'''09. Os machos dos mamíferos apresentam dois cromossomos sexuais (X e Y). Como eles pareiam durante a meiose?'''
: O Y e o X se pareiam devido à homologia de suas extremidades.

'''10. A prófase I da meiose pode durar anos. Quais as conseqüências disso para os cromossomos dos gametas resultantes? Baseado nos dados que voce tem, tente explicar esses fatos.'''
: Pode levar a aneuploidias (anomalias no número de cromossomos), por exemplo a trissomia do cromossomo 21 causando a síndrome de Down. Isso pode ter várias causas como falhas aleatórias na separação dos cromossomos e na formação do fuso, contaminação viral ou influência hormonal (idade da fêmea).

=== Gametas ===

==== Resumo ====
* A determinação do sexo nos mamíferos é determinado pelo gene SRY, presente no cromossomo Y, que induz as células das gônadas a se transformarem em células de Sertoli, que inibem o desenvolvimento de caracteres femininos, promovem o desenvolmento dos orgãos masculinos e induzem as células germinativas primordiais a se comprometerem a espermatozóides.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula04.ppt PowerPoint Gametas]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula04.pdf].

'''11. Descrever a estrutura do óvulo e a função de suas partes.'''
: Os oócitos são células esféricas ou ovóides especializadas para o desenvolvimento do embrião, por isso, a não ser nos mamíferos, que obtêm seus nutrientes para o crescimento pela placenta, os oócitos são células gigantes contendo grandes reservas de nutrientes (lipídeos, proteínas e polissacarídeos) na forma de gema.
: O oócito é revestido por uma matriz de glicoproteínas chamada de camada vitelina, ou nos mamíferos de zona pelúcida. Os oócitos costumam ter também grânulos corticais, vesículas secretoras especializadas que se situam no córtex (região do citoplasma logo abaixo da membrana plasmática), que têm a função de alterar o revestimento do oócito evitando a poliespermia.

'''12. Descrever os estágios de maturação do óvulo.'''
: As ''células germinativas primordiais'' migram para os ovários em desenvolvimento e tornam-se ''ovogônias''. Após várias mitoses, as ovogônias se transformam em ''oócitos primários'' e se mantêm em prófase durante um longo período, enquanto crescem, ganham revestimento e acumulam ribossomos, mRNA e proteínas. Na maturação ele se divide em ''oócito secundário'' e primeiro corpúsculo polar. Em muitas espécies, incluindo a nossa, ele permanece assim até a fecundação, quando então completa a meiose (liberando o segundo corpusculo polar (e o terceiro?)) e inicia o desenvolvimento embrionário.

'''13. Quais as adaptações dos óvulos para atingir o tamanho final. Por que os óvulos precisam ser tão grandes?'''
: As adaptações variam de especie para espécie, algumas possuem nurse cells outra células foliculares que sintetizam as moléculas necessárias para o óvulo, mas em todas elas as divisões que o óvulo sofre são assimétricas, de forma a concentrar grande parte do citoplasma.
:Uma maneira é atrasando a conclusão da primeira divisão meiótica para crescer, assim ele fica com o grupo de cromossomos diplóides em duplicata, com mais DNA disponível para síntese de RNA.
:Os óvulos precisam ser grande para sustentar a alta taxa de divisão celular do zigoto.

'''14. Qual o destino dos corpúsculos polares nos mamíferos?'''
: Segundo o [[Alberts]]: "Por fim, degeneram."
: Segundo o [[Winter]]: "São perdidos."
: Segundo o [[Rafael (T15)|Rafael]]: "Eles somem, desaparecem, escafedem-se."
: OBS: Segundo a Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Polar_body] os corpúsculos polares secundários podem ser fecundados.

'''15. Na ovogênese dos insetos não existem corpúsculos polares. Qual o destino das células que não originam ovócitos?'''
: Elas se tornam nurse cells (células acessório). Veja [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.figgrp.3726 esta figura] e tudo se resolverá.

'''16. Descrever a estrutura de um espermatozóide de mamífero.'''
: Procura no The Cell que voce acha. Mais especificamente aqui [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bookres.fcgi/mboc4/ch20f25.gif]. E na Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Complete_diagram_of_a_human_spermatozoa.svg] para ainda mais detalhes.
'''17. Por que o espermatozóide não possui Golgi e o óvulo sim?'''
: Porque ele não precisa de golgi, visto que a sua função é levar o DNA até o ovulo. O óvulo tem golgi porque o zigoto precisa de golgi, e como o espermatozoide não tem... :P

'''18. Qual o papel da peça mediana no comportamento do espermatozóide?'''
: A peça mediana contém a mitoncondria do espermatozoide, que depende de ATP para a sua locomoção. Portanto, a peça mediana determina, em grande medida, a velocidade de locomoção do espermatozoide.

'''19. Se o espermatozóide só se diferencia após a segunda divisão meiótica, quando a célula é haplóide, como mutações recessivas que afetem esse passo não se manifestam em indivíduos heterozigotos?'''
: Eles se diferenciam com os citoplasmas fundidos, então, embora já sejam haplóides nesta fase, podem trocar RNAs e proteínas entre si, eliminando assim as implicações negativas da haploidia.

'''20. Idealize uma abordagem experimental para mostrar que a sua resposta ao objetivo anterior é verdadeira.'''
:

=== Fertilização ===

==== Resumo ====
* O espermatozóide passa por mudanças fisiológicas no trato reprodutor feminino que o capacitam a fertilizar o óvulo (capacitação), estas mudanças envolvem a produção de cAMP e o aumento da mobilidade espermática.
* Chegando lá, o espermatozóide deve se ligar à zona pelúcida, o que dispara a ''reação acrossomal'', criando o caminho para que chegue à membrana. Ao se ligar na membrana, o espermatozóide se inclina (provavelmente anda um pouquinho) e começa a fusão dos citoplasmas, a membrana se despolariza e é disparada uma onda de Ca2+ que ativa a reação cortical (envolvendo os grânulos corticais do óvulo) e o desenvolvimento do zigoto (primeira mitose) (ver slide 12).
* Há dois mecanismos principais de bloqueio à poliespermia: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá pela onda de Ca2+ liberando os glânulos corticais (reação cortical) que lisam as ZP2 e hidrolisam os açúcares das ZP3.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula06.ppt PowerPoint Fertilização]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula06.pdf].

'''1. No que consiste a capacitação do espermatozóide?'''
: A capacitação consiste numa porção de mudanças fisiológicas espécie-específicas que ocorrem no trato reprodutor feminino e tornam o espermatozóide competente para fertilizar o óvulo. Espermatozóides não capacitados não alcançam o óvulo. Pode-se imitar a capacitação ''in vitro'' usando uma solução de cálcio, bicarbonato e albumina. Entre as alterações importantes da capacitação estão:
:* Entrada de íons bicarbonato ativando a adenilil-ciclase, que produz cAMP e induz às diversas outras modificações.
:* Alterações da membrana e do metabolismo, aumentando a mobilidade espermática:
::* A remoção de colesterol pela albumina aumentando a fluidez da membrana.
::* Perda de algumas proteínas e carbohidratos na superfície (talvez eles bloqueiem o reconhecimento com a zona pelúcida).
:* Aumento da carga negativa do potencial de membrana (hiperpolarização) pela perda de potássio (isso poderia causar a entrada de cálcio, o que poderia ser importante na produção de cAMP e na facilitação dos eventos de fusão do acrosssomo).
:* Fosforilação de algumas proteínas.

'''2. Qual a função da zona pelúcida?'''
: Proteção contra choques mecânicos e servir de barreira para espermatozóides de outras espécies.

'''3. A zona pelúcida é composta de três polipeptídeos. Faça um esquema da organização deles, indicando a função de cada um.'''
: ZP1, ZP2 e ZP3. Para o esquema, ver slide 33, da apresentação desta aula.

'''4. Como eles polimerizam para formar a zona pelúcida?'''
: Hum, isso é bem chato, mas se quiser mesmo saber, veja o slide 5-10 desta aula.

'''5. Qual a função intracelular da galactosil-transferase? (ver Alberts ou Voet).'''
: Ela age no Golgi das células, transferindo galactose (galactosilando) para as glicoproteínas que serão levadas para a membrana plasmática.

'''6. Pelo que voce sabe sobre ZP3, como voce impediria a fertilização de um óvulo pelo espermatozóide?'''
: Usando alguma protease que clive o açucar que está ligado ao ZP3 ou um anticorpo.

'''7. Por que mecanismos o óvulo impede a poliespermia?'''
: Há dois mecanismos principais: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá por uma onda de Ca2+ ativando o desenvolvimento do oócito e liberando os glânulos corticais (reação cortical).

'''8. Qual o papel do Ca2+ no bloqueio à poliespermia?'''
: Ele é o sinal de início da reação cortical, isto é, a liberação dos grânulos corticais que altera a zona pelúcida impedindo a ligação dos outros espermatozóides.

'''9. O que contêm os grânulos corticais?'''
: Proteases de ZP2 e enzimas de hidrólise dos açúcares de ZP3, entre outras coisas.

'''10. Por que salamandras que se reproduzem partenogeneticamente ainda precisam de espermatozóides para ativar seus óvulos diplóides?'''
: Porque para completar a primeira divisão celular após a fecundação o óvulo precisa do centrossomo que é doado pelo espermatozóide.

=== Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo ===

==== Resumo ====
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08a.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 1]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08b.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 2]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08c.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 3]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula08.pdf].

'''1. Quais as três principais fases da embriogênese?'''
: Blastula, gastrula e organogenese.

'''2. Quais os três principais eixos do corpo e como eles se relacionam com a distribuição assimétrica de vitelo no ovo com clivagem holoblástica dos anfíbios?'''
: Anterior-posterior, dorsal-ventral e medio-lateral. A distribuição assimetrica de vitelo no ovo origina o eixo anterior-posterior.

'''3. Descreva como o espermatozóide de X. laevis estabelece o segundo eixo de assimetria no ovo.'''
: O ponto de entrada do espermatozoide provoca uma rotação na camada externa do citoplasma em relação a parte interna, o que gera uma assimetria na célula que origina o eixo dorsal-ventral.

'''4. A taxa de mitoses durante as primeiras 7h da embriogênese de X. laevis é muito maior que em tecidos adultos. Devido a isso a replicação do DNA tem que ser muito mais rápida. Sabe-se no entanto que a DNA polimerase funciona a mesma velocidade, seja em blastômeros seja em células do indivíduo adulto. Como isso é possível?'''
: Com uma maior concentração de DNA polimerases, visto que o DNA de eucariotos possuem várias origens de replicação, permitindo que várias DNA polimerases trabalhem em paralelo. (Eu não tenho certeza se a resposta é essa mesma, correções são bem vindas)

'''5. Como se forma o blastoceloma?'''
: Junções celulares isolam o embrião do meio externo, Na+ é bombeado para dentro e a água entra por osmose.

'''6. Descreva a gastrulação em ouriço-do-mar.'''
: Tem no The Cell.

'''7. Na gastrulação duas novas camadas germinativas se formam. Quais são elas e como isso ocorre?'''
: Mesoderme e endoderme. Ocorre uma involução da ectoderme.

'''8. O que é um mapa do destino no embrião?'''
: Trivial.

'''9. Qual o papel do lábio dorsal do blastóporo e como Mangold e Spemann mostraram
que ele continha o Organizador?'''
: O lábio dorsal é a origem do sinal que coordena tanto a gastrulação quanto o padrão de especialização dos tecidos ao redor. Eles mostraram retirando o lábio de um embrião e implantando em outro embrião da mesma espécie, resultando em duas estruturas dorsais (siameses).

'''10. O que vem a ser ALONGAMENTO CONVERGENTE e INVOLUÇÃO? Como estes fenômenos estão relacionados com a formação da endoderme?'''
: To com preguiça, essa é meio grande... Tem no The Cell (4 edição) pg. 1215

'''11. Qual a origem da notocorda e como ela está relacionada com o sistema nervoso? Existem evidências experimentais para isso?'''
: A notocorda é de origem mesodermica. Não sei qual é a relação dela com o sistema nervoso.

'''12. Se você impedir a crista neural de se formar quais células, tecidos e/ou órgãos estarão faltando no adulto?'''
: Grande parte do sistema nervoso periférico, pigmento da pele e vários tecidos de ligação na cabeça (ossos).

'''13. Qual o destino imediato da mesoderme que é vizinha do tubo neural?'''
: Espinha dorsal... eu acho, não sei...

'''14. Como a expressão das "caderinas" e N-CAM específicas "moldam" o embrião?'''
: As caderinas são resposáveis pela adesão celular, ou seja, a ligação entre uma celula e outra. Por isso, são muito importante para a formação de tecidos e outros conglomerados de células.

'''15. Qual o papel das integrinas, fibronectina e laminina? Como elas interagem e onde estão localizadas?'''
: Tem no The Cell... procura no indice, acho que em algum lugar no capítulo 19.

'''16. Fibronectina e o proteoglicano de sulfato de condroitina têm papéis diferentes no direcionamento da migração celular durante a embriogênese. Quais são esses papéis?'''
: Fibronectina: proporciona sítios adesivos que auxiliam a migração celular.
Proteoglicano de sulfato de condroitina: inibe a locomoção e impede a migração.

=== Diversificação celular e memória celular ===

==== Resumo ====
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula09.ppt PowerPoint Diversificação celular e memória celular]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula09.pdf].

'''1. Descrever a teoria da ação gênica diferencial para explicar a diversificação celular nos metazoários. Citar duas abordagens experimentais que comprovem a teoria.'''
:

'''2. Explicar porque na maioria dos casos os produtos expressos por células em diferenciação não têm seus genes amplificados.'''
:

'''3. Sugira uma abordagem experimental para provar a existência de ovos em mosaico.'''
:Um dos primeiros experimentos bem sucedidos em embriologia experimental foi feito em 'tunicates' isolando-se células de blastômeros de um embrião e observando-se que ouve o desenvolvimento normal das células isoladas assim com do embrião restante, demonstrando que há uma especificação autônoma das células de 'tunicates', ou seja, um desenvolvimento em mosaico.

'''4. Definir indução e explicar como ela pode gerar diferentes tipos de células.'''
:Indução é definida como a interação enre células não equivalentes, ou seja, que não pertencem à mesma comunidade e que pertencerão a partes distintas do organismo, esta interação resulta na modificação da determinação(tipo de célula diferenciada que se formará) de pelo menos uma das células que interagem.

'''5. Discutir como sinais semelhantes podem ter efeitos diferentes no fenômeno de indução entre células diferentes.'''
:

'''6. Definir QUIMERAS e discutir porque em Styela não é possível produzir quimeras.'''
:

'''7. Discutir como ocorre a primeira diversificação celular no embrião de mamíferos no estágio de blástula e qual o mecanismo envolvido.'''
:

'''8. Discutir o que distingue uma bactéria de uma célula de metazoário do ponto de vista de expressão de genes por efeito de sinais externos.'''
:

'''9. Citar uma abordagem experimental utilizada para mostrar que um tecido ou uma célula estão determinados.'''
:

'''10. Discutir como a memória citoplasmática determina o destino de uma célula.'''
:

'''11. Citar o possível mecanismo de memória nuclear no estabelecimento da determinação de uma célula.'''
:

== Segunda Parte ==

=== Biologia da Drosófila ===

==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 1 (aula 12) ====

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
:

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
:

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
:

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

=== Genética e embriogênese de Drosófila ===

==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 2 (aula 14) ====

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
:

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
:

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
:

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
:

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
:

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
:

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
:

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
:

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
:

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
:

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
:

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

=== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
:

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
:

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
:A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
:

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
:

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
:

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA.

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
:

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
:

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
:

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
:

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte

2006-11-28T02:48:08Z

Sonic Orochi: /* Lista 3 (aula 16) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* [[The Cell]]
* [[Gilbert]]
* O outro livro

== Primeira Parte ==
=== Benefícios do Sexo e Meiose ===

==== Resumo ====
* A reprodução sexuada possiblita a recombinação de genes e cromossomos, o que permite o fluxo de caracteres vantajosos na população favorecendo sua sobrevivência.
* A meiose consiste em:
*# Duplicação de cada cromossomo (formação das cromátides-irmãs).
*# Pareamento dos cromossomos maternos e paternos duplicados.
*# Crossing-over.
*# Separação aleatória de cada um dos cromossomos maternos e paternos entre as duas células.
*# Divisão I.
*# Separação das cromátides-irmãs.
*# Divisão II.
* Na meiose, o pareamento dos cromossomos duplicados homólogos se dá com a formação de uma estrutura protéica, o complexo sinaptonêmico, que de alguma forma serve para espaçar os eventos de recombinação ao longo dos cromossomos.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula02.ppt PowerPoint Benefícios do Sexo e Meiose]
* [[The Cell]], cap.20 - Células Germinativas e Fecundação.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula02.pdf].

'''01. Esquematizar o ciclo de vida de um animal que se reproduz sexuadamente e comparar com aquele de um animal que se reproduz assexuadamente.'''

[[Imagem:Reprodução.gif]]

'''02. Discutir o que distingue um organismo com reprodução sexuada de um com reprodução assexuada em relação a possibilidade de adaptação ao meio.'''
: A reprodução sexuada tem sido favorecida pela evolução porque em ambientes variáveis, a recombinação gênica aumenta a probabilidade de se produzir ao menos algum descendente capaz de sobreviver. Além disso, ela permite a eliminação de mutações prejudiciais e a combinação de mutações vantajosas raras.
: Já os organismos de reprodução assexuada não contam com essa vantagem, pois seus descendentes são idênticos aos seus genitores: têm as mesmas caraterísticas e expressões gênicas.

'''03. Uma vez que a biomassa de bactérias no mundo é muito maior que a de animais multicelulares, elas são os organismos dominantes atualmente. No entanto elas se reproduzem assexuadamente. Como voce explica o sucesso evolutivo desses seres vivos?'''
: O fato de que esses organismos têm uma rápida e numerosa reprodução ajudou no seu sucesso evolutivo: caso fosse necessário mudar algo em seus genes, frente à alguma adversidade do meio, a chance de ocorrer uma mutação benéfica é maior devido à essa rápida forma de reprodução. Dessa forma, esses indivíduos se adaptavam bem a praticamente todo tipo de ambiente.

'''04. A afirmação: "organismos assexuados permaneceram simples e primitivos" é correta?'''
: Não sei, mas está escrito no The Cell... (está? Será que ninguém pode dar uma "palhinha"? :D)

'''05. Citar as evidências para a teoria cromossômica da herança e discutir sua relação com o mecanismo de meiose.'''
: Talvez a evidência mais perceptível seja a do fato que os descendentes possuíam (herdavam) características de um dos pais ou uma combinação de ambos. A meiose se relaciona com esses acontecimentos devido à sua atuação no processo de formação dos gametas, de tal forma que o descendente recebe metade dos genes do pai e metade, da mãe.

'''06. Se você tivesse que provar que a meiose não é uma mitose sem fase S, qual abordagem experimental voce usaria?'''
:

'''07. O produto da Meiose I são células com a mesma quantidade de DNA de uma célula diplóide, mas a metade do número de cromossomos. Justifique esta afirmação.'''
: A divisão I da meiose gera 2 células, cada uma com a versão paterna ou materna de cada cromossomo, recombinadas e duplicadas (cromátides-irmãs). A separação das duas cópias se dá na divisão II. Portanto, embora tenha a quantidade de DNA de uma célula diplóide devido à duplicação, as cópias tem a mesma origem e estão na forma de cromátides-irmãs, o que dá efetivamente um cromossomo de cada tipo.

'''08. Relacionar "crossing-over" cromossômico, recombinação genética e quiasmas. Cite evidências experimentais.'''
:

'''09. Os machos dos mamíferos apresentam dois cromossomos sexuais (X e Y). Como eles pareiam durante a meiose?'''
: O Y e o X se pareiam devido à homologia de suas extremidades.

'''10. A prófase I da meiose pode durar anos. Quais as conseqüências disso para os cromossomos dos gametas resultantes? Baseado nos dados que voce tem, tente explicar esses fatos.'''
: Pode levar a aneuploidias (anomalias no número de cromossomos), por exemplo a trissomia do cromossomo 21 causando a síndrome de Down. Isso pode ter várias causas como falhas aleatórias na separação dos cromossomos e na formação do fuso, contaminação viral ou influência hormonal (idade da fêmea).

=== Gametas ===

==== Resumo ====
* A determinação do sexo nos mamíferos é determinado pelo gene SRY, presente no cromossomo Y, que induz as células das gônadas a se transformarem em células de Sertoli, que inibem o desenvolvimento de caracteres femininos, promovem o desenvolmento dos orgãos masculinos e induzem as células germinativas primordiais a se comprometerem a espermatozóides.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula04.ppt PowerPoint Gametas]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula04.pdf].

'''11. Descrever a estrutura do óvulo e a função de suas partes.'''
: Os oócitos são células esféricas ou ovóides especializadas para o desenvolvimento do embrião, por isso, a não ser nos mamíferos, que obtêm seus nutrientes para o crescimento pela placenta, os oócitos são células gigantes contendo grandes reservas de nutrientes (lipídeos, proteínas e polissacarídeos) na forma de gema.
: O oócito é revestido por uma matriz de glicoproteínas chamada de camada vitelina, ou nos mamíferos de zona pelúcida. Os oócitos costumam ter também grânulos corticais, vesículas secretoras especializadas que se situam no córtex (região do citoplasma logo abaixo da membrana plasmática), que têm a função de alterar o revestimento do oócito evitando a poliespermia.

'''12. Descrever os estágios de maturação do óvulo.'''
: As ''células germinativas primordiais'' migram para os ovários em desenvolvimento e tornam-se ''ovogônias''. Após várias mitoses, as ovogônias se transformam em ''oócitos primários'' e se mantêm em prófase durante um longo período, enquanto crescem, ganham revestimento e acumulam ribossomos, mRNA e proteínas. Na maturação ele se divide em ''oócito secundário'' e primeiro corpúsculo polar. Em muitas espécies, incluindo a nossa, ele permanece assim até a fecundação, quando então completa a meiose (liberando o segundo corpusculo polar (e o terceiro?)) e inicia o desenvolvimento embrionário.

'''13. Quais as adaptações dos óvulos para atingir o tamanho final. Por que os óvulos precisam ser tão grandes?'''
: As adaptações variam de especie para espécie, algumas possuem nurse cells outra células foliculares que sintetizam as moléculas necessárias para o óvulo, mas em todas elas as divisões que o óvulo sofre são assimétricas, de forma a concentrar grande parte do citoplasma.
:Uma maneira é atrasando a conclusão da primeira divisão meiótica para crescer, assim ele fica com o grupo de cromossomos diplóides em duplicata, com mais DNA disponível para síntese de RNA.
:Os óvulos precisam ser grande para sustentar a alta taxa de divisão celular do zigoto.

'''14. Qual o destino dos corpúsculos polares nos mamíferos?'''
: Segundo o [[Alberts]]: "Por fim, degeneram."
: Segundo o [[Winter]]: "São perdidos."
: Segundo o [[Rafael (T15)|Rafael]]: "Eles somem, desaparecem, escafedem-se."
: OBS: Segundo a Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Polar_body] os corpúsculos polares secundários podem ser fecundados.

'''15. Na ovogênese dos insetos não existem corpúsculos polares. Qual o destino das células que não originam ovócitos?'''
: Elas se tornam nurse cells (células acessório). Veja [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.figgrp.3726 esta figura] e tudo se resolverá.

'''16. Descrever a estrutura de um espermatozóide de mamífero.'''
: Procura no The Cell que voce acha. Mais especificamente aqui [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bookres.fcgi/mboc4/ch20f25.gif]. E na Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Complete_diagram_of_a_human_spermatozoa.svg] para ainda mais detalhes.
'''17. Por que o espermatozóide não possui Golgi e o óvulo sim?'''
: Porque ele não precisa de golgi, visto que a sua função é levar o DNA até o ovulo. O óvulo tem golgi porque o zigoto precisa de golgi, e como o espermatozoide não tem... :P

'''18. Qual o papel da peça mediana no comportamento do espermatozóide?'''
: A peça mediana contém a mitoncondria do espermatozoide, que depende de ATP para a sua locomoção. Portanto, a peça mediana determina, em grande medida, a velocidade de locomoção do espermatozoide.

'''19. Se o espermatozóide só se diferencia após a segunda divisão meiótica, quando a célula é haplóide, como mutações recessivas que afetem esse passo não se manifestam em indivíduos heterozigotos?'''
: Eles se diferenciam com os citoplasmas fundidos, então, embora já sejam haplóides nesta fase, podem trocar RNAs e proteínas entre si, eliminando assim as implicações negativas da haploidia.

'''20. Idealize uma abordagem experimental para mostrar que a sua resposta ao objetivo anterior é verdadeira.'''
:

=== Fertilização ===

==== Resumo ====
* O espermatozóide passa por mudanças fisiológicas no trato reprodutor feminino que o capacitam a fertilizar o óvulo (capacitação), estas mudanças envolvem a produção de cAMP e o aumento da mobilidade espermática.
* Chegando lá, o espermatozóide deve se ligar à zona pelúcida, o que dispara a ''reação acrossomal'', criando o caminho para que chegue à membrana. Ao se ligar na membrana, o espermatozóide se inclina (provavelmente anda um pouquinho) e começa a fusão dos citoplasmas, a membrana se despolariza e é disparada uma onda de Ca2+ que ativa a reação cortical (envolvendo os grânulos corticais do óvulo) e o desenvolvimento do zigoto (primeira mitose) (ver slide 12).
* Há dois mecanismos principais de bloqueio à poliespermia: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá pela onda de Ca2+ liberando os glânulos corticais (reação cortical) que lisam as ZP2 e hidrolisam os açúcares das ZP3.

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula06.ppt PowerPoint Fertilização]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula06.pdf].

'''1. No que consiste a capacitação do espermatozóide?'''
: A capacitação consiste numa porção de mudanças fisiológicas espécie-específicas que ocorrem no trato reprodutor feminino e tornam o espermatozóide competente para fertilizar o óvulo. Espermatozóides não capacitados não alcançam o óvulo. Pode-se imitar a capacitação ''in vitro'' usando uma solução de cálcio, bicarbonato e albumina. Entre as alterações importantes da capacitação estão:
:* Entrada de íons bicarbonato ativando a adenilil-ciclase, que produz cAMP e induz às diversas outras modificações.
:* Alterações da membrana e do metabolismo, aumentando a mobilidade espermática:
::* A remoção de colesterol pela albumina aumentando a fluidez da membrana.
::* Perda de algumas proteínas e carbohidratos na superfície (talvez eles bloqueiem o reconhecimento com a zona pelúcida).
:* Aumento da carga negativa do potencial de membrana (hiperpolarização) pela perda de potássio (isso poderia causar a entrada de cálcio, o que poderia ser importante na produção de cAMP e na facilitação dos eventos de fusão do acrosssomo).
:* Fosforilação de algumas proteínas.

'''2. Qual a função da zona pelúcida?'''
: Proteção contra choques mecânicos e servir de barreira para espermatozóides de outras espécies.

'''3. A zona pelúcida é composta de três polipeptídeos. Faça um esquema da organização deles, indicando a função de cada um.'''
: ZP1, ZP2 e ZP3. Para o esquema, ver slide 33, da apresentação desta aula.

'''4. Como eles polimerizam para formar a zona pelúcida?'''
: Hum, isso é bem chato, mas se quiser mesmo saber, veja o slide 5-10 desta aula.

'''5. Qual a função intracelular da galactosil-transferase? (ver Alberts ou Voet).'''
: Ela age no Golgi das células, transferindo galactose (galactosilando) para as glicoproteínas que serão levadas para a membrana plasmática.

'''6. Pelo que voce sabe sobre ZP3, como voce impediria a fertilização de um óvulo pelo espermatozóide?'''
: Usando alguma protease que clive o açucar que está ligado ao ZP3 ou um anticorpo.

'''7. Por que mecanismos o óvulo impede a poliespermia?'''
: Há dois mecanismos principais: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá por uma onda de Ca2+ ativando o desenvolvimento do oócito e liberando os glânulos corticais (reação cortical).

'''8. Qual o papel do Ca2+ no bloqueio à poliespermia?'''
: Ele é o sinal de início da reação cortical, isto é, a liberação dos grânulos corticais que altera a zona pelúcida impedindo a ligação dos outros espermatozóides.

'''9. O que contêm os grânulos corticais?'''
: Proteases de ZP2 e enzimas de hidrólise dos açúcares de ZP3, entre outras coisas.

'''10. Por que salamandras que se reproduzem partenogeneticamente ainda precisam de espermatozóides para ativar seus óvulos diplóides?'''
: Porque para completar a primeira divisão celular após a fecundação o óvulo precisa do centrossomo que é doado pelo espermatozóide.

=== Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo ===

==== Resumo ====
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08a.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 1]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08b.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 2]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08c.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 3]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula08.pdf].

'''1. Quais as três principais fases da embriogênese?'''
: Blastula, gastrula e organogenese.

'''2. Quais os três principais eixos do corpo e como eles se relacionam com a distribuição assimétrica de vitelo no ovo com clivagem holoblástica dos anfíbios?'''
: Anterior-posterior, dorsal-ventral e medio-lateral. A distribuição assimetrica de vitelo no ovo origina o eixo anterior-posterior.

'''3. Descreva como o espermatozóide de X. laevis estabelece o segundo eixo de assimetria no ovo.'''
: O ponto de entrada do espermatozoide provoca uma rotação na camada externa do citoplasma em relação a parte interna, o que gera uma assimetria na célula que origina o eixo dorsal-ventral.

'''4. A taxa de mitoses durante as primeiras 7h da embriogênese de X. laevis é muito maior que em tecidos adultos. Devido a isso a replicação do DNA tem que ser muito mais rápida. Sabe-se no entanto que a DNA polimerase funciona a mesma velocidade, seja em blastômeros seja em células do indivíduo adulto. Como isso é possível?'''
: Com uma maior concentração de DNA polimerases, visto que o DNA de eucariotos possuem várias origens de replicação, permitindo que várias DNA polimerases trabalhem em paralelo. (Eu não tenho certeza se a resposta é essa mesma, correções são bem vindas)

'''5. Como se forma o blastoceloma?'''
: Junções celulares isolam o embrião do meio externo, Na+ é bombeado para dentro e a água entra por osmose.

'''6. Descreva a gastrulação em ouriço-do-mar.'''
: Tem no The Cell.

'''7. Na gastrulação duas novas camadas germinativas se formam. Quais são elas e como isso ocorre?'''
: Mesoderme e endoderme. Ocorre uma involução da ectoderme.

'''8. O que é um mapa do destino no embrião?'''
: Trivial.

'''9. Qual o papel do lábio dorsal do blastóporo e como Mangold e Spemann mostraram
que ele continha o Organizador?'''
: O lábio dorsal é a origem do sinal que coordena tanto a gastrulação quanto o padrão de especialização dos tecidos ao redor. Eles mostraram retirando o lábio de um embrião e implantando em outro embrião da mesma espécie, resultando em duas estruturas dorsais (siameses).

'''10. O que vem a ser ALONGAMENTO CONVERGENTE e INVOLUÇÃO? Como estes fenômenos estão relacionados com a formação da endoderme?'''
: To com preguiça, essa é meio grande... Tem no The Cell (4 edição) pg. 1215

'''11. Qual a origem da notocorda e como ela está relacionada com o sistema nervoso? Existem evidências experimentais para isso?'''
: A notocorda é de origem mesodermica. Não sei qual é a relação dela com o sistema nervoso.

'''12. Se você impedir a crista neural de se formar quais células, tecidos e/ou órgãos estarão faltando no adulto?'''
: Grande parte do sistema nervoso periférico, pigmento da pele e vários tecidos de ligação na cabeça (ossos).

'''13. Qual o destino imediato da mesoderme que é vizinha do tubo neural?'''
: Espinha dorsal... eu acho, não sei...

'''14. Como a expressão das "caderinas" e N-CAM específicas "moldam" o embrião?'''
: As caderinas são resposáveis pela adesão celular, ou seja, a ligação entre uma celula e outra. Por isso, são muito importante para a formação de tecidos e outros conglomerados de células.

'''15. Qual o papel das integrinas, fibronectina e laminina? Como elas interagem e onde estão localizadas?'''
: Tem no The Cell... procura no indice, acho que em algum lugar no capítulo 19.

'''16. Fibronectina e o proteoglicano de sulfato de condroitina têm papéis diferentes no direcionamento da migração celular durante a embriogênese. Quais são esses papéis?'''
: Fibronectina: proporciona sítios adesivos que auxiliam a migração celular.
Proteoglicano de sulfato de condroitina: inibe a locomoção e impede a migração.

=== Diversificação celular e memória celular ===

==== Resumo ====
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

==== Bibliografia ====

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula09.ppt PowerPoint Diversificação celular e memória celular]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

==== Lista ====

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula09.pdf].

'''1. Descrever a teoria da ação gênica diferencial para explicar a diversificação celular nos metazoários. Citar duas abordagens experimentais que comprovem a teoria.'''
:

'''2. Explicar porque na maioria dos casos os produtos expressos por células em diferenciação não têm seus genes amplificados.'''
:

'''3. Sugira uma abordagem experimental para provar a existência de ovos em mosaico.'''
:Um dos primeiros experimentos bem sucedidos em embriologia experimental foi feito em 'tunicates' isolando-se células de blastômeros de um embrião e observando-se que ouve o desenvolvimento normal das células isoladas assim com do embrião restante, demonstrando que há uma especificação autônoma das células de 'tunicates', ou seja, um desenvolvimento em mosaico.

'''4. Definir indução e explicar como ela pode gerar diferentes tipos de células.'''
:Indução é definida como a interação enre células não equivalentes, ou seja, que não pertencem à mesma comunidade e que pertencerão a partes distintas do organismo, esta interação resulta na modificação da determinação(tipo de célula diferenciada que se formará) de pelo menos uma das células que interagem.

'''5. Discutir como sinais semelhantes podem ter efeitos diferentes no fenômeno de indução entre células diferentes.'''
:

'''6. Definir QUIMERAS e discutir porque em Styela não é possível produzir quimeras.'''
:

'''7. Discutir como ocorre a primeira diversificação celular no embrião de mamíferos no estágio de blástula e qual o mecanismo envolvido.'''
:

'''8. Discutir o que distingue uma bactéria de uma célula de metazoário do ponto de vista de expressão de genes por efeito de sinais externos.'''
:

'''9. Citar uma abordagem experimental utilizada para mostrar que um tecido ou uma célula estão determinados.'''
:

'''10. Discutir como a memória citoplasmática determina o destino de uma célula.'''
:

'''11. Citar o possível mecanismo de memória nuclear no estabelecimento da determinação de uma célula.'''
:

== Segunda Parte ==

=== Biologia da Drosófila ===

==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 1 (aula 12) ====

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o compõe.'''
:

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
:

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos, assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva->pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva? Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe? Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em 1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
:

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo do desenvolvimento?'''
:

=== Genética e embriogênese de Drosófila ===

==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 2 (aula 14) ====

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
:

'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no ovócito?'''
:

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
:

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de drosófila? O que cada um deles origina?'''
:

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as semelhanças?'''
:

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento do embrião presentes no ovócito, essa informação não é suficiente para montar o embrião?'''
:

'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
:

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
:

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células polares?'''
:

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas das outras?'''
:

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das células endodérmicas durante a gastrulação?'''
:

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:

=== Estabelecimento dos Eixos no embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 3 (aula 16) ====

'''1. Qual a explicação de Sander para os seus primeiros experimentos em ''Euscelis'' (um gafanhoto)?'''
:

'''2. O que os experimentos de Sander com transplantes em ovos de ''Euscelis'' mostraram? Existem, ou não, determinantes na parte posterior dos ovos?'''
:

'''3. Qual o efeito de mutações no gene ''bicoid''?'''
:A cabeça e o tórax são substituídos por uma "imagem espelhada" do télson.

'''4. No que as mutações em ''bicoid'' lembram os experimentos de Sander com ''Euscelis''?'''
:

'''5. Ao aumentar o número de cópias de ''bicoid'' na mãe, o que acontece com o padrão de parasegmentos no embrião? Os experimentos de transplante de citoplasma anterior apoiam estes resultados? Por que?'''
:

'''6. Como o mRNA de ''bicoid'' fica localizado na região anterior do citoplasma do ovo? Como isso foi mostrado experimentalmente?'''
:

'''7. Qual o efeito das mutações ''swallow'', ''exuperantia'' e ''staufen'' sobre a localização do mRNA de ''bicoid''?'''
: Uma mutação em ''exu'' impede o transporte de ''bcd'' das "nurse cells" para o ovócito. Mutações em ''swa'' e ''stau'', impedem a localização de mRNA.

'''8. Como o gradiente de ''bicoid'' (a proteína, não o gene) é mantido no ovo?'''
:

'''9. Qual o gene primário para determinação do padrão posterior? Como isso foi mostrado?'''
:

'''10. Como o gradiente de ''hunchback'' é construído no zigoto?'''
:

'''11. Como durante a evolução foi mantido um sistema que "desperdiça" dois genes (''nanos'' e ''hunchback'') que poderiam haver sido eliminados?'''
:

'''12. Como usamos o método de transplante de células polares? O que esse método pode ajudar a responder em relação às mutações de origem materna?'''
:

'''13. Como funciona o sistema terminal?'''
:

'''14. Como os três sistemas (anterior, posterior e terminal) funcionam para determinar o padrão a.p. do ovo recém-posto?'''
:

'''15. Como é determinado o padrão d.v.?'''

'''16. No modelo mais aceito para determinação do padrão d.v., a proteína codificada em ''dorsal'' forma um gradiente ao longo do deixo d.v., estando mais concentrada no lado ventral. Qual sua localização celular? Como a mutação em ''cactus'' afeta essa distribuição?'''

=== Estabelecimento do padrão do embrião de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 4 (aula 18) ====

'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
:R: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
:R: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
:R:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:R:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
:R:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
:R:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
:R:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
:R:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
:R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
:R:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
:R: ''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
:R: Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
:R:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
:R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
:R:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
:R:

=== Alocação celular e genes seletores de Drosófila ===
==== Resumo ====
==== Bibliografia ====
==== Lista 5 (aula 20) ====

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
:R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
:R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
:R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
:R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
:R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
:R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
:R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
:R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
:R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
:R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

== Ver também ==

* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Projeto Biologia do Desenvolvimento - Primeira Parte

2006-11-28T02:32:05Z

Sonic Orochi: /* Lista 4 (aula 18) */

O '''Projeto Biologia do Desenvolvimento''' tem o propósito de resolver as listas de Objetivos do prof. [[Winter]], a fim de facilitar o estudo da disciplina [[Biologia III]].

== Instruções Gerais ==

* Cole o exercício da lista, e responda, colocando a bibliografia utilizada.
* Coloque observações importantes sobre o assunto no resumo.

== Referências ==

* [http://www.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ Site do Winter]
* [[The Cell]]
* [[Gilbert]]
* O outro livro

== Benefícios do Sexo e Meiose ==

=== Resumo ===
* A reprodução sexuada possiblita a recombinação de genes e cromossomos, o que permite o fluxo de caracteres vantajosos na população favorecendo sua sobrevivência.
* A meiose consiste em:
*# Duplicação de cada cromossomo (formação das cromátides-irmãs).
*# Pareamento dos cromossomos maternos e paternos duplicados.
*# Crossing-over.
*# Separação aleatória de cada um dos cromossomos maternos e paternos entre as duas células.
*# Divisão I.
*# Separação das cromátides-irmãs.
*# Divisão II.
* Na meiose, o pareamento dos cromossomos duplicados homólogos se dá com a formação de uma estrutura protéica, o complexo sinaptonêmico, que de alguma forma serve para espaçar os eventos de recombinação ao longo dos cromossomos.

=== Bibliografia ===

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula02.ppt PowerPoint Benefícios do Sexo e Meiose]
* [[The Cell]], cap.20 - Células Germinativas e Fecundação.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

=== Lista ===

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula02.pdf].

'''01. Esquematizar o ciclo de vida de um animal que se reproduz sexuadamente e comparar com aquele de um animal que se reproduz assexuadamente.'''

[[Imagem:Reprodução.gif]]

'''02. Discutir o que distingue um organismo com reprodução sexuada de um com reprodução assexuada em relação a possibilidade de adaptação ao meio.'''
: A reprodução sexuada tem sido favorecida pela evolução porque em ambientes variáveis, a recombinação gênica aumenta a probabilidade de se produzir ao menos algum descendente capaz de sobreviver. Além disso, ela permite a eliminação de mutações prejudiciais e a combinação de mutações vantajosas raras.
: Já os organismos de reprodução assexuada não contam com essa vantagem, pois seus descendentes são idênticos aos seus genitores: têm as mesmas caraterísticas e expressões gênicas.

'''03. Uma vez que a biomassa de bactérias no mundo é muito maior que a de animais multicelulares, elas são os organismos dominantes atualmente. No entanto elas se reproduzem assexuadamente. Como voce explica o sucesso evolutivo desses seres vivos?'''
: O fato de que esses organismos têm uma rápida e numerosa reprodução ajudou no seu sucesso evolutivo: caso fosse necessário mudar algo em seus genes, frente à alguma adversidade do meio, a chance de ocorrer uma mutação benéfica é maior devido à essa rápida forma de reprodução. Dessa forma, esses indivíduos se adaptavam bem a praticamente todo tipo de ambiente.

'''04. A afirmação: "organismos assexuados permaneceram simples e primitivos" é correta?'''
: Não sei, mas está escrito no The Cell... (está? Será que ninguém pode dar uma "palhinha"? :D)

'''05. Citar as evidências para a teoria cromossômica da herança e discutir sua relação com o mecanismo de meiose.'''
: Talvez a evidência mais perceptível seja a do fato que os descendentes possuíam (herdavam) características de um dos pais ou uma combinação de ambos. A meiose se relaciona com esses acontecimentos devido à sua atuação no processo de formação dos gametas, de tal forma que o descendente recebe metade dos genes do pai e metade, da mãe.

'''06. Se você tivesse que provar que a meiose não é uma mitose sem fase S, qual abordagem experimental voce usaria?'''
:

'''07. O produto da Meiose I são células com a mesma quantidade de DNA de uma célula diplóide, mas a metade do número de cromossomos. Justifique esta afirmação.'''
: A divisão I da meiose gera 2 células, cada uma com a versão paterna ou materna de cada cromossomo, recombinadas e duplicadas (cromátides-irmãs). A separação das duas cópias se dá na divisão II. Portanto, embora tenha a quantidade de DNA de uma célula diplóide devido à duplicação, as cópias tem a mesma origem e estão na forma de cromátides-irmãs, o que dá efetivamente um cromossomo de cada tipo.

'''08. Relacionar "crossing-over" cromossômico, recombinação genética e quiasmas. Cite evidências experimentais.'''
:

'''09. Os machos dos mamíferos apresentam dois cromossomos sexuais (X e Y). Como eles pareiam durante a meiose?'''
: O Y e o X se pareiam devido à homologia de suas extremidades.

'''10. A prófase I da meiose pode durar anos. Quais as conseqüências disso para os cromossomos dos gametas resultantes? Baseado nos dados que voce tem, tente explicar esses fatos.'''
: Pode levar a aneuploidias (anomalias no número de cromossomos), por exemplo a trissomia do cromossomo 21 causando a síndrome de Down. Isso pode ter várias causas como falhas aleatórias na separação dos cromossomos e na formação do fuso, contaminação viral ou influência hormonal (idade da fêmea).

== Gametas ==

=== Resumo ===
* A determinação do sexo nos mamíferos é determinado pelo gene SRY, presente no cromossomo Y, que induz as células das gônadas a se transformarem em células de Sertoli, que inibem o desenvolvimento de caracteres femininos, promovem o desenvolmento dos orgãos masculinos e induzem as células germinativas primordiais a se comprometerem a espermatozóides.

=== Bibliografia ===

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula04.ppt PowerPoint Gametas]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

=== Lista ===

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula04.pdf].

'''11. Descrever a estrutura do óvulo e a função de suas partes.'''
: Os oócitos são células esféricas ou ovóides especializadas para o desenvolvimento do embrião, por isso, a não ser nos mamíferos, que obtêm seus nutrientes para o crescimento pela placenta, os oócitos são células gigantes contendo grandes reservas de nutrientes (lipídeos, proteínas e polissacarídeos) na forma de gema.
: O oócito é revestido por uma matriz de glicoproteínas chamada de camada vitelina, ou nos mamíferos de zona pelúcida. Os oócitos costumam ter também grânulos corticais, vesículas secretoras especializadas que se situam no córtex (região do citoplasma logo abaixo da membrana plasmática), que têm a função de alterar o revestimento do oócito evitando a poliespermia.

'''12. Descrever os estágios de maturação do óvulo.'''
: As ''células germinativas primordiais'' migram para os ovários em desenvolvimento e tornam-se ''ovogônias''. Após várias mitoses, as ovogônias se transformam em ''oócitos primários'' e se mantêm em prófase durante um longo período, enquanto crescem, ganham revestimento e acumulam ribossomos, mRNA e proteínas. Na maturação ele se divide em ''oócito secundário'' e primeiro corpúsculo polar. Em muitas espécies, incluindo a nossa, ele permanece assim até a fecundação, quando então completa a meiose (liberando o segundo corpusculo polar (e o terceiro?)) e inicia o desenvolvimento embrionário.

'''13. Quais as adaptações dos óvulos para atingir o tamanho final. Por que os óvulos precisam ser tão grandes?'''
: As adaptações variam de especie para espécie, algumas possuem nurse cells outra células foliculares que sintetizam as moléculas necessárias para o óvulo, mas em todas elas as divisões que o óvulo sofre são assimétricas, de forma a concentrar grande parte do citoplasma.
:Uma maneira é atrasando a conclusão da primeira divisão meiótica para crescer, assim ele fica com o grupo de cromossomos diplóides em duplicata, com mais DNA disponível para síntese de RNA.
:Os óvulos precisam ser grande para sustentar a alta taxa de divisão celular do zigoto.

'''14. Qual o destino dos corpúsculos polares nos mamíferos?'''
: Segundo o [[Alberts]]: "Por fim, degeneram."
: Segundo o [[Winter]]: "São perdidos."
: Segundo o [[Rafael (T15)|Rafael]]: "Eles somem, desaparecem, escafedem-se."
: OBS: Segundo a Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Polar_body] os corpúsculos polares secundários podem ser fecundados.

'''15. Na ovogênese dos insetos não existem corpúsculos polares. Qual o destino das células que não originam ovócitos?'''
: Elas se tornam nurse cells (células acessório). Veja [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.figgrp.3726 esta figura] e tudo se resolverá.

'''16. Descrever a estrutura de um espermatozóide de mamífero.'''
: Procura no The Cell que voce acha. Mais especificamente aqui [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bookres.fcgi/mboc4/ch20f25.gif]. E na Wikipedia [http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Complete_diagram_of_a_human_spermatozoa.svg] para ainda mais detalhes.
'''17. Por que o espermatozóide não possui Golgi e o óvulo sim?'''
: Porque ele não precisa de golgi, visto que a sua função é levar o DNA até o ovulo. O óvulo tem golgi porque o zigoto precisa de golgi, e como o espermatozoide não tem... :P

'''18. Qual o papel da peça mediana no comportamento do espermatozóide?'''
: A peça mediana contém a mitoncondria do espermatozoide, que depende de ATP para a sua locomoção. Portanto, a peça mediana determina, em grande medida, a velocidade de locomoção do espermatozoide.

'''19. Se o espermatozóide só se diferencia após a segunda divisão meiótica, quando a célula é haplóide, como mutações recessivas que afetem esse passo não se manifestam em indivíduos heterozigotos?'''
: Eles se diferenciam com os citoplasmas fundidos, então, embora já sejam haplóides nesta fase, podem trocar RNAs e proteínas entre si, eliminando assim as implicações negativas da haploidia.

'''20. Idealize uma abordagem experimental para mostrar que a sua resposta ao objetivo anterior é verdadeira.'''
:

== Fertilização ==

=== Resumo ===
* O espermatozóide passa por mudanças fisiológicas no trato reprodutor feminino que o capacitam a fertilizar o óvulo (capacitação), estas mudanças envolvem a produção de cAMP e o aumento da mobilidade espermática.
* Chegando lá, o espermatozóide deve se ligar à zona pelúcida, o que dispara a ''reação acrossomal'', criando o caminho para que chegue à membrana. Ao se ligar na membrana, o espermatozóide se inclina (provavelmente anda um pouquinho) e começa a fusão dos citoplasmas, a membrana se despolariza e é disparada uma onda de Ca2+ que ativa a reação cortical (envolvendo os grânulos corticais do óvulo) e o desenvolvimento do zigoto (primeira mitose) (ver slide 12).
* Há dois mecanismos principais de bloqueio à poliespermia: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá pela onda de Ca2+ liberando os glânulos corticais (reação cortical) que lisam as ZP2 e hidrolisam os açúcares das ZP3.

=== Bibliografia ===

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula06.ppt PowerPoint Fertilização]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

=== Lista ===

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula06.pdf].

'''1. No que consiste a capacitação do espermatozóide?'''
: A capacitação consiste numa porção de mudanças fisiológicas espécie-específicas que ocorrem no trato reprodutor feminino e tornam o espermatozóide competente para fertilizar o óvulo. Espermatozóides não capacitados não alcançam o óvulo. Pode-se imitar a capacitação ''in vitro'' usando uma solução de cálcio, bicarbonato e albumina. Entre as alterações importantes da capacitação estão:
:* Entrada de íons bicarbonato ativando a adenilil-ciclase, que produz cAMP e induz às diversas outras modificações.
:* Alterações da membrana e do metabolismo, aumentando a mobilidade espermática:
::* A remoção de colesterol pela albumina aumentando a fluidez da membrana.
::* Perda de algumas proteínas e carbohidratos na superfície (talvez eles bloqueiem o reconhecimento com a zona pelúcida).
:* Aumento da carga negativa do potencial de membrana (hiperpolarização) pela perda de potássio (isso poderia causar a entrada de cálcio, o que poderia ser importante na produção de cAMP e na facilitação dos eventos de fusão do acrosssomo).
:* Fosforilação de algumas proteínas.

'''2. Qual a função da zona pelúcida?'''
: Proteção contra choques mecânicos e servir de barreira para espermatozóides de outras espécies.

'''3. A zona pelúcida é composta de três polipeptídeos. Faça um esquema da organização deles, indicando a função de cada um.'''
: ZP1, ZP2 e ZP3. Para o esquema, ver slide 33, da apresentação desta aula.

'''4. Como eles polimerizam para formar a zona pelúcida?'''
: Hum, isso é bem chato, mas se quiser mesmo saber, veja o slide 5-10 desta aula.

'''5. Qual a função intracelular da galactosil-transferase? (ver Alberts ou Voet).'''
: Ela age no Golgi das células, transferindo galactose (galactosilando) para as glicoproteínas que serão levadas para a membrana plasmática.

'''6. Pelo que voce sabe sobre ZP3, como voce impediria a fertilização de um óvulo pelo espermatozóide?'''
: Usando alguma protease que clive o açucar que está ligado ao ZP3 ou um anticorpo.

'''7. Por que mecanismos o óvulo impede a poliespermia?'''
: Há dois mecanismos principais: o bloqueio rápido primário, que se dá pela despolarização do potencial de membrana do óvulo, e o bloqueio lento secundário, que se dá por uma onda de Ca2+ ativando o desenvolvimento do oócito e liberando os glânulos corticais (reação cortical).

'''8. Qual o papel do Ca2+ no bloqueio à poliespermia?'''
: Ele é o sinal de início da reação cortical, isto é, a liberação dos grânulos corticais que altera a zona pelúcida impedindo a ligação dos outros espermatozóides.

'''9. O que contêm os grânulos corticais?'''
: Proteases de ZP2 e enzimas de hidrólise dos açúcares de ZP3, entre outras coisas.

'''10. Por que salamandras que se reproduzem partenogeneticamente ainda precisam de espermatozóides para ativar seus óvulos diplóides?'''
: Porque para completar a primeira divisão celular após a fecundação o óvulo precisa do centrossomo que é doado pelo espermatozóide.

== Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo ==

=== Resumo ===
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

=== Bibliografia ===

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08a.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 1]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08b.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 2]
* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula08c.ppt PowerPoint Movimentos Morfogenéticos e a forma do corpo 3]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

=== Lista ===

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula08.pdf].

'''1. Quais as três principais fases da embriogênese?'''
: Blastula, gastrula e organogenese.

'''2. Quais os três principais eixos do corpo e como eles se relacionam com a distribuição assimétrica de vitelo no ovo com clivagem holoblástica dos anfíbios?'''
: Anterior-posterior, dorsal-ventral e medio-lateral. A distribuição assimetrica de vitelo no ovo origina o eixo anterior-posterior.

'''3. Descreva como o espermatozóide de X. laevis estabelece o segundo eixo de assimetria no ovo.'''
: O ponto de entrada do espermatozoide provoca uma rotação na camada externa do citoplasma em relação a parte interna, o que gera uma assimetria na célula que origina o eixo dorsal-ventral.

'''4. A taxa de mitoses durante as primeiras 7h da embriogênese de X. laevis é muito maior que em tecidos adultos. Devido a isso a replicação do DNA tem que ser muito mais rápida. Sabe-se no entanto que a DNA polimerase funciona a mesma velocidade, seja em blastômeros seja em células do indivíduo adulto. Como isso é possível?'''
: Com uma maior concentração de DNA polimerases, visto que o DNA de eucariotos possuem várias origens de replicação, permitindo que várias DNA polimerases trabalhem em paralelo. (Eu não tenho certeza se a resposta é essa mesma, correções são bem vindas)

'''5. Como se forma o blastoceloma?'''
: Junções celulares isolam o embrião do meio externo, Na+ é bombeado para dentro e a água entra por osmose.

'''6. Descreva a gastrulação em ouriço-do-mar.'''
: Tem no The Cell.

'''7. Na gastrulação duas novas camadas germinativas se formam. Quais são elas e como isso ocorre?'''
: Mesoderme e endoderme. Ocorre uma involução da ectoderme.

'''8. O que é um mapa do destino no embrião?'''
: Trivial.

'''9. Qual o papel do lábio dorsal do blastóporo e como Mangold e Spemann mostraram
que ele continha o Organizador?'''
: O lábio dorsal é a origem do sinal que coordena tanto a gastrulação quanto o padrão de especialização dos tecidos ao redor. Eles mostraram retirando o lábio de um embrião e implantando em outro embrião da mesma espécie, resultando em duas estruturas dorsais (siameses).

'''10. O que vem a ser ALONGAMENTO CONVERGENTE e INVOLUÇÃO? Como estes fenômenos estão relacionados com a formação da endoderme?'''
: To com preguiça, essa é meio grande... Tem no The Cell (4 edição) pg. 1215

'''11. Qual a origem da notocorda e como ela está relacionada com o sistema nervoso? Existem evidências experimentais para isso?'''
: A notocorda é de origem mesodermica. Não sei qual é a relação dela com o sistema nervoso.

'''12. Se você impedir a crista neural de se formar quais células, tecidos e/ou órgãos estarão faltando no adulto?'''
: Grande parte do sistema nervoso periférico, pigmento da pele e vários tecidos de ligação na cabeça (ossos).

'''13. Qual o destino imediato da mesoderme que é vizinha do tubo neural?'''
: Espinha dorsal... eu acho, não sei...

'''14. Como a expressão das "caderinas" e N-CAM específicas "moldam" o embrião?'''
: As caderinas são resposáveis pela adesão celular, ou seja, a ligação entre uma celula e outra. Por isso, são muito importante para a formação de tecidos e outros conglomerados de células.

'''15. Qual o papel das integrinas, fibronectina e laminina? Como elas interagem e onde estão localizadas?'''
: Tem no The Cell... procura no indice, acho que em algum lugar no capítulo 19.

'''16. Fibronectina e o proteoglicano de sulfato de condroitina têm papéis diferentes no direcionamento da migração celular durante a embriogênese. Quais são esses papéis?'''
: Fibronectina: proporciona sítios adesivos que auxiliam a migração celular.
Proteoglicano de sulfato de condroitina: inibe a locomoção e impede a migração.

== Diversificação celular e memória celular ==

=== Resumo ===
* O sexo traz muitos benefícios, como ...

=== Bibliografia ===

* [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/ppt/aula09.ppt PowerPoint Diversificação celular e memória celular]
* [[The Cell]], cap.?, p.?-?.
* [[Gilbert]], cap.?, p.?-?.
* O outro livro, cap.?, p.?-?.

=== Lista ===

Disponível em [http://lnx00.cecm.usp.br/~cewinter/aulas/pdf/obj_aula09.pdf].

'''1. Descrever a teoria da ação gênica diferencial para explicar a diversificação celular nos metazoários. Citar duas abordagens experimentais que comprovem a teoria.'''
:

'''2. Explicar porque na maioria dos casos os produtos expressos por células em diferenciação não têm seus genes amplificados.'''
:

'''3. Sugira uma abordagem experimental para provar a existência de ovos em mosaico.'''
:Um dos primeiros experimentos bem sucedidos em embriologia experimental foi feito em 'tunicates' isolando-se células de blastômeros de um embrião e observando-se que ouve o desenvolvimento normal das células isoladas assim com do embrião restante, demonstrando que há uma especificação autônoma das células de 'tunicates', ou seja, um desenvolvimento em mosaico.

'''4. Definir indução e explicar como ela pode gerar diferentes tipos de células.'''
:Indução é definida como a interação enre células não equivalentes, ou seja, que não pertencem à mesma comunidade e que pertencerão a partes distintas do organismo, esta interação resulta na modificação da determinação(tipo de célula diferenciada que se formará) de pelo menos uma das células que interagem.

'''5. Discutir como sinais semelhantes podem ter efeitos diferentes no fenômeno de indução entre células diferentes.'''
:

'''6. Definir QUIMERAS e discutir porque em Styela não é possível produzir quimeras.'''
:

'''7. Discutir como ocorre a primeira diversificação celular no embrião de mamíferos no estágio de blástula e qual o mecanismo envolvido.'''
:

'''8. Discutir o que distingue uma bactéria de uma célula de metazoário do ponto de vista de expressão de genes por efeito de sinais externos.'''
:

'''9. Citar uma abordagem experimental utilizada para mostrar que um tecido ou uma célula estão determinados.'''
:

'''10. Discutir como a memória citoplasmática determina o destino de uma célula.'''
:

'''11. Citar o possível mecanismo de memória nuclear no estabelecimento da determinação de uma célula.'''
:

== Ver também ==

* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

== Drosófilas ==

=== Lista 1 (aula 12) ===

'''1. Descreva o ciclo de vida de drosófila. Quantos e quais estágios (stages) o
compõe.'''
:

'''2. Insetos holometábolos como drosófila possuem duas fases ativas distintas no seu ciclo de vida. Essas duas fases apresentam atividades principais diferentes: as larvas se alimentam e armazenam reservas que serão utilizadas para a metamorfose (fase pupal) e os adultos se reproduzem. No desenvolvimento hemimetábolo as fases juvenis são diferentes dos adultos somente no tamanho e pelo fato de não se reproduzirem. Quais as “vantagens”. do desenvolvimento holometábolo em relação ao hemimetábolo do ponto de vista evolutivo?'''
:

'''3. Qual a estrutura química dos hormônios envolvidos na metamorfose. Os insetos,
assim como os nematóides e outros invertebrados, são incapazes de sintetizar
colesterol. Qual(is) hormônio(s) dos insetos devem depender da ingestão
de colesterol para sua síntese?'''
:

'''4. Como os hormônios controlam as mudas (molts) de larva->larva, larva-
>pupa e pupa->adulto?'''
:

'''5. O que são pufes? Como surgem nos cromossomos da glândula salivar da larva?
Proponha um mecanismo de ação da ecdisona no nível molecular.'''
:

'''6. Qual o tamanho do genoma de drosófila? Quantos cromossomos o compõe?
Como é a determinação de sexo em drosófila?'''
:

'''7. Qual a importância dos cromossomos politênicos no estudo de drosófila? Se
eles são importantes, como voce explica o fato deles terem sido descritos em
drosófila somente em 1935, após Thomas H. Morgan (o introdutor da drosófila
como sistema para estudo de genética) ter ganho o prêmio Nobel em
1933 (pela demonstração dos cromossomos na transmissão de características
hereditárias).'''
:

'''8. Descreva e defina: aberrações cromossômicas | mutações puntuais | cromossomos
balanceadores|'''
:

'''9. Como é realizado o mapeamento por deleções em drosófila?'''
:

'''10. Qual a vantagem de se usar métodos genéticos para estudo do desenvolvimento
em relação à abordagem da embriologia experimental?'''
:

'''11. Descreva e defina: mutações de efeito materno | mutações letais | mutações
visíveis.'''
:

'''12. O que são mutações letais condicionais e como elas podem ser úteis no estudo
do desenvolvimento?'''
:

=== Lista 2 (aula 14) ===

'''1. Como ocorre a formação do padrão nos animais?'''
:
'''2. Como se pode mostrar que o produto de bicoid é fornecido pela mãe no
ovócito?'''
:

'''3. Descreva os efeitos das mutações do locus esc em drosófila.'''
:

'''4. Qual a diferença entre um segmento e um para-segmento no embrião de
drosófila? O que cada um deles origina?'''
:

'''5. Quais as diferenças entre as mutações no locus esc e no locus Notch? E as
semelhanças?'''
:

'''6. Por que mesmo estando 80% dos produtos gênicos necessários para o desenvolvimento
do embrião presentes no ovócito, essa informação não é
suficiente para montar o embrião?'''
:
'''7. Para que servem os produtos que a mãe deposita no citoplasma do ovócito?'''
:

'''8. O que são células polares e quais genes estão envolvidos na sua determinação?'''
:

'''9. Onde estão e o que são os produtos que determinam o destino das células
polares?'''
:

'''10. Descreva a formação das células da blastoderme. Elas estão isoladas umas
das outras?'''
:

'''11. Como a genética pode ajudar a definir funcionalmente a determinação das
células endodérmicas durante a gastrulação?'''
:

'''12. Como se pode manipular, através de técnicas de genética molecular, a expressão
de um gene para testar o seu papel durante a gastrulação?'''
:
=== Lista 3 (aula 16) ===

=== Lista 4 (aula 18) ===
'''1. Qual é o fenótipo geral das mutações que ocorrem nos ''"gap genes"''?'''
R: Deleção/substituição de segmentos e má formação de algumas partes do indivíduo.

'''2. ''BICOID'' controla a transcrição de ''hunchback'' zigótico. Essa afirmação possui bases experimentais no nível molecular? Quais?'''
R: Sim (...)

'''3. Quais as vantagens e desvantagens de se usar um gene "reporter" para estudar a expressão de genes durante a embriogênese de drosófila?'''
R:

'''4. Como foi determinada a região do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
R:

'''5. Como são controlados o limiar e a amplitude da resposta do promotor de ''hunchback'' a ''BICOID''?'''
R:

'''6. Como foi localizada, ''in vitro'', a posição do promotor de ''hunchback'' que interage com ''BICOID''?'''
R:

'''7. Os experimentos ''in vitro'' fornecem resultados importantes, mas possuem uma série de problemas. Quais são eles? Como eles podem ser evitados?'''
R:

'''8. Como o gradiente de ''hunchback'' é lido e quantos são os limiares de seu gradiente?'''
R:

'''9. O controle dos "gap genes" é mais complicado do que o modelo proposto, podendo haver mecanismos parcialmente redundantes de controle. Do ponto de vista de estabilidade do embrião e da seleção natural, qual o motivo desta redundância?'''
R: A redundância se deve ao fato de se querer aumentar as chances do embrião desenvolver-se de modo completo (ou de diminuir as chances de que algo saia errado), aumentando, assim, as chances de sobrevivência da espécie.

'''10. Qual a importância do método de "blue jumps" ou "enhancer traps"?'''
R:

'''11. Quais dos "gap genes" respondem ao gradiente de receptor ''torso'' ativado?'''
R: ''huckebein'' e ''tailless''. (?)

'''12. Uma mutação ''torso'' pode ser mimetizada por mutação nesses genes?'''
R: Não. (?)

'''13. Qual dos dois genes, ''twist'' ou ''snail'', está imediatamente "downstream" do morfógeno ''dorsal''? Por que?'''
R:

'''14. Qual efeito das mutações em genes do tipo "pair rule"?'''
R: Falhas na segmentação do embrião.

'''15. Os genes ''hairy'' e ''eve'' podem ter seus promotores dissecados e suas expressões dependem de uma série de outras proteínas codificadas em "gap genes", bem como ''bicoid''. Como isso explica a expressão destes genes em faixar algernadas ao longo do eixo antero-posterior do embrião, principalmente ''eve''?'''
R:

'''16. Existe uma hierarquia linear entre genes maternos que defines os gradientes do eixo antero-posterior, "gap genes" e "pair rule genes"? Justifique.'''
R:

=== Lista 5 (aula 20) ===

'''1. Qual o papel de ''engrailed e wingless''?'''
R: São os genes que determinam a polaridade dos segmentos (''engrailed'' - anterior ; ''wingless'' - posterior)

'''2. No que difere a ação da proteína codifcada em ''wingless'' daquelas codificadas nos genes que antecedem a celurazização da blastoderme?'''
R:Os genes que antecedem a celularização agem como fatores de transcrição. ''en'' e ''wg'' agem através de uma via de sinalização.

'''3. Como o gradiente da proteína codificada em ''wg'' controla a expressão de ''en''? Que gene controla a expressão de ''wg''?'''
R:''ftz'' e ''eve'' reprimem ''wg''. ''eg'' codifica uma proteína que age nos receptores ''frizzled'' mantendo a expressão de ''en''.

'''4. Como é mantido o padrão de expressão dos genes homeióticos, uma vez que sua transcrição é iniciada por genes que estão "upstream" a eles?'''
R: Os genes homeióticos se auto-regulam.

'''5. Os genes homeióticos desencadeiam a expressão dos genes chamados realizadores, responsáveis pela formação de tecidos específicos e primórdios dos órgãos. Cite os métodos (explique os princípios envolvidos) utilizados para a identificação desses genes realizadores.'''
R: Os genes homeióticos são fatores de transcrição, ou seja, as proteínas que eles codificam se ligam ao DNA pelo homeodomínio. Usando anticorpos podemos precipitar, purificar e seqüenciar as seqüencias de DNA.

'''6. O que é um homeodomínio e qual a sua função? Só proteínas codificadas em genes homeióticos possuem homeodomínios?'''
R: Homeodomínio é a região da proteína que se liga ao DNA e tem a função de fator de transcrição. Não.

'''7. Os genes homeióticos possuem introns enormes. Como isso afeta a expressão desses genes?'''
R: Eles demoram mais para serem expressos.( melhorem minha resposta)

'''8. Como somente 3 genes do complexo bitorax estabelecem a identidade do terceiro segmento toráxico e dos 10 segmentos abdominais?'''
R: As concentrações diferentes desses 3 genes fazem a diferenciação dos segmentos.

'''9. No que consiste o modelo proposto por Lewis para explicar a ação do complexo bitórax?'''
R: Lewis acreditava que a ação do complexo era controlada por diversos (10) genes diferentes, enquanto que na verdade são apenas 3.

'''10. Tendo em vista os resultados no nível molecular sobre o complexo bitórax, como fica o conceito clássico de gene?'''
R: Fica obsoleto, ultrapassado, fora de moda, véio, ruim .

Xjump

2006-11-27T22:08:57Z

Sonic Orochi: /* Temas */

xjump. Pronuncia-se "ékis djãmpi". "x" vem do fato de que o bonequinho que você controla se parece, realmente, com uma letra X. "jump" porque, sim, ele pula.

== O que é ==
[[Image:xjump.png|thumb|Screenshot do jogo "xjump"]]

Imagine-se em uma torre de paredes de blocos azuis com um número de andares em blocos vermelhos infinito. Vista uma calça verde colada (vide [[Saulo]]) e um suéter vermelho (também colado). Agora corte seu cabelo estilo trote pós-vestibular-bem-sucedido.

De repente, a torre começa a desmoronar (ou o chão a subir? Ou os andares a afundar? Tudo depende da sua imaginação...) Qual a primeira coisa que lhe parece viável e plausível a se fazer? Você olha o nome do jogo e diz: '''PULAR'''! E não é só '''"pular"''', é '''"pular"''' de maneira doentia: vale girar o corpo, rodopiar, cair de cabeça para baixo, bater na parede... e tudo isso em um ritmo cada vez mais rápido e frenético.

Então começa sua jornada... rumo ao topo!

== Comandos ==

Não são nada complexos. Se você tiver problema em alcançar 50 andares, [[suicide is your only option]].

*Seta para Esquerda: move o boneco para a esquerda.
*Seta para Direita: move o boneco para a (tantantan!) direita.
*Seta para Cima: move o boneco para cima? Não... simplesmente faz ele '''PULAR'''.
**Muitos jogadores do top score deixam esta tecla pressionada e conseguem scores espetaculares como 1862.
*Seta para Baixo: mata, aleatoriamente, um motoboy em São Paulo.
*Shift+Q: sai do jogo

É possível redefinir as teclas usando a opção ''-keymap arquivo'', mas até agora o formato do ''arquivo'' permanece desconhecido.

[[Image:xjump_jnb3.png|thumb|left|Tema baseado em '''[[jump'n'bump]]''']]

== Temas ==
O ''xjump'' foi revolucionado após a descoberta de que é possível implementar temas personalizados pelo usuário. Para isso, é necessário criar um arquivo '''xpm''' adequado e rodar
xjump -graphic arquivo.xpm
Por exemplo, à esquerda pode-se ver um dos temas mais populares, o '''jnb3''', baseado no [[jumpnbump|Jump & bump]]. Os arquivos podem ser encontrados em ''/home/vitor/xj'' e em ''/home/cmarin/xjump'', com temas variando desde '''Ice Climbers''' até '''Sonic''' e '''Mario'''!

Arquivos '''xpm''' podem ser editados usando o [[gimp]], apesar de não ser uma tarefa muito simples.

== Estratégia ==

À primeira vista, o jogo parece não ter '''atrito''', isso se deve à composição quasi-cristalina dos andares. Isso lhes confere uma superfície mais "lisa" do que o teflon.

Acostumando-se com esse pequeno deslize (com o perdão do drogadilho - vide [[Rafael]]) físico, você terá de pular para o próximo andar.

Iniciantes ([[newbies]]) vão andar, parar, pular, tentar controlar o pulo, e cair.

Experts ([[pros]]) se utilizam de técnicas que consistem, basicamente, em correr um pouco e pular, alcançando assim cerca de 2 a 4 andares de altura. Deve-se masterizar esta técnica para não cair na agonia do [[suicide is your only option]].

== Rating ==

Gráficos: 2/10

Jogabilidade: 3/10

Replay Ability: 11/10

Diversão: 10/10 - independe se você tem coordenação motora ou não (ver o caso do [[Fena]] que tem a pontuação de 510).

== Curiosidades ==

*Felipe da [[T15]] disse que viria para o CM, mesmo após deixar o curso, exclusivamente para jogar xjump. Não se sabe se realmente vai cumprir o que disse.

*Daniel, também da [[T15]], foi o pioneiro de sua turma a descobrir este jogo. Conseguindo scores cada vez maiores, incentivou os outros a jogar e, com isso, melhorou a média da pontuação do top 20. O menor score atual é de 206. O antigo era de cerca de 50.

== Hall da Fama ==

Os grandes Mestres do xjump [[ceeceêmico]]. Atualizado em 19:52, 17 Novembro 2006 (BRT)

# 1865 [[Saulo Henrique Pires de Oliveira]] ([[T15]])
# 1862 [[Gustavo T F]] ([[T10]])
# 1322 [[Vitor Eiji Justus Sakaguti]] ([[T14]])
# 1034 [[Rafael Fuess Nishimura]] ([[T16]])
# 980 [[Yul Otani]] ([[T14]])
# 734 [[Vitor Ferreira Onuchic]] ([[T16]])
# 698 [[Lucas]] ([[T12]])
# 558 [[Renato Mendes Coutinho]] ([[T14]])
# 510 [[Renato Schattan Pereira Coelho]] ([[T15]])
# 452 [[Rafael Prado Proenca]] ([[T15]])
# 429 [[Felipe Augusto Nunes Ferraz]] ([[T15]])
# 372 [[fernando henry meirelles]] ([[T15]])
# 356 [[Rodrigo Roque Dias]] ([[T12]])
# 348 [[William Seiti Mizuta]] ([[T16]])
# 347 [[Thiago Augusto Miranda Delatorre]] ([[T12]])
# 326 [[Daniel Rodrigo Issamu Miyashiro]] ([[T15]])
# 294 [[Guilherme Dias Simões]] ([[T16]])
# 291 [[Alex Kunze Susemihl]] ([[T14]])
# 273 [[Lucas Antunes Maciel Mussnich]] ([[T16]])
# 270 [[Joao Oscar M S O]] ([[T12]])

== Ver também ==

* [[Diversões do CM]]
* [[Frozen Bubble]]

[[Categoria: Diversões do CM]]

Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis

2006-11-25T18:20:36Z

Sonic Orochi: esforço inútil do Ronaldo-like

{| border="1"
|+ '''Maternal Anteroposterior Axis'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''dicephalic'' (dic) || Maternal || Abnormal position of nurse cells relative to oocyte || || Contributes to anteroposterior polarity of nurse cell oocyte complex
|-
| ''gurken'' (grk) || Oocyte || Eggs ventralized with dorsal appendages reduced or missing || Similar to vertebrate transforming growth factor alpha (TGF-α), ligand for torpedo || Establishes first posterior and then dorsal identity of ovarian follicle cells
|-
| ''spindle'' (spn) (several loci) || Maternal germ line || Disturbed anteroposterior polarity of oocyte || || Determination of prospective oocyte among cystocytes
|-
| ''torpedo'' (trp) || Ovarian follicle cells || Similar to ''grk'' || Receptor tyrosine kinase, receptor for ''grk'' || Same as ''grk''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Anterior Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''bicoid'' (bcd) || mRNA transcribed in nurse cells and transported to anterior of oocyte. Translated during cleavage. Protein forms anteroposterior gradient. || Head and thorax replaced with mirror image of telson || Transcriptional regulator (homeodomain and paired repeat) || Activates ''hb'' transcription; acts as a morphogen on embryonic genes; expressed anteriorly
|-
| ''exuperantia'' (exu) || Testis and ovary || Reducion of head; defective gastrulation || RNA-binding protein || Needed to transport ''bcd'' mRNA from nurse cells to oocyte
|-
| ''hunchback'' (hb) || See '''Zygotic Anteroposterior Gap Class'''
|-
| ''staufen'' (stau) || Maternal germ line, emryonic central nervous system || Most abdominal segments missing, no pole cells, also head defects || Double-stranded RNA-binding protein || Required for ''bicoid'' mRNA localization and polar granule assembly
|-
| ''swallow'' (swa) || Maternal germ line || Reduction of head; cellularization defects || Rna-binding protein || Required for localization of ''bcd'' mRNA
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Posterior Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''cappuccino'' (capu) || Maternal || Abdominal segments A2-A7 missing; no pole cells || Putative transmembrane receptor || Required for polar granule assembly
|-
| ''nanos'' || Transcription in oocyte and nurse cells. Partial localization to polar granules. Only this localized mRNA is translated. || Absence of abdomen; pole cells normal || RNA-binding protein, translational repressor || Inhibits translation of maternal ''hb'' mRNA and hastens its destruction, hence allows activation of ''kni'' in posterior.
|-
| ''oskar'' (osk) || Maternal germ line || Similar to ''capu'' || || Required for polar granule assembly, localizes ''nos'' mRNA
|-
| '' pumilio'' (pum) || Transcription maternal. Protein probably localized to posterior || Most of abdomen missing; pole cells normal || RNA-binding protein || Recruits ''nos'' protein to ''hb'' mRNA
|-
| ''spire'' (spir) || Maternal || Similar to ''capu'' || Actin-binding protein || Required for polar granule assembly
|-
| ''staufen'' (stau) || See maternal anterior system
|-
| ''tudor'' (tud) || Male and female germ line || Similar to ''capu'' || || Required for pole cell formation
|-
| ''vasa'' (vas) || Transcription in nurse cells and oocyte; mRNA uniform in early embryo. Protein localized in posterior of oocyte, egg, and in pole cells. || Similar to ''capu'' || RNA helicase || Required for pole cell formation
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Terminal Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''NTF-1'' || || || Transcriptional inhibitor || Inhibits transcription of ''hkb'' and ''tll''
|-
| ''torso'' (tor) || Transcription in nurse cells. Transport to oocyte, where protein distributed uniformly in plasma membrane. || Absence of labrum, reduction of head skeleton, absence of A8 and telson; gain of function; suppression of segmentation in thorax and abdomen || Tyrosine kinase receptor, likely receptor for active ''trunk'' protein || Activates ''tll'' ''hkb'' by inhibiting ''NTF-1''
|-
| ''torsolike'' (tsl) || Protein secreted by anterior and posterior ovarian follicle cells probably associates with vitelline envelope near egg poles || Similar to ''tolr'' (loss of funct'''i'''on only) || Modifying protein || Generates active form of ''trunk'' near egg poles
|-
| ''Trunk'' (trk) || Maternal mRNA translated in early embryo, protein released into preivitelline space || Similar to ''tor'' || Secreted protein || Probably ligand of ''tor'', after processing by ''tsl''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Anteroposterior Gap Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''empty spiracles'' || Transcription during blastoderm 78-67% EL; later, in cells forming tracheal pits and spiracles || Defects in antennal segment, tracheal system || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies procephalic segments
|-
| ''giant'' (gt) || Initial transcription at preblastoderm stage 82-60% and 33-0% EL; changes later || Defects in or absence of labrum, labium, and abdominal segments || Transcriptional regulator (Leucine zipper) || Activates ''Scr''; represses ''Kr''
|-
| ''huckebein'' (hkb) || Anterior and posterior ends of blastoderm || Defects in terminal body structures and gut || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Specifies terminal structures in concert with ''tll''
|-
| ''hunchback'' (hb) || Maternal mRNA initially uniform; protein forms anteroposterior gradient. Embryonic transcription 100-50% EL and 20-10% EL. Posterior domain long-lasting. || Embryonic: deletion of labium, thorax, aA7/pA8 (PS 13). No pure maternal effect, but if mother and sperm are ''hb''-, then deletion of all mouthparts and thoracic segments and A1-A3, with mirror duplication of abdomen. || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Represses ''kni''; represses ''Kr'' at high level and activates at low level; regulates ''eve''; regulates ''h'', ''run'', ''ftz''; activates ''Antp'' (with ''ftz''); represses ''Ubx''
|-
| ''knirps'' (kni) || Transcription starts at preblastoderm stage forming zone 45-30% EL. Ventral patch and narrow ring form in atnerior by cellular blastoderm stage. || Replacement of A1-A7 by single A-type segment || Transcriptional regulator (zinc finguer) || Represses ''Kr''; regulates ''h'', ''run'', ''eve'', ''ftz''; represses ''Abd-B'' and ''Antp''
|-
| ''Krüppel'' (Kr) || Transcription starts at preblastoderm stage in central zone, eventually expanding to 60-30% EL. Later also posterior patch and patch in head. || Purely embryonic. Head normal, deletion of thorax and A1-A5. Duplicated inverted A6. || Trancriptional regulator (zinc finguer) || Activates ''kni''; represses ''gt''; regulates ''eve''; regulates ''h'', ''run'', ''ftz''; represses ''Scr''; activates ''Antp''; represses ''Abd-B''
|-
| ''orthodenticle'' (otd) || Narrow band (75-92% EL) in anterior blastoderm || Defects in eyes and anterior head parts || Transcriptional regulator (homeodomain, paired domain) || Activated by ''bcd'' and ''tor'', ''otd'' - along with ''ems'' - specifies procephalic segments
|-
| ''tailless'' (tll) || Transcription in termini of preblastoderm embryo || Head skeleton reduced but labrum present. Hindgut, Malpighian tubules absent. || Transcriptional regulator (steroid receptor family) || Activates ''hb''; represses ''Kr''; represses ''kni''; activates ''h''
|-
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Pair-Rule Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''even-skipped'' (eve) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes corresponding to parasegments 1, 3, 5, etc., by cellularization stage. Fades during gastrulation. || Abolishes segmentation, giving lawn of denticles. Weak alleles delete odd parasegments. || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''ftz'', ''odd'', ''run''; activates itself; activates ''en''; represses ''wg''; activates ''Dfd''
|-
| ''fushi tarazu'' (ftz) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes corresponding to parasegments 2, 4, 6, etc., by cellularization. Fades during germ band extension. || Deletes even parasegments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates itself; activates ''en''; activates ''Antp''; activates ''Ubx''; represses ''wg''
|-
| ''hairy'' (h) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes + dorsal head patch by time of cellularization. Fades during gastrulation. || Range from deletion of odd parasegments to formation of lawn of denticles. Also loss of labral tooth. Other alleles give extra hairs in adult. || Transcriptional regulator (helix-loop-helix domain) || Represses ''run'', ''ftz''; activates ''eve''
|-
| ''paired'' (prd) || Transcription starts at preblastoderm stage; 8 stripes with dorsal head patch by cellularization. During germ band extension stripes 2-7 split and then fade. || Deletions about 1 segment wide starting in middle of denticle band affecting mainly odd abdominal segments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates ''wg'', ''en''
|-
| ''runt'' (run) || Transcription starts at preblastoderm stage; 7 stripes. After cellularization, patter becomes single-segment stripes, which persist through germ band extension. || Deletions more than 1 segment wide centered on T2, A1, A3, A5, A7, with mirror duplication of what is left || Transcriptional regulator (novel) || Represses ''h'', ''eve''; activates ''ftz''
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Segment Polarity Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''engrailed'' (en) || Transcription starts at blastoderm stage and produces 14 narrow stripes by extended germ band stage, marking the anterior of each parasegment. Expression in posterior compartments of larval imaginal discs || Ventral cuticle a continuous lawn of denticles. Less severe alleles delete even-numbered parasegments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Maintains ''hh'' and indirectly ''wg'' activity; selector gene defining posterior compartment
|-
| ''frizzled'' (fz) || Various imaginal discs || Variable orientation of wing hairs, irregular ommatidia in eye || Seven-pass transmembrane receptor || Receptor for ''wg''
|-
| ''frizzled-2'' (fz-2) || Apparently redundant with ''fz''
|-
| ''hedgehog'' (hh) || Posterior compartments of larval segments and imaginal discs || Posterior compartment replaced with mirror image of anterior compartment || Secreted sinaling molecule (TGF-β super family) || Maintains ''wg'' and indirectly ''en''. defines source of segmental morphogen
|-
| ''patched'' (ptc) || In anterior compartments || Defects in segmentation and eye development || Multipass transmembrane protein || Parto of the receptor complex for ''hh''
|-
| ''smoothened'' (smo) || In anterior compartments || Defects in various tissues including epidermis, wing, and eye || G protein-associated transmembrane receptor || Part of the receptor complex for ''hh''; causes segregation of posterior from anterior compartmente cells
|-
| ''wingless'' (wg) || Transcription starts at blastoderm stage and produces 14 narrow stripes by extended germ band stage, marking the posterior of each parasegment. || Ventral cuticle a continuous lawn of denticles, indicating deletion of 3/4 of each segmental unit || Secreted signaling molecule (''Wnt'' family) || Maintains ''en''
|}

{| border="1"
|+ '''Homeotic Genes and Related Genes'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''abdominal A'' (abd-A) || Trancribed in PS 7-13 of extended germ band || Transforms PS 7-9 to PS 6 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Ubx''; activates ''wg'', ''dpp''; specifies a.p. body pattern
|-
| ''Abdominal B'' (Abd-B) || Transcribed in PS 10-14 of extended germ band || Transforms PS 10-14 to PS 9 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Ubx''; specifies a.p. body pattern
|-
| ''Antennapedia'' (Antp) || Transcription starts in blastoderm; mainly PS 4, also in posterior parasegments. Thoracic imaginal discs. || Transforms PS4, 5 to PS 3 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''Deformed'' (Dfd) || Transcription in preblastoderm stage in PS 1; later also PS 0. Eye-antennal disc. || Deletion of mandibular and maxillary segments || Transcriptional regulator (homeodomain) || Activates itself; specifies a.p. body pattern
|-
| ''labial'' (lab) || Transcription in extended germ band anterior to cephalic furrow and in posterior midgut || Deletes labial derivatives || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''Polycomb-group'' (Pc-G) || || Multiple homeotic transformations || || Maintains inhibition of inactive homeotic genes
|-
| ''Sex combs reduced'' (Scr) || Transcription in PS 2 in blastoderm; later PS 3 epidermis and mesoderm, and abdominal ganglia || Transforms PS3 to PS 4 and PS2 to PS1 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Specifies a.p. body pattern
|-
| ''trithorax-group'' (trx-G) || || Multiple homeotic transformations || || Maintains inhibition of active homeotic genes
|-
| ''Ultrabithorax'' (Ubx) || Transcrition starts in cellular blastoderm, mainly in PS 6, but at lower levels in PS5-13; more in even-numbered parasegments. Neuromeres; metathoracic discs. || Transforms PS 5, 6 to PS 4 || Transcriptional regulator (homeodomain) || Represses ''Scr''; represses ''Antp''; activates itself; activates ''wg'', ''dpp''; selector gene
|}

{| border="1"
|+ '''Maternal Dorsoventral System'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| '' cactus'' (cac) || Maternal; action in embryo || Ventralizing || Genetic regulator || Inhibits entry of ''dl'' protein to nuclei
|-
| ''dorsal'' (dl) || Transcription in nurse cells; uniform mRNA in oocyte and egg; ventral-dorsal gradient of protein in preblastoderm nuclei || Embryos become tubes of dorsal epidermis. Some haploinsufficient alleles. || Genetic regulator || Activates ''twi'', ''sna''; represses ''zen'', ''dpp''; morphogen for dorsoventral pattern
|-
| ''easter'' (ea) || Maternal, released from embryo into preivitelline space || Similar to ''dl''. Also weak ventralizing gain-of-function alleles. || Serine proteases || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''gastrulation defective'' (gd) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || Serine protease || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''gurken'' (grk) || Maternal; needed in oocyte || Ventralizing; affects eggshell and embryo || Growth factor-like || Ligand for top protein; dorsalizing signal from oocyte
|-
| ''nudel'' (ndl) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Protease activity || Contributes to ventral polarizing activity
|-
| ''pelle'' (pll) || Maternal, acts in embryo || Similar to ''dl'' || Protein kinase || Signal transduction from ''Tl'' to ''cac''
|-
| ''pipe'' (pip) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Glycosaminoglycan-modifying enzyme || Localized contribution to ventral polarizing activity
|-
| ''snake'' (snk) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || Serine protease || Activation of ''spz'' (''Tl'' ligand)
|-
| ''spätzle'' (spz) || Maternal, released from embryo into perivitelline space || Similar to ''dl'' || || Ligand for ''Tl'' protein
|-
| ''Toll'' (Tl) || Maternal; uniform distribution of protein in egg plasma membrane || Similar to ''dl''. Gain-of-function alleles ventralize, producing denticle belts all around. || Receptor tyrosine kinase || Activated ventrally by ''spz''; releases ''dl'' from ''cac'', permits ''dl'' to enter nucleus
|-
| ''torpedo'' (top) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''grk'' || Growth factor receptor || Receptor for ''grk'', inhibits ''pip'', thus orienting ventral polarizing activity.
|-
| ''tube'' (tube) || Maternal; acts in embryo || Similar to ''dl'' || Adapter protein || Signal transduction from ''Tl'' to ''cac''
|-
| ''windbeutel'' (wbl) || Maternal; needed in follicle cells || Similar to ''dl'' || Enzyme associated with endoplasmic reticulum || Contributes to ventral polarizing activity.
|}

{| border="1"
|+ '''Zygotic Dorsoventral Class'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''decapentaplegic'' (dpp) || Transcription in preblastoderm on dorsal side, curling around to ventral at poles. (see also '''Compartment-Related Genes''') || Loss of amnioserosa and reduction of dorsal epidermis. Viable alleles produce multiple defects in imaginal disc derivatives. || Signaling molecule (TGF-β homologue) || Forms morphogen gradient with maximum dorsally. Promotes amnioserosa and epidermis; inhibits neurogenesis
|-
| ''short gastrulation'' (sog) || Protein synthesized blastoderm cells in ventral || Dorsalizes embryo || Plasma membrane protein || '''antagonizes''' ''dpp''; specifies d.v. pattern
|-
| ''snail'' (sna) || Transcription in mid-ventral strip of prospective mesoderm || Loss of mesoderm || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Inhibits expression of other d.v. patterning genes in prospective mesoderm.
|-
| ''tolloid'' (tld) || Released from blastoderm cells into extracellular space || Ventralizes embryo || Metalloprotease || Cleaves extracellular domain of ''sog'', especially in presence of ''dpp''; specifies d.v. pattern
|-
| ''twist'' (twi) || Transcription in mid-ventral strip of prospective mesoderm and mesectoderm || Loss of mesoderm || Transcriptional regulator (basic helix-loop-helix domain) || Specifies dorsoventral pattern
|-
| ''zerknüllt'' (zen) || Transcription in preblastoderm stage on dorsal side || Loss of amnioserosa and optic lobe || Transcriptional regulator (homeodomain) || Promotes amnioserosa formation
|}

{| border="1"
|+ '''Compartment-Related and Other Genes'''
|-
! Gene !! Expression Pattern !! Mutant Phenotype !! Molecular Nature !! Developmental Function
|-
| ''Achaete'' (Ac) || Proneural cells, prospective sensory bristles || Lack of sensory bristles and neurons || Transcriptional regulator (bHLH domain) || Many functions, incl. patterning around d.v. compartment boundary in wing
|-
| ''apterous'' (ap) || Dorsal compartments of wing and haltere discs || Wings and halteres missing || Transcriptional regulator (homeodomain) || Required for wing (haltere) outgrowth; selector gene
|-
| ''cubitus interruptus'' (ci) || Anterior compartment of each segment || Disturbed segmentation || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Activates ''wg'' and ''dpp'' in response to ''hh'' signaling
|-
| ''decapentaplegic'' (dpp) || In strip of cells anterior to a.p. compartment boundary (see also '''Zygotic Dorsoventral Class''') || Abnormal wing patterns || Secreted protein (TGF-β superfamily) || Morphogen for anteroposterior pattern of wing and haltere
|-
| ''Distalless'' (Dll) || Expressed around leg dorsoventral compartment boundary || Loss of legs and antennae || Transcriptional regulator (homeodomain) || Required for outgrowth of legs and antennae
|-
| ''fringe'' (fng) || Dorsal wing and haltere compartments || Loss of wings and halteres || Secreted protein || Juxtaposition of cells with and without ''fringe'' activates ''wg+''
|-
| ''hedgehog'' (hh) || see '''Zygotic Segment Polarity Class'''
|-
| ''optomotor-blind'' (omb) || Prospective CNS and epidermal regions || || Transcriptional regulator || Target of ''dpp'' in patterning of wing and abdominal segments
|-
| ''scute'' (sc) || Similar to ''Achaete''
|-
| ''spalt'' (sal) || In endoderm and parts of wing imaginal disc || || Transcriptional regulator (zinc finger domain) || Target of ''dpp'' in wing patterning
|-
| ''vestigial'' (vg) || In prospective appendages of wing and haltere imaginal discs || Loss of wings and halteres || Putative transcriptional regulator || Specification of wing and haltere as opposed to thorax
|}

== Ver também ==
* [[Biologia III]]
* [[Carlos Eduardo Winter]]
* [[Projeto Biologia do Desenvolvimento]]

[[Categoria: Projetos da Wikoleculares]]

Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis

2006-11-24T20:49:27Z

Sonic Orochi: blaah

Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis

2006-11-24T20:24:49Z

Sonic Orochi:

Usuário Discussão:Sonic Orochi

2006-11-24T19:53:26Z

Sonic Orochi:

aff.. zuar conta de windows é que foi de bicha. --[[Usuário:Sonic Orochi|Sonic Orochi]] 17:53, 24 Novembro 2006 (BRST)

Usuário:Sonic Orochi

2006-11-24T19:53:01Z

Sonic Orochi:

Genes controlling pattern formation in Drosophila embryogenesis

2006-11-24T19:51:44Z

Sonic Orochi: blah

Usuário:Sonic Orochi

2006-11-24T18:36:13Z

Sonic Orochi:

Mas é uma bixinha mesmo.

----

Espero que tenha se divertido, gargalhado e atingido um orgasmo com esse comentário extremamente [[Ironia|construtivo, interessante e inteligente]]. ;) Ademais... [[LOL]].--[[Usuário:Sonic Orochi|Sonic Orochi]] 22:03, 26 Agosto 2006 (BRT)

----

E acrescento ainda que eu sou uma bicha escrota, filha da puta e sem graça. [[Usuário:Sonic Orochi|Sonic Orochi]] 16:36, 24 Novembro 2006 (BRST)

Pior aula de todos os tempos

2006-11-23T14:38:14Z

Sonic Orochi:

A '''pior aula de todos os tempos''', como foi chamada pela [[T15]], foi uma aula do curso de [[Computação II]] dada pelo professor [[Alair]]. Ele havia trazido seu monitor, o Gustavo, para que explicasse o novo [[EP]] à sala, e pediu para que a sala fizesse perguntas, às quais o monitor respondeu adequadamente. O Alair, no entanto, provavelmente exaltado pela oportunidade de mostrar a um discípulo seu como dar uma boa aula, se empolgou fazendo mil comentários óbvios e piadas bem piores que as do [[Rafael (T15)|Rafael]], das quais a classe ria de tão catastrófica a situação (por exemplo, quando apresentou o [[Gustavo Akio Tominaga Sacomoto|Gustavo]] aluno ao Gustavo monitor - ''"Gustavo, Gustavo e Gustavo, Gustavo. Huuuuuup!"'').

Após a saída do monitor, na segunda parte de aula, o Alair caçou pelo [[Favo 22]] os alunos que tentaram escapar da terrível experiência, e deu um sermão que foi a '''apoteose da pior aula de todos os tempos'''. No tal discurso o professor soltou a frase que iria parar nas citações do [[Guia dos Bixos 2006]]:

''"Por causa da irresponsabilidade dele ''(o monitor)'', que não compareceu na quinta-feira para falar comigo para discutir o EP, agora, desculpe a expressão, tomou um CÁ-GÁÇO na frente de vocês."

E seu discurso continuou, para a desgraça de todos, indevida e inapropriadamente, passando por um sermão sobre responsabilidade, citando o caso da [[Mayana Zats]], que havia defendido as pesquisas com células-tronco baseando-se nas pesquisas do coreano Hwang Woo-Suk, que foram consideradas fraudulentas, e dizendo:

''"Por causa da irresponsabilidade de vocês, milhões irão sofrer! MILHÕES!"''

E por estes motivos foi considerada a pior aula de todos os tempos. Felizmente ela foi perdida por diversos membros da [[T15]] que, afortunadamente, faltaram no tal dia.

[[Categoria: T15]]

Procrastinação

2006-11-23T14:31:09Z

Sonic Orochi: /* Coletividade */

'''Procrastinação''' é uma palavra importantíssima que todo [[moleculento]] deve conhecer e refere-se ao ato de se evitar, enrolar e adiar o que se tem a intenção de fazer. Vem do Latim, da união das palavras ''pro'' e ''crastinus'' (crástino, de amanhã), significando originalmente "deixar para amanhã".

O reconhecimento da própria capacidade de procrastinação é essencial no processo de auto-conhecimento, nunca a subestime.

As atitudes em relação a procrastinação variam bastante, alguns a aceitam deliberadamente enquanto outros sentem-se [[Suicídio|culpados, inúteis e tristes]]. Aprender a lidar com a procrastinação como um aspecto natural e legítimo da vida acadêmica pode ser considerado um sinal de maturidade.

== Citações ==

* "Amanhã eu paro de procrastinar."

== Grandes geradores de procrastinação ==

* [[Relatório]]s (de todo tipo)
* Monografias (de todo tipo)
* Listas (de todo tipo)

== Fontes de procrastinação ==

* Contas de e-mail
* [[PhD Comics]]
* A [[Wikoleculares]]!
* [[xjump]]
* A [[Wikipedia]]
* A [[Uncyclopedia]]
* [[Coisas aleatórias da Internet]]
=== Coletividade ===
Procrastinar é uma atividade que pode ser praticada em grupos de qualquer tamanho. Algumas fontes de vortex de procrastinação:

* [[Tron | Armagetron]]
* [[Jump'n'bump]]
* [[DotA | Warcraft]]

== Links ==

* [http://en.wikipedia.org/wiki/Procrastination Artigo da Wikipedia sobre procrastinação]
* [http://uncyclopedia.org/wiki/Procrastination Artigo da Uncyclopedia sobre procrastinação]

Procrastinação

2006-11-23T14:30:36Z

Sonic Orochi: /* Coletividade */

'''Procrastinação''' é uma palavra importantíssima que todo [[moleculento]] deve conhecer e refere-se ao ato de se evitar, enrolar e adiar o que se tem a intenção de fazer. Vem do Latim, da união das palavras ''pro'' e ''crastinus'' (crástino, de amanhã), significando originalmente "deixar para amanhã".

O reconhecimento da própria capacidade de procrastinação é essencial no processo de auto-conhecimento, nunca a subestime.

As atitudes em relação a procrastinação variam bastante, alguns a aceitam deliberadamente enquanto outros sentem-se [[Suicídio|culpados, inúteis e tristes]]. Aprender a lidar com a procrastinação como um aspecto natural e legítimo da vida acadêmica pode ser considerado um sinal de maturidade.

== Citações ==

* "Amanhã eu paro de procrastinar."

== Grandes geradores de procrastinação ==

* [[Relatório]]s (de todo tipo)
* Monografias (de todo tipo)
* Listas (de todo tipo)

== Fontes de procrastinação ==

* Contas de e-mail
* [[PhD Comics]]
* A [[Wikoleculares]]!
* [[xjump]]
* A [[Wikipedia]]
* A [[Uncyclopedia]]
* [[Coisas aleatórias da Internet]]
=== Coletividade ===
Procrastinar é uma atividade que pode ser praticada em grupos de qualquer tamanho. Algumas fontes de vortex de procrastinação:

* [[Armagetron]]
* [[Jump'n'bump]]
* [[DotA | Warcraft]]

== Links ==

* [http://en.wikipedia.org/wiki/Procrastination Artigo da Wikipedia sobre procrastinação]
* [http://uncyclopedia.org/wiki/Procrastination Artigo da Uncyclopedia sobre procrastinação]

Yul Otani

2006-11-23T14:28:39Z

Sonic Orochi: /* Citações */

{{Usuário|Otaniyul}}

== Descrição curta ==

Japa safado, embora certas pessoas confundam-no com um pólipo.

== Curriculum ==

*Colégio Poliedro => [[Faculdade de Ciências Farmacêuticas]] => [[Turma 14]].
*fiel exercedor da [[2ª lei de Mendes]].
*um dos [[Japoneses safados do CM]].
*um dos funda-dores do [[CAGOCM]].
*Amante do bom esporte beisebol e [[Softbol|soft-misto]], não liga para o preconceito (pfff =P).
*discípulo exemplar do [[Mendes]] na [[arte de dormir sentado]].
*sempre aberto a desafios de [[Pawapuro]].

== [[Ciclo Básico]] ==

Meu Ciclo Básico foi mais ou menos assim:

*"ah... santa aula... interes...san.....t..zzzzz" ''(momentos de paz)''
*"Pqp, essas porras não comutam?"
*"Porra, não vou integrar _ISSO_!"
*"Ah não, não sei, NÃO SEI, PORRA!" ''(momentos de raiva)''
*"Caralho, semana longa da merda!" ''(momentos de ansiedade)''
*"Adiar a prova? Que diferença faz? Tá tudo fudido msm..." ''(toques de realidade)''
*"Eita... fui mal..." ''(momentos de tristeza)''
*"Eita... fui mal... e daí?" ''(momentos de conformismo)''
*"Esse fds vou estudar!" ''(momentos de alucinação)''

== [[Ciclo Ácido]] ==

'''Planejamento e execução de experiências com o Sistema RIBRAS (Radioactive Ion Beams Brasil)''' sob orientação da professora [[Alinka Lépine-Szily]]. (Andamento: parado! hehehe)

Disciplinas:
*Primeiro semestre:
**FMA5701 - Mecânica Quântica I (6cr ''(12cr)'')
**MAP0327 - Mecânica Analítica Clássica (4cr)
**FMA0204 - Física Matemática I (6cr)
**FNC0313 - Física Experimental V (4cr)

*Segundo semestre:
**FMA5702 - Mecânica Quântica II (6cr ''(12cr)'')
**FMA0307 - Física Matemática II (4cr)
**FAP0214 - Física Experimental IV (4cr)

*Terceiro semestre:
**FMA0303 - Eletromagnetismo I (6cr)
**FMT0401 - Introdução à Mecânica Estatística (4cr)
**PSI2401 - Conceitos de Eletrônica (4cr)
**PSI2403 - Eletrônica Experimental (4cr)

*Quarto semestre:
**FMA0304 - Eletromagnetismo II (4cr)
**FMT0308 - Termodinâmica (4cr)
**FNC0404 - Introdução à Física Nuclear (4cr)
**FNC0315 - Introdução à Física Atômica e Molecular (4cr)
**FEP0263 - Prática de Tratamento de Dados em Física Experimental (3cr)

== Filosofias de vida ==
Entre outras:

:''"It's so, yes?" Tsuda said, which was an even more conventional remark, applicable to virtually any situation, and meaning variously, Yes, No, Maybe, I agree, I disagree, I don't know what you're talking about, You have my sympathy, Please continue, Please stop... Tone was important in setting the meaning; so, since he was unsure of what Makoto meant in the first place, Tsuda made his as vague as he could in order to obscure his own meaning, which in fact he did not have at all.''

Matsuoka Takashi, Autumn Bridge

== Atuação no wiki ==
*Criar páginas de [[Matemática IV|conteúdo nulo]] só para desaparecerem do [[Especial:Wantedpages|Wantedpages]].
*Somente quando tenho listas etc a fazer (procrastinação).

== Citações ==
* "CARALHO!" - imediatamente após o professor [[Tal]] mostrar um teorema surpreendente '''em aula'''.
* "Por exempro" - numa lista de exercícios.
* "Control alt backspace!" - vide contexto [[Thiago Garcia dos Santos | aqui]].

== RECLAMAÇÕES ALEATÓRIAS ==
Bom, a motivação master dessa seção aqui é o wikoleculento [[Usu%C3%A1rio:Rend|Rend]] e também o fato de que eu realmente gosto de reclamar e fazer drama. Aliás o que eu escrever aqui não tem [[embasamento]] nenhum ou muito menos uma razão de serem escritas, mas nas palavras do [[Vitor (T14)|mestre do tomar no cu]], ''que eu sou doente e precisava falar''.

===Notação===
Malditos sejam os inventores do alfabeto e os famosos criadores de notação, tanta letra disponível em tantos alfabetos mas tudo com circunflexo vira versor e/ou operador e quando entra 3-d a cabeça dá voltas e vc apela pros risquinhos duplos do estilo vetorial... Sem contar que muita coisa é representada pela mesma letra e eu idiota começarei a declarar variáveis nas listas de agora em diante.

===Jubilamentos e a pressa===
Isso pra mim é idéia ultrapassada e de tom elitista. Refer to [[Discurso do Gustavo]].

===Listas===
ó eu odeio mas até que gosto! [[Filme do Batiman|como pode uma porra dessa]]?

[[Categoria: T14]]
[[Categoria: Alunos do CM]]